| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | 452 = | NA (NA) | 571 (0.760) +TACACTCGTTAAAGAGCCACAGCCATAAAACATA |
79/180 | -0.0 | 100% | noncoding (7/29 nt) | direct | CRISPR repeat with sequence actatcgatgtaagtaattgggatacgtc |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+2) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1982 total aligned reads displayed.
TCAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGAC > AssemblyC74_contig_47/318‑586 | aatgttacaagtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGAt > 1:797181‑M1/133‑135 (MQ=255) aaaGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGAt > 2:1191771/1‑135 (MQ=255) aaGTGTTAGACACTAACTTGATTGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATg < 2:3309961/135‑1 (MQ=255) aGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgt > 1:1235928/1‑135 (MQ=255) gttacttctatgactgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATgtaagt < 1:2907629‑M1/9‑1 (MQ=255) agtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATg > 2:1111674‑M1/124‑127 (MQ=255) agtatgaattctatgttttatggctgtggatctttaacgagtgaagatgtaagaaattggtatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAAt < 1:2842617‑M1/12‑1 (MQ=255) acacTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAAtt > 1:3410283/1‑135 (MQ=255) acacTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACATACGATATGGGTGGGTTTTTTATTTCGAATGTTACTTATATGGGTTTTATGTTTGCGGGGGTTAAATCTAAAACTATCTAGTTAAGTTAtt > 2:1891037/1‑135 (MQ=255) tctatgactgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTgg > 1:1054314‑M1/121‑135 (MQ=255) tctatgactgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTgg < 1:3599685‑M1/15‑1 (MQ=255) tgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTg > 2:2587192‑M1/120‑133 (MQ=255) tgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTg > 1:1792833‑M1/120‑133 (MQ=255) tgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTg > 2:1953268‑M1/120‑133 (MQ=255) ctatgactgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaTATGTAAGTACTTggg < 1:2774977‑M1/16‑1 (MQ=255) tgactgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATa < 2:1316971‑M1/19‑1 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc < 2:2716161/135‑1 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc > 2:2655575/1‑135 (MQ=255) tgaatgaaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 1:2329277/1‑127 (MQ=255) gttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaa < 2:3530016‑M1/26‑1 (MQ=255) atgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAAt > 2:1585772‑M1/78‑135 (MQ=255) atgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAAt < 2:2538805‑M1/27‑1 (MQ=255) tgtttgcaggggttaaatctaactctatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATg > 2:397918‑M1/108‑135 (MQ=255) gtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGt < 2:2355073‑M1/29‑1 (MQ=255) cTTTTCCGCAATGCAAAAGTTATAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGtt < 1:366840/135‑1 (MQ=255) ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGTTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGttaag < 2:82902‑M1/33‑3 (MQ=255) tgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTtacgaat < 2:1462265‑M1/36‑4 (MQ=255) tgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa > 2:2931529‑M1/100‑132 (MQ=255) ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTTCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTtacgaat < 1:1652272‑M1/67‑4 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAatat < 1:2437878‑M1/38‑1 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAatat < 2:3855137‑M1/38‑1 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAatat < 1:3321442‑M1/38‑1 (MQ=255) taaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTTGGATAAGTCAAATGTTACTAATATgac < 2:594193‑M1/41‑2 (MQ=255) gCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAAt < 2:3153215/135‑1 (MQ=255) aaatctaacactatctatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATAtgact < 1:2628933‑M1/42‑3 (MQ=255) ctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGGAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATatgactt < 1:1196772‑M1/74‑4 (MQ=255) tctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCt < 1:2508619‑M1/45‑1 (MQ=255) acgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATg < 2:1024925‑M1/48‑1 (MQ=255) ctatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGtttt < 2:1381933‑M1/52‑1 (MQ=255) cgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGtttt < 1:2132423‑M1/83‑1 (MQ=255) aCCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTAt > 1:3802532/1‑135 (MQ=255) aCCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTAt > 2:754381/1‑135 (MQ=255) agatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa > 1:3535976‑M1/80‑112 (MQ=255) agatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTAt < 2:478981‑M1/54‑1 (MQ=255) tagatgtaagtaattgcgatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 1:1459675‑M1/47‑135 (MQ=255) gtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 1:488088‑M1/76‑133 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAAtt < 1:549821/117‑1 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 1:3247394/1‑134 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 1:2549777/1‑134 (MQ=255) tgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaaTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACg < 1:3736041‑M1/55‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATgtaag > 2:2187977‑M1/70‑77 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTg > 1:851943‑M1/70‑83 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGt < 1:711664‑M1/49‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGt > 1:3472785‑M1/70‑118 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 2:2996143‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATTTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATTTCTGTGGctct < 2:1620245‑M1/66‑1 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:2416857‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:3742182‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:528304‑M1/68‑135 (MQ=255) tagggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctcattaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:1511951‑M1/68‑135 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2063085/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:2871632/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2207069/135‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt < 2:2044796‑M1/89‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2267414‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2003838‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2709654‑M1/99‑1 (MQ=255) attgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:2796207‑M1/35‑133 (MQ=255) attgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:929962‑M1/35‑133 (MQ=255) attgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:1241102‑M1/35‑133 (MQ=255) tttGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACg > 1:1115135/1‑135 (MQ=255) tcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTa < 1:1722276‑M1/78‑1 (MQ=255) aaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAt > 2:1780767‑M1/55‑135 (MQ=255) aaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAt > 2:655383‑M1/55‑135 (MQ=255) gttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAAGGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta < 1:304613‑M1/84‑1 (MQ=255) aaTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta > 2:2474611/1‑135 (MQ=255) gttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgtaagt < 1:1001099‑M1/118‑1 (MQ=255) acttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgtaag > 2:323567‑M1/49‑134 (MQ=255) tctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:3176759‑M1/68‑1 (MQ=255) tctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:2103048‑M1/68‑1 (MQ=255) tctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:306563‑M1/68‑1 (MQ=255) tctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAt < 1:1552594‑M1/90‑1 (MQ=255) ttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg > 2:2267414‑M1/13‑135 (MQ=255) ttCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg < 1:3870440/135‑1 (MQ=255) ttCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg < 2:3477924/135‑1 (MQ=255) tatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg > 1:1393949‑M1/44‑135 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg < 1:1600912‑M1/123‑1 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg < 2:3607674‑M1/124‑1 (MQ=255) tctatgaaTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgtaagt < 1:2367848‑M1/43‑1 (MQ=255) ctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgtaagt > 1:2970430‑M1/11‑50 (MQ=255) ctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg < 1:934085‑M1/45‑1 (MQ=255) atgcTATGTTTGCAGGGGATAAATCTAAAACTATCGATGTAATTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGATTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGt < 2:3674435‑M1/131‑1 (MQ=255) gTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGt > 1:1863591/1‑135 (MQ=37) aGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1675599/90‑1 (MQ=255) ggggTTAAATCTAAAACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa < 1:134114/134‑1 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGtt > 1:1936879/1‑135 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGtt < 1:3102076/135‑1 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGtttt > 1:407083/1‑135 (MQ=255) aTCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATAAGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt < 2:3433093/135‑1 (MQ=255) agATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCCaacg < 1:607958/106‑3 (MQ=11) | TCAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGAC > AssemblyC74_contig_47/318‑586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |