Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
JC AssemblyC74_contig_47 726 17 bp→CTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGC coding (725‑741/879 nt) rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc → hypothetical protein

New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? AssemblyC74_contig_47 = 725NA (NA)46 (0.310)
+CTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGC
10/58 2.5 NA coding (724/879 nt) rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc hypothetical protein
?AssemblyC74_contig_47 743 = NA (NA)coding (742/879 nt) rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc hypothetical protein

Only 100 of 413 total aligned reads displayed.

TTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  >  AssemblyC74_contig_47/697‑725
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGG  >  AssemblyC74_contig_47/743‑853
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                                                                                               
gTGGTATACGTCGAAGGATACTTTTATGTCTGATATGTTTTTTGGCCGGTGCTCTTTAACGTGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGTCTGTGGCTCTTT                                                                                                      <  1:2097359/134‑1
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTGGGTAAT                                                                                >  2:3027125/3‑135
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAT                                                                                >  2:1906694/3‑135
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAT                                                                                >  2:2692391/3‑135
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAT                                                                                >  1:3644825/3‑135
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA                                                                                                 >  1:3249970/3‑118
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA                                                                                                 <  2:3249970/116‑1
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT                                                                                                      <  2:89888/111‑1
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT                                                                                                      >  1:89888/3‑113
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTT                                                                                                                               <  2:2799595/86‑1
                      taTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAAGTCAAATGTTACGAATATGACTTATATGTTTTATTGCTGTGGATCTTTAAAGAGTTTAGATGTAAGTAAT                                                                                >  2:2276564/3‑135
                       aTATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATT                                                                               >  1:3230186/2‑135
                        TATGAGTGATATGTTTTATGGCTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTATTTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG                                                                              <  2:3281767/135‑1
                        TATGACTTATTTTTTTCATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTTATTGGGATACGTCTAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG                                                                              <  2:3439959/135‑1
                        TATGACTGATATTTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGTGTGTAGATGTATGTAATTGGGATACTTCAATTGTTACTAATATGACTTCTATGTTTTTTGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG                                                                              <  1:1756712/135‑1
                         ATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG                                                                             <  1:984741/135‑1
                            ACTGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGAT                                                                          <  1:2246178/135‑1
                             attcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATA                                                                         >  1:573092/5‑135
                             attcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATA                                                                         >  2:1569495/5‑135
                             attcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGA                                                                           >  2:1662509/5‑133
                             attcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGT                                                                                                              >  2:422189/5‑98
                             attcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCT                                                                                                                >  2:3609510/5‑96
                             attcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAGGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATAGGGATA                                                                         >  2:3881965/5‑135
                              ttATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAAAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAC                                                                        <  1:3154470/133‑1
                              TGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAC                                                                        <  1:2719484/135‑1
                              TGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAC                                                                        >  2:3812471/1‑135
                              TGATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAC                                                                        <  1:620190/135‑1
                               tcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG                                                                       <  1:3852521/133‑1
                               tcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG                                                                       <  2:1732876/133‑1
                               tcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG                                                                       <  1:2670873/133‑1
                               tcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG                                                                       <  2:2728989/133‑1
                               tcTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG                                                                       <  2:3211261/133‑1
                               GATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAC                                                                        >  1:3625703/1‑134
                                 TATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGTCAATTTAAAGATTGAAGATGAAAGGAATTGGGATACtac                                                                     >  2:2543064/1‑132
                                 TATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTC                                                                     >  2:2908106/1‑135
                                 TATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG                                                                             <  1:1076409/127‑1
                                  ATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT                                                                                                      >  1:3062098/1‑101
                                   TGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGA                                                                   <  2:2859970/135‑1
                                   TGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGA                                                                   <  1:2876330/135‑1
                                    GTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAA                                                                  <  1:1263618/135‑1
                                     TTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGA                                                                                          >  2:1076435/1‑110
                                       TTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCCAAcg                                                                <  2:592144/134‑3
                                         ATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCT                                                                                                                <  1:1921560/84‑1
                                          TGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCCAACGTTAC                                                            <  2:2508619/135‑1
                                          TGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCCAACGTTAC                                                            >  1:457832/1‑135
                                          TGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCCAACGTTAC                                                            <  2:2168662/135‑1
                                           GGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCCAACGTTACg                                                           <  2:1990821/135‑2
                                            GCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTATTTAACGAGTTTAGTTGTAAGTAATTGGGATACGTCGGAGGATAa                                                            >  2:3538882/1‑132
                                                           CGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGT                                           <  2:76475/135‑1
                                                           CGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGT                                           >  2:2758303/1‑135
                                                             cGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATCTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGTCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAAGTAAGTAATTGGGATACGTCGAATGTTACTTATATGAATGATATGTTT                                         <  1:1674605/134‑1
                                                             actatcGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATGTTT                                         >  1:1012853/7‑135
                                                             actatcGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACT                                                  <  2:1018994/120‑1
                                                             AGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTT                                         <  1:328213/135‑1
                                                             AGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTT                                         <  1:824648/135‑1
                                                             AGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTT                                         <  1:1462265/135‑1
                                                              ctatcGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATGTTTt                                        >  1:1148937/6‑134
                                                              ctatcGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATGTTTt                                        >  1:1585671/6‑134
                                                              ctatcGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATGTTTt                                        >  2:3166320/6‑134
                                                              atatcGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAATTAATTGGGATACTTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATGTTTt                                        >  1:1873239/6‑134
                                                                GTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTTGTATGTTTtgt                                      >  2:1381940/1‑132
                                                                 tcGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATGTTTtgtg                                     >  1:3427094/3‑131
                                                                  AGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTGTGTTccaaaa                                    >  2:613792/1‑129
                                                                  AGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTtctgg                                    >  2:3083424/1‑130
                                                                  AGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGG                                    >  2:131402/1‑135
                                                                   GATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACTAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGG                                   <  1:25680/135‑1
                                                                   GATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGG                                   <  1:1538472/135‑1
                                                                   GATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGG                                   <  1:1510261/135‑1
                                                                   GATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGG                                   <  2:2422734/135‑1
                                                                   GATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGG                                   <  2:11812/135‑1
                                                                   GATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGG                                   <  1:3545531/135‑1
                                                                   GATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTT                                         <  1:3781040/129‑1
                                                                   GATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTT                                         >  2:3781040/1‑129
                                                                       TAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTA                               >  1:242357/1‑135
                                                                            AATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCT                          >  1:782457/1‑135
                                                                            AATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCT                          >  2:2652151/1‑135
                                                                            AATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCT                          >  1:68533/1‑135
                                                                            AATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCT                          >  2:1794523/1‑135
                                                                            AATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGG                                   >  1:503525/1‑126
                                                                            AATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTT                                         <  2:3680273/120‑1
                                                                            AATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTT                                         >  1:3680437/1‑120
                                                                            AATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGATATGTTTTGAGGGGTTAAAaat                          >  2:1599908/1‑132
                                                                             ATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATC                           <  1:1813400/133‑1
                                                                             ATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATC                           <  1:2513720/133‑1
                                                                             ATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATC                           <  2:2572168/133‑1
                                                                                 GGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGATATGTTTGCAGGGGTAAAAACTAACAg                     >  2:807236/1‑134
                                                                                 GGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACAC                     <  1:2762558/135‑1
                                                                                 GGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACAC                     >  1:2317235/1‑135
                                                                                             TGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAG         <  1:3819142/135‑1
                                                                                              GTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTTCTGGTGTTAAATCTATAACTATCGATGTAAGT        >  2:1128790/1‑135
                                                                                                   GAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTG   <  1:2950735/135‑1
                                                                                                   GAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTG   <  2:685836/135‑1
                                                                                                   GAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTG   <  2:2375908/135‑1
                                                                                                   GAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTG   <  1:2376434/135‑1
                                                                                                    AATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAATTAATTGGGATACGTCTAAGGTTACTTCTATGAATTCTATGTTAGCAGGGGTTAAATATAAAACTATAGATGTAAATAATagt  >  1:3928566/1‑132
                                                                                                    AATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACT                                                  <  2:2026837/87‑1
                                                                                                    AATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGG  >  2:522695/1‑135
                                                                                                    AATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGG  >  2:1846420/1‑135
                                                                                                    AATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTA                   <  1:1095363/118‑1
                                                                                                    AATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGG                                   <  2:1490521/102‑1
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                                                                                               
TTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  >  AssemblyC74_contig_47/697‑725
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGG  >  AssemblyC74_contig_47/743‑853

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.