New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
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1:1317926‑M1/135‑118 (MQ=255) ggcggcTTTTTGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaaagtcct < 1:1947675‑M1/135‑118 (MQ=255) ggcTTTTTGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaacgtcctgt > 2:957018‑M1/1‑15 (MQ=255) ggcTTTTTGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaacgtcctgt > 2:1414019‑M1/1‑15 (MQ=255) ggcTTTTTGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaacgtcctgt > 1:836547‑M1/1‑15 (MQ=255) ggcTTTTTGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaac < 1:925045‑M1/127‑113 (MQ=255) ggcTTTTTGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaac > 2:925045‑M1/1‑15 (MQ=255) ggcTTTTTGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgt > 1:1560801‑M1/1‑15 (MQ=255) gcTTTTTGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaacgtcctgt > 2:1935‑M1/1‑14 (MQ=255) ttttGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaacgtcctgttctgta < 1:2424634‑M1/136‑126 (MQ=255) ttGTGTATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaacgtcctgttctgtata < 1:797383‑M1/136‑128 (MQ=255) gtATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaacgtcctgttctgtataatta > 2:661558‑M1/1‑5 (MQ=255) gtATGgggcgaattgtcaaactaagtgcaacggtttgtcaaaaaatacttcatatggggtttcatagtttaacactttgcgaggacgttgatttaactgcttttggcagtgttcaacgtcctgttctgtataatta > 2:135432‑M1/1‑5 (MQ=255) | GAAAAGCAATTGTTTGATCCAGCAGGTAGCGATACAACCCCAAGTAATGGATAATTCTGAAAAACATATTGAATAACTAACCACTAGTCGCCGATAAATCAACAATACCAATTGGGGCGGCTTTTTGTGTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_12/94799‑94931 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |