New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_43 | 992 = | 498 (0.730) | 1144 (1.090) | 117/248 | -0.0 | 82.1% | coding (224/1215 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
? | AssemblyC74_contig_61 | = 423 | 0 (0.000) | intergenic (‑1/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
Only 100 of 2400 total aligned reads displayed.
AGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTC > AssemblyC74_contig_43/859‑1126 | gccacaaccttggaacatatcagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttg < 2:923284‑M1/1‑1 (MQ=255) aaccttggaacatatcagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTcc > 2:3103332‑M1/129‑133 (MQ=255) aaccttggaacatatcagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAg < 2:2633637‑M1/7‑1 (MQ=255) aaTAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAg > 1:2889820/1‑135 (MQ=255) aaTAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAg > 2:2788698/1‑135 (MQ=255) atggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTcc > 1:1805287‑M1/107‑132 (MQ=255) ttggaacatatcagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGc > 2:345105‑M1/125‑135 (MQ=255) gCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCg > 1:561596/1‑135 (MQ=255) aacatatcagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaactttttcatcgcggaaaagtccaaacaatttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGaa < 2:2709009‑M1/15‑1 (MQ=255) aacatatcagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGaa < 1:2468051‑M1/15‑1 (MQ=255) aaCATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGaa < 2:3285262/135‑1 (MQ=255) aTGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGaaa > 2:3665155/1‑133 (MQ=255) aattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGc < 1:3426718‑M1/40‑1 (MQ=255) cagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCtt < 1:503580‑M1/21‑1 (MQ=255) agtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGt < 1:2254398‑M1/23‑1 (MQ=255) atatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCa > 1:257681‑M1/109‑133 (MQ=255) cattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt > 2:2873329‑M1/99‑135 (MQ=255) cattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt > 2:1958866‑M1/99‑135 (MQ=255) cattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt > 2:816275‑M1/99‑135 (MQ=255) cattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt > 2:2485856‑M1/99‑135 (MQ=255) cATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAg > 2:3180177/1‑134 (MQ=255) cATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAg > 2:1617675/1‑134 (MQ=255) cATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt < 1:1195776/135‑1 (MQ=255) cATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt < 1:241298/135‑1 (MQ=255) tgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt > 1:2174973‑M1/77‑134 (MQ=255) gacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTGTTAAGTTCaa < 2:1351169‑M1/41‑1 (MQ=255) atcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCAtt < 1:2677023‑M1/47‑1 (MQ=255) aaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTa < 2:1672328‑M1/69‑1 (MQ=255) aaacccacgcatatcgatggttttatcttgttcatcgaggaaaattccaatcatgttagtgtacaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTTGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa > 1:1688550‑M1/86‑135 (MQ=255) aaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa > 2:1898404‑M1/86‑135 (MQ=255) aaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa > 2:1431804‑M1/86‑135 (MQ=255) aaaCCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa < 2:515299/135‑1 (MQ=255) aaaCCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa < 2:440359/135‑1 (MQ=255) catatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGtt > 2:2277859‑M1/59‑117 (MQ=255) catatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa > 1:1000840‑M1/59‑129 (MQ=255) tatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt > 2:3594264‑M1/57‑114 (MQ=255) gcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCt > 2:704661‑M1/78‑135 (MQ=255) atatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt > 1:3623252‑M1/76‑112 (MQ=255) atatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCttt < 2:2024743‑M1/60‑1 (MQ=255) atatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCttt < 1:1562484‑M1/60‑1 (MQ=255) atatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCttt < 2:389585‑M1/60‑1 (MQ=255) atatCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCt < 1:1059690/105‑1 (MQ=255) atatCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCttt > 1:2040421/1‑135 (MQ=255) tatCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCttt < 1:3334218/134‑1 (MQ=255) gatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTagaga < 2:1056530‑M1/65‑1 (MQ=255) gatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTagaga < 1:1634085‑M1/65‑1 (MQ=255) gttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCtttagagaaat < 1:852497‑M1/68‑4 (MQ=255) gttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCt > 1:661966‑M1/67‑124 (MQ=255) tgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTaga < 1:991528‑M1/63‑1 (MQ=255) actgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt < 1:3116511‑M1/58‑1 (MQ=255) actgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTATTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGc < 1:1263575‑M1/92‑1 (MQ=255) gCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACa > 1:2329201/1‑135 (MQ=255) gCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACa > 1:272751/1‑135 (MQ=255) acttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCt > 2:1204391‑M1/61‑90 (MQ=255) acttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACa < 2:2195058‑M1/75‑1 (MQ=255) acttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAAATTGCTACa < 1:2802292‑M1/75‑1 (MQ=255) tattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGtt < 1:37749‑M1/100‑1 (MQ=255) atcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTAtt < 2:2357961‑M1/83‑1 (MQ=255) atcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTAtt < 1:3034442‑M1/83‑1 (MQ=255) atatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTAtt < 1:1873624‑M1/104‑1 (MQ=255) agaaTTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTAtt > 1:454676/1‑135 (MQ=255) cggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTg > 2:56825‑M1/49‑135 (MQ=255) aaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAAATTGCTACAGGTTTATTTTTGaaa < 1:1338413‑M1/90‑1 (MQ=255) aaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAAATTGCTACAGGTTTATTTTTGaaa < 2:3385356‑M1/90‑1 (MQ=255) aaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAAATTGCTACAGGTTTATTTTTGaaa < 1:3491231‑M1/90‑1 (MQ=255) aagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGt > 1:3919843‑M1/44‑135 (MQ=255) aaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGt > 2:635214‑M1/23‑135 (MQ=255) aaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGt > 2:3016514‑M1/23‑135 (MQ=255) atGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGtggt < 2:2551718/133‑1 (MQ=255) acaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGtggttgg < 1:2957527‑M1/98‑1 (MQ=255) ttagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTgg > 2:2143482‑M1/10‑135 (MQ=255) agtATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTgg < 2:1818149/133‑1 (MQ=255) gtATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACa > 2:3752705/1‑135 (MQ=255) acactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCt > 1:36954‑M1/21‑135 (MQ=255) acactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCt > 1:1508667‑M1/21‑135 (MQ=255) ACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCt > 1:3183194‑M1/1‑135 (MQ=255) cactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCtt < 1:2514264‑M1/116‑1 (MQ=255) actttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCtt < 1:946972‑M1/116‑1 (MQ=255) actttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTa > 2:3524974‑M1/19‑135 (MQ=255) ctttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTAt > 1:1130452‑M1/18‑135 (MQ=255) CTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTAt > 1:1987429‑M1/1‑135 (MQ=255) CTTTGATTTCTTAATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAATCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGAAATTTCCTTAAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTAATTGGACATTGGTCTTAt < 1:1952922‑M1/135‑1 (MQ=255) gatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt < 1:3840141‑M1/37‑1 (MQ=255) GATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa < 2:1761707‑M1/63‑1 (MQ=255) GATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTa < 1:3557888‑M1/113‑1 (MQ=255) GATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGcc < 1:718858‑M1/135‑1 (MQ=255) tctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCa > 1:3269347‑M1/12‑36 (MQ=255) TTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTa > 2:3819118‑M1/1‑111 (MQ=255) TTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCgg < 2:1279645‑M1/135‑1 (MQ=255) TTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCgg < 2:751879‑M1/135‑1 (MQ=255) TTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCgg < 1:1406897‑M1/135‑1 (MQ=255) TTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCgg < 1:2113091‑M1/135‑1 (MQ=255) gtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACAtt < 2:2082147‑M1/110‑1 (MQ=255) gtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAAATTGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGAACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 2:1134917‑M1/5‑135 (MQ=255) gtttGTTCCAGAGGCGGAAAAGCTTGTCAATCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAAATTGCTACAGGTTTATTTTAGAAAGTGGTTGGTACTAGAACATTGGTCTTATCGCCGGTAAAGtt < 2:2420131‑M1/131‑1 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 1:1749136‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 1:2209997‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 2:1526794‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 2:2952949‑M1/1‑135 (MQ=255) ttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt > 1:789032‑M1/3‑39 (MQ=255) | AGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTC > AssemblyC74_contig_43/859‑1126 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |