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agagcatgccgagattacacgagcagctgttccaattaacgcaaagtaactgttttggatataccttattaacatgaattagcggcatattaagtatgtcgctaatttctatattcaaaattagtagcaactata < 1:2667082‑M2/135‑134 (MQ=255) agagcatgccgagattacacgagaagctgttccaattaacgcaaagtaactgttttggatataccttattaacatgaattagcggcatattaagtatgtctctaatttctatattcaaaattagtagaaactata < 2:2149876‑M2/135‑134 (MQ=255) aGggcatgtcgagattacacgagcagttgttccaattaatgcaaagtaactggttgggttaaacctgaattgacgaagatgtaaatatttgatctcttcgtcaattcatattaatactggacatttggttagtc < 1:270215‑M2/134‑133 (MQ=255) aGggcatgtcgagattacacgagcagttgttccaattaatgcaaagtaactggttgggttaaacctgaattgacgaagatgtaaatatttgatctcttcgtcaattcatattaatactggacatttggtt < 2:551353‑M2/130‑129 (MQ=255) aGggcatgtcgagattacacgagcagttgttccaattaatgcaaagtaactggttgggttaaacctgaattgacgaagatgtaaatatttgatctcttcgtcaattcatattaatactggacatttggtt > 1:551405‑M2/1‑2 (MQ=255) aGggcatgtcgagattacacgagcagttgttccaattaatgcaaagtaactggttgggttaaacctgaattgacgaagatgtaaatatttgatctcttcgtca < 1:2916434‑M2/103‑102 (MQ=255) | TGATTGGAGTAGAAATCAATGGCCAAGTACAAGCCATCGTTCCTAGTGAGGATCTGAAAAACGGTACGTTCCAATATTATGTGGGAAGTGGGTTAAAATTGACAGATAAAGTCGAAATAGTATTGTATACCGCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_64/218‑352 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |