| New junction evidence | |||||||||||
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TATTCTCTTTTGTTAAAAAGATCGCCACTTCTTGTTCTTTTTCGATCTTGAAAGTTACTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCT > AssemblyC74_contig_12/58833‑59101 | ggttttctttcgtcaattctaccaccgctgtctgacttctttcgatctcaaactcgattggtgtcgcatctaattcataccctattggcgcttgagtttctaccagctgatatgctcctggtgctaaaccgtcaa < 1:1902772‑M1/1‑1 (MQ=255) attttctttcgtcaagtctaccaccgctgtctgactactttcgatctcaaacacgtttggtgtcgcatccaattcattccccctaggcgcttgggtttctcccagctgatacactcctggtgctaagccgtcaAt > 2:3532470‑M1/134‑135 (MQ=255) ttctttcgtcaattctaccaccgctgtctgacttctttcgatctcaaactcgatcggtgtcgcatctaattcataccctattggcgcttgagtttctaccagctgatatgctcctggtgctaaaccgtcaattgc < 1:1001437‑M1/5‑4 (MQ=255) tctttcgttaattctaccaccgctgtctgacttctttcgatctcaaactcgattggtgtcgcatctaattcataccctattggcgcttgagtttctaccagctgatatgctcctggtgctaaaccgtcaATTGcc < 2:805739‑M1/6‑1 (MQ=255) 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ccATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTg > 1:3273541/1‑47 (MQ=255) aTCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAcc < 1:3321331/135‑1 (MQ=255) aTCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAcc < 2:1724045/135‑1 (MQ=255) ATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACa > 1:1747234‑M1/1‑78 (MQ=255) ATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATATTTGTCAACACGACACCGCCt < 2:2430553‑M1/135‑1 (MQ=255) ATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCt < 2:3357049‑M1/135‑1 (MQ=255) | TATTCTCTTTTGTTAAAAAGATCGCCACTTCTTGTTCTTTTTCGATCTTGAAAGTTACTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCT > AssemblyC74_contig_12/58833‑59101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |