| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_51 | = 723 | 0 (0.000) | 467 (0.470) | 85/248 | 0.0 | 68.3% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/– | Conserved domain protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | = 87 | 434 (0.300) | coding (336/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 467 total aligned reads displayed.
GTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_51/591‑723‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAAT < AssemblyC74_contig_61/87‑3 TCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAAT < 2:1241382/135‑1 CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATT < 2:1513690/135‑1 CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATT < 1:2390012/135‑1 CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAA > 2:458161/1‑133 CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAAAGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAA > 2:2454125/1‑133 CGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGT > 2:784586/1‑135 AGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTAT > 1:1946435/1‑133 AGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATT > 2:287894/1‑122 GTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT < 2:1407304/133‑1 GTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT < 2:725234/133‑1 AGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGG > 1:3716322/1‑134 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTATTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 2:2235794/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:3197668/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 2:2943064/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 2:1466801/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:2602185/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:2894300/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATACAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:362969/1‑135 ATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT < 2:2363952/134‑1 gTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTc < 2:1164704/134‑2 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTTAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:2030481/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:2680496/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:3476382/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:164840/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:884484/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:1326362/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:1466801/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:833475/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:952396/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:212018/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:364172/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:1985114/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:3308607/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT > 2:1672313/1‑125 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACATTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGATGTGGCTCTat > 1:163260/1‑133 GGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGTATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:1080479/133‑1 GAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAAC > 1:691151/1‑135 ATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACG < 1:2528871/134‑1 ATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 2:3563326/1‑130 TACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA < 2:2714925/134‑1 TACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA < 1:416491/134‑1 TACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA < 1:3101300/134‑1 TCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTA < 2:1887387/135‑1 GTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTA > 1:3862015/1‑135 AATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAG < 1:1225422/134‑1 ATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG < 1:3742149/135‑1 ATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG < 2:2763598/135‑1 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGT > 2:2830629/1‑135 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG > 2:260849/1‑128 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATT < 1:704177/78‑1 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 2:3486537/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 2:381916/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 1:224752/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG < 2:3259372/126‑1 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG > 1:3555607/1‑126 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 2:1969870/1‑101 GTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAA < 1:507777/135‑1 TTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAtg > 2:2068956/1‑127 TTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAG > 1:3355938/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:116525/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:2955998/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:3091877/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:3196667/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:1757407/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:342174/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:344713/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:524334/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:605544/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:854090/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG > 1:3005359/1‑117 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTT < 2:2296522/77‑1 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTT > 1:2296522/1‑77 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAAATCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:181773/93‑1 GGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACT < 2:69564/135‑1 GCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:787865/1‑133 GCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:1667560/1‑133 GCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:2847516/1‑133 TGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTC < 1:1560583/134‑1 TGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTC < 1:1579182/134‑1 TGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTC < 1:2945405/134‑1 GTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACTAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTAT > 2:957688/1‑133 GTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGA < 1:1057150/135‑1 GTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATG < 1:381916/134‑1 TAGTTTAACTACCTTGGATGTACGCAAATGGGATACGTCAAATGATACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAc > 2:3692596/1‑134 GTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct < 2:3847541/134‑3 GTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct < 1:1479855/134‑3 AACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct > 1:1385792/1‑128 ACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:1362648/74‑1 GGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 1:982489/1‑69 CAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA > 2:1590271/1‑65 CGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGG < 1:2062725/87‑1 CGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA < 2:157029/54‑1 CAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTC < 1:1005323/91‑1 TGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 2:3722487/1‑42 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG > 1:3265466/1‑66 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATG < 1:1757383/49‑1 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAT > 1:2772500/1‑48 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAT > 2:3900999/1‑48 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 2:526298/1‑35 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 2:3054936/1‑35 GTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_51/591‑723‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAAT < AssemblyC74_contig_61/87‑3 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |