| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_43 | 1 = | 0 (0.000) | 621 (0.570) | 116/248 | 0.0 | 100% | coding (1215/1215 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_44 | = 1136 | 0 (0.000) | coding (1/1134 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1250 total aligned reads displayed.
ATTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1002‑1136 | aTTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATc < 1:1293881/135‑1 (MQ=255) gTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtgg < 1:1891815‑M2/134‑4 (MQ=255) gTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtgg < 1:2617436‑M2/134‑4 (MQ=255) tAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcg < 1:2833115‑M1/135‑6 (MQ=255) aCATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctg > 1:3777804‑M2/1‑127 (MQ=255) cATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcg > 1:1830660‑M1/1‑126 (MQ=255) aTACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgtt > 1:3268315‑M2/1‑125 (MQ=255) tACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttg > 1:3088402‑M2/1‑124 (MQ=255) tATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcc < 1:3482989‑M2/135‑15 (MQ=255) tATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcc < 2:2097539‑M2/135‑15 (MQ=255) tATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcc < 1:2410975‑M2/135‑15 (MQ=255) gTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagttt > 2:2714432‑M2/1‑110 (MQ=255) gTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttgg < 2:1688044‑M1/135‑26 (MQ=255) cacaGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATATAACTTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagttttt < 2:2256506‑M2/135‑28 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttg < 2:3430197‑M2/134‑29 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttg < 2:1373074‑M2/134‑29 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaca > 1:3202304‑M1/1‑106 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaca > 1:2995273‑M1/1‑106 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaca > 2:30667‑M1/1‑106 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaca > 2:2506466‑M1/1‑106 (MQ=255) gTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatt < 2:3898199‑M1/134‑34 (MQ=255) cATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattcc < 2:3227406‑M2/133‑37 (MQ=255) aTCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccag > 1:2097539‑M2/1‑96 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccag < 1:156764‑M2/133‑39 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccag < 1:1521606‑M2/133‑39 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaaga > 1:1956215‑M1/1‑95 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaaga > 2:265397‑M1/1‑95 (MQ=255) aCCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacga < 2:3156768‑M2/135‑46 (MQ=255) ccAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggtt < 2:4278‑M1/135‑47 (MQ=255) cAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccag < 2:1835266‑M2/126‑39 (MQ=255) cAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttg > 2:2577901‑M1/1‑88 (MQ=255) aGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagt > 2:49664‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagttgttgaacattccagctaacgaagtaggt < 1:3569277‑M2/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 2:2317232‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 2:1320880‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 1:2575831‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 1:3640467‑M1/135‑53 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggt < 2:2798248‑M2/134‑53 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttg < 1:887542‑M1/129‑48 (MQ=255) aCGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACGACTTAAATCcagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaat < 2:577800‑M1/135‑60 (MQ=255) gTTAAATTACTTCAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtttagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:917784‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:3897666‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:1930371‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:2031235‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:737690‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:2705464‑M2/1‑71 (MQ=255) aaaTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaacc < 2:1422806‑M1/134‑67 (MQ=255) aaaTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaacc < 2:1641264‑M1/134‑67 (MQ=255) tactacAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagtta < 1:1328413‑M1/135‑72 (MQ=255) acAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc < 2:3276162‑M1/135‑76 (MQ=255) aCCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagatt > 1:2186719‑M2/1‑57 (MQ=255) aCCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtg < 2:3368397‑M2/59‑3 (MQ=255) aCATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatacttta > 1:660603‑M1/1‑49 (MQ=255) aCATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatacttta > 2:784825‑M1/1‑49 (MQ=255) cATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatca > 2:1240447‑M1/1‑48 (MQ=255) cATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatca < 1:1240447‑M1/124‑77 (MQ=255) cATATTGCTCATATTCGTGACAATAGACATGTCCCAACTACTAAAATCaatcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcacaaacagttaaatcaacatacttta > 1:1712790‑M1/1‑48 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 1:1447703‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 1:2526496‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 1:2908003‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgtt > 2:633426‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgtt > 1:1104324‑M1/1‑42 (MQ=255) atatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaattt > 1:535022‑M2/1‑38 (MQ=255) gTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaac > 2:347866‑M2/1‑32 (MQ=255) gTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaac > 2:2861980‑M2/1‑32 (MQ=255) tGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaaca > 1:1387832‑M2/1‑31 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatac < 2:1584446‑M2/135‑108 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaa > 2:838901‑M2/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaa > 2:682307‑M2/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaattt > 1:2877744‑M2/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaaca > 1:276108‑M1/1‑28 (MQ=255) cTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatacta > 2:2039586‑M2/1‑26 (MQ=255) aGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatc > 2:2410975‑M2/1‑24 (MQ=255) aGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgc > 2:3783184‑M2/1‑24 (MQ=255) aTGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaa > 2:3635710‑M2/1‑20 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:977152‑M2/135‑121 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaa < 1:1001748‑M2/116‑102 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:805343‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 2:3696647‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:615297‑M2/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgatgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 2:1469446‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 2:2937549‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 2:1987206‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 1:3820365‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 1:336107‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 1:2359262‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 1:2272463‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc > 1:3431190‑M1/1‑14 (MQ=255) aaCTTCTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtca > 2:1062477‑M2/1‑13 (MQ=255) aaCTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtca > 2:3552717‑M2/1‑13 (MQ=255) aaCTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtca > 2:1178735‑M2/1‑13 (MQ=255) tactTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagcta < 2:1775039‑M2/51‑42 (MQ=255) tactTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagcta > 1:1775039‑M2/1‑10 (MQ=255) actTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcacaca > 1:1190469‑M2/1‑9 (MQ=255) actTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc > 2:1529985‑M1/1‑9 (MQ=255) tAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcacacagga > 1:441719‑M2/1‑6 (MQ=255) aaaTCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcacacagga < 2:3019250‑M2/134‑130 (MQ=255) aaaTCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatc > 2:3825589‑M2/1‑5 (MQ=255) aaaTCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaac < 1:1626920‑M2/108‑104 (MQ=255) tCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaatttggtaatttc > 2:2163297‑M1/1‑2 (MQ=255) | ATTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1002‑1136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |