| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
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TATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGG < 2:2134264/135‑1 TATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGG < 2:271186/135‑1 TCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAATTAAATTTA < 1:1217885/136‑1 TCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAATTAAATTTA < 2:1405435/136‑1 TCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTT > 2:1031651/1‑67 CTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAATTAAATTTAAGT > 2:1879083/1‑136 CTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTAT < 1:780343/76‑1 CTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTAT > 2:780343/1‑76 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_1/88482‑88613‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAATTAAATTTAAGT > TrimmedAssembly_T66_contig_40/1‑135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |