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tGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcatt > 2:2787555‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcatt > 2:143301‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcatt > 1:1694548‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagagaaaccgcggtttcttagttcatt > 1:77974‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagagaaaccgcggtttcttagttcatt > 1:555645‑M2/1‑6 (MQ=255) ccgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcattggtc > 1:1127277‑M2/1‑2 (MQ=255) | ACAATTTCTTTTGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_57/361‑493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |