| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_36 | 1 = | 0 (0.000) | 536 (0.650) | 100/248 | 0.3 | 100% | intergenic (–/‑369) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_64 | = 352 | 0 (0.000) | intergenic (+1/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 569 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGTTGGGTTAAACCTGAATTGACGAAGATGTAAATATTTGATCTCTTCGTCAATTCATATTAATACTGGACATTTGGTTAGTCTCC > AssemblyC74_contig_36/1‑135 | ttggagtagaaatcaatggccaagtacaagccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGc < 2:2642986‑M1/3‑1 (MQ=255) atcaatggccaagtacaagccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGAt > 1:1410114‑M1/122‑134 (MQ=255) tcaatggccaagtacaagccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTa < 1:1536588‑M1/15‑1 (MQ=255) caatggccaagtacaagccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTac > 2:1416895‑M1/120‑135 (MQ=255) tggccaagtacaagccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACg < 1:3452465‑M1/19‑1 (MQ=255) ggccaagtacaagccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACg < 1:1468665‑M1/19‑1 (MQ=255) gccaagtacaagccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAg > 2:2909876‑M1/115‑135 (MQ=255) gtacaagccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAgtt > 2:437492‑M1/110‑135 (MQ=255) agccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCa > 2:1364959‑M1/105‑108 (MQ=255) agccatcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTcc > 1:3151712‑M1/105‑135 (MQ=255) atcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTac < 1:508263‑M1/16‑1 (MQ=255) atcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAAtt < 1:1789679‑M1/35‑1 (MQ=255) atcgttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAAt > 2:2794048‑M1/101‑134 (MQ=255) gttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAAt > 1:3362487‑M1/98‑135 (MQ=255) gttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAAt > 2:2071320‑M1/98‑135 (MQ=255) gttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAAt > 1:2624364‑M1/98‑135 (MQ=255) gttcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAAt > 1:1001932‑M1/98‑135 (MQ=255) tcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGc < 2:128872‑M1/40‑1 (MQ=255) tcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGc < 1:2379091‑M1/40‑1 (MQ=255) tcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGc < 2:111801‑M1/40‑1 (MQ=255) tcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGc < 2:2553923‑M1/40‑1 (MQ=255) tcctagtgaggatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGc < 2:3377303‑M1/40‑1 (MQ=255) 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gatctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaaatgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACt > 2:3705304‑M1/86‑134 (MQ=255) ctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGtt < 1:1767306‑M1/53‑1 (MQ=255) ctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGtt < 1:2878626‑M1/53‑1 (MQ=255) ctgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGtt < 2:1191909‑M1/53‑1 (MQ=255) tgaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGTTg > 1:2202121‑M1/82‑135 (MQ=255) gaaaaacggtacgttccaatattatgtgggaagtgggttaaaattgacagataaagtcgaaatagtattgtataccgcagGGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGTTgg < 2:1606177‑M1/55‑1 (MQ=255) 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ggCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGTTGGGTTAAACCTGAATTGACGAAGATGTAAATATTTGATCTCTTCGTCa > 2:955960/1‑101 (MQ=255) ggCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGTTGGGTTAAACCTGAATTGACGAAGATGTAAATATTTGATCTCTTCGTCAATTCATATTAATACTGGACATTTGGtt > 2:3321274/1‑128 (MQ=255) ggCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGTTGGGTTAAACCTGAATTGACGAAGATGTAAATATTTGATCTCTTCGTCAATTCATATTAATACTGGACATTTGGtt < 1:3321274/128‑1 (MQ=255) ggCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGTTGGGTTAAACCTGAATTGACGAAGATGTAAATATTTGATCTCTTCGTCAATTCATATTAATACTGGACATTTGGTTAGTCTcc > 2:176945/1‑135 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCATGTCGAGATTACACGAGCAGTTGTTCCAATTAATGCAAAGTAACTGGTTGGGTTAAACCTGAATTGACGAAGATGTAAATATTTGATCTCTTCGTCAATTCATATTAATACTGGACATTTGGTTAGTCTCC > AssemblyC74_contig_36/1‑135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |