| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 132 (0.420) | 306 (0.530) | 53/248 | 1.8 | 82.3% | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– |
| ? | AssemblyC74_contig_52 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150 | |||||
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATCTT > AssemblyC74_contig_52/1‑134 ctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTATTGATGAAAGGATAGACAATCAATCATAAATCAG > 1:3402293/3‑135 tGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATAGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGT < 1:779094/134‑1 GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTT > 2:3110096/1‑135 GTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTA < 1:2323354/135‑1 GTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTA < 1:1675568/135‑1 ATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGA > 2:592127/1‑135 TTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAA < 1:2148009/135‑1 TCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTA > 1:3891555/1‑135 TTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAAT < 2:1315754/135‑1 TTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAAT < 2:3187357/135‑1 TTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAAT < 1:1987409/135‑1 TTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAAT > 1:2881780/1‑135 TTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAAT < 1:592127/135‑1 TCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAG > 2:1381029/1‑90 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGT > 1:1473561/1‑134 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAG < 1:1341261/119‑1 AGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCC < 2:94014/135‑1 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC < 1:1414787/135‑1 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC < 2:2369226/135‑1 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC < 1:3110096/135‑1 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC < 2:640393/135‑1 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC < 2:170518/135‑1 GTCGACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC < 1:3654734/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAA > 1:2248540/1‑135 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAA > 2:16264/1‑135 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGG > 1:1541158/1‑133 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCACAAATGG > 1:2050222/1‑133 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGAT < 1:8281/80‑1 TTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACT > 2:1292778/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTCGAGTCACGTTAGCGTTAAAGATGAAAGGTTATACAATCAATCATAAAACCGTTAGAAAATTAATGTCCCTAGTGGGACTg > 2:1175921/1‑132 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTATTGTCCCAAATGGGACTT > 2:3398720/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTAC > 1:3234819/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:56727/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:945538/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:892606/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 2:2497536/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:536864/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:496425/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:43742/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 2:1163773/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:1231901/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:2987606/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 2:2204915/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:2715366/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 2:234119/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:2336427/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGG < 2:1070605/129‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAAAGGGACTT > 1:3570674/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC < 2:2672376/122‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACA > 1:2543499/1‑88 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAG > 2:713088/1‑73 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAG < 2:2775327/54‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTT > 1:3286886/1‑47 ATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACC < 2:3891555/135‑1 ATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACC < 1:2082510/135‑1 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 1:705111/1‑130 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTT > 2:853554/1‑130 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATC > 2:510916/1‑135 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC > 1:2731290/1‑112 tATTGTAGCCTATCAAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGAGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCATATCCGAATA < 2:2860190/133‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTCTGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACTGTTAGAAAATTAATGTCCCACATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 2:3385261/134‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 2:3823813/134‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 2:3295885/134‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 1:3398720/134‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 2:1119182/134‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 1:1015/134‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 2:2294042/134‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 1:1494440/134‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 2:1455783/134‑1 AATTGTAGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 2:56727/134‑1 AATTGTAGCCTATCAAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATA < 2:1572551/134‑1 AGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGAT > 2:1780445/1‑135 AGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCA < 1:2833176/118‑1 AGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGG > 2:3458995/1‑106 AGCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAAACATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCA > 2:2833176/1‑118 GCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGAT < 1:3174249/134‑1 GCCTATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGAT < 1:1877505/134‑1 TATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGACTAAAGCGATATAA > 2:291527/1‑135 TATCCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATA < 2:3055910/134‑1 CCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATC < 2:455856/135‑1 CCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATC < 2:3206678/135‑1 CCAAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGAC > 2:2847786/1‑101 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAATTCCGAATAAAGCGATATAAATCTT > 2:3719673/1‑135 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATCTT > 2:2972954/1‑135 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATCTT > 1:645785/1‑135 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATCTT > 1:1838837/1‑135 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATCTT > 1:408878/1‑135 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATCTT > 2:2330451/1‑135 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATCTT > 2:1495428/1‑135 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGAT > 2:2059715/1‑126 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACC > 1:1164323/1‑104 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATG > 1:1949338/1‑95 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATG < 2:1949338/95‑1 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC > 2:3528156/1‑90 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCC < 1:3528156/90‑1 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAG < 1:2379904/72‑1 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACA < 2:751642/56‑1 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACA > 1:751642/1‑56 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATG < 2:1257183/44‑1 AAAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATG < 1:1084113/44‑1 ‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAACTCTTATGGTTATCGTAGAGTCACTTTAGCGTTAAAGATGAAAGGATATACAATCAATCATAAAACAGTTAGAAAATTAATGTCCCAAATGGGACTTACCTGTCAAATCCGAATAAAGCGATATAAATCTT > AssemblyC74_contig_52/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |