| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_17 | 66638 = | 92 (0.560) | 102 (0.790) +ATCGTTCGTTGATTACCTCAACGCAACT |
37/202 | 1.2 | 74.0% | intergenic (+352/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+632) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Lipoteichoic acid synthase LtaS Type IIa | |||||
Only 100 of 682 total aligned reads displayed.
GTTACCGATTATGTTATGATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66504‑66738 | ttagtatacgttgttgaggcgcacaaagcggttagccgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgattt > 2:1904954‑M2/135‑136 (MQ=255)ttagtatacgttgttgaggcgcacaaagcggttagccgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgattt < 1:2144416‑M2/2‑1 (MQ=255) aagatagtttctgttgtcgcaacggcaactatgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGa > 2:31073‑M2/127‑135 (MQ=255) gttgttgaggcgcacaaagcggttagccgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTg > 2:1360597‑M2/126‑136 (MQ=255) agtttctgttgtcgcaacggcaactatgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTg > 1:1138126‑M2/122‑136 (MQ=255) atattcaaattgatgtgagcatttacattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttattagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGa > 2:2172919‑M1/125‑136 (MQ=255) atattcaaattgatgtgagcatttacattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGa < 2:721164‑M1/12‑1 (MQ=255) gttatgATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGACTTAGATCTTTGaaa > 2:950591/1‑136 (MQ=255) tgttgtcgcaacggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGaaa < 2:2298762‑M1/42‑1 (MQ=255) tgttgtcgcaacggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGaaa < 1:548658‑M1/42‑1 (MQ=255) gaggcgcacaaagcggttagccgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACt < 1:26653‑M2/17‑1 (MQ=255) caaattgatgtgagcatttacattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAAc < 1:635062‑M1/16‑1 (MQ=255) aattgatgtgagcatttacattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGa < 2:1673648‑M1/19‑1 (MQ=255) tcgcaacggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACa < 1:481083‑M1/50‑1 (MQ=255) aacggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGATAACTGAACAAAGt < 1:1073858‑M1/54‑1 (MQ=255) aaagctgttagccgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgatgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGt > 1:32441‑M2/111‑136 (MQ=255) aCGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGa < 1:1255635/122‑1 (MQ=255) aCGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGa > 2:1255635/1‑122 (MQ=255) aCGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGt > 1:253206/1‑136 (MQ=255) gagcatttacattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGttt > 2:2109273‑M1/109‑136 (MQ=255) gTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCtt > 2:2264630/1‑117 (MQ=255) gTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGttt < 1:1423085/136‑1 (MQ=255) cggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGttt > 1:1658361‑M1/81‑136 (MQ=255) cggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGttt > 1:752735‑M1/81‑136 (MQ=255) agcggttagccgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGttt < 2:268621‑M2/28‑1 (MQ=255) aaaTTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTcgacg > 2:921755/1‑136 (MQ=255) tagccgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTcgacg < 2:104943‑M2/33‑1 (MQ=255) tagccgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTcgacg < 1:1457763‑M2/33‑1 (MQ=255) tacattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGaa > 1:1006106‑M1/102‑136 (MQ=255) ttCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 2:1572919/136‑1 (MQ=255) atgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 1:1211605‑M2/40‑1 (MQ=255) atgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 1:1108429‑M2/40‑1 (MQ=255) acgacaaattaatcaagttacttcttaaaaatagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 1:1580959‑M1/73‑136 (MQ=255) acgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 2:2439439‑M1/73‑136 (MQ=255) acgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 1:769278‑M1/73‑136 (MQ=255) acgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 2:54967‑M1/73‑136 (MQ=255) acattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 1:904800‑M1/101‑136 (MQ=255) acattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 1:308860‑M1/101‑136 (MQ=255) cgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 2:1760082‑M2/36‑1 (MQ=255) cgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 1:856668‑M2/36‑1 (MQ=255) cgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 2:513000‑M2/36‑1 (MQ=255) cgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 1:1498048‑M2/36‑1 (MQ=255) cgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCa < 2:384624‑M2/38‑1 (MQ=255) aattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAAtg > 2:674965‑M1/67‑136 (MQ=255) gcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 1:732628‑M2/36‑1 (MQ=255) ttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATgtgt > 1:980542‑M2/92‑136 (MQ=255) agttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 1:1791107‑M1/92‑127 (MQ=255) aatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAaatgtgga < 2:2389321‑M1/74‑3 (MQ=255) aaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGttt < 1:2269594‑M1/28‑1 (MQ=255) tcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGAt < 2:799466‑M2/62‑1 (MQ=255) tcttaaaaaaagatgttgccaagatattgattaagatgttatgatgattaagcagtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGAt < 2:424642‑M2/62‑1 (MQ=255) taaataaaGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAgg < 2:1721458/122‑1 (MQ=255) ataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGa > 2:1393842‑M1/74‑136 (MQ=255) ataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGa < 2:1141145‑M1/63‑1 (MQ=255) aaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGttt > 1:669741‑M1/44‑99 (MQ=255) tgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAagag > 1:2348499‑M1/65‑135 (MQ=255) tattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACAttt < 1:1748209‑M2/85‑1 (MQ=255) tattcattaagatgttatgaggattcAGTTGTGTTCAGAGATTCACGCATGGACTTAGATCCGTGAAAACTGAACACAGTTACGACGAATCAAATGTGTAGGGACTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTg > 1:2409125‑M1/27‑136 (MQ=255) tgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGc > 2:635062‑M1/54‑136 (MQ=255) gttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCg < 2:1442560‑M1/84‑1 (MQ=255) gttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATATGCg < 2:1830297‑M1/84‑1 (MQ=255) tgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGa < 1:1707778‑M2/89‑1 (MQ=255) gataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAg > 1:1822073‑M2/50‑136 (MQ=255) tgttatgatgattaAGTAGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAAGTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGATACGACGAATCAAATGTGTAGTGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGACAATTc < 1:237687‑M1/122‑1 (MQ=255) gatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTc > 1:2174363‑M2/42‑135 (MQ=255) aaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAaga < 2:1304399‑M1/70‑1 (MQ=255) ttatGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTa > 1:1595351/1‑135 (MQ=255) gatgattaagctgtgttaagcgattaacacacTGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGc > 2:2027748‑M2/33‑136 (MQ=255) atGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 2:151960/71‑1 (MQ=255) attaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatTTAGACCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGctagcaaat > 2:1798193‑M2/33‑132 (MQ=255) aaTAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGc < 2:1604016/131‑1 (MQ=255) aagTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGAAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaa > 1:1618792‑M1/2‑129 (MQ=255) aAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACAttt < 1:940681‑M1/109‑1 (MQ=255) gTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaatt > 2:162485‑M1/1‑127 (MQ=255) gTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaatt > 2:2359219‑M1/1‑127 (MQ=255) ttGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCgaataaattt > 1:601353‑M1/1‑126 (MQ=255) ttGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATGAGATCTTTGAAATCTGAACAATGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGGTTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCgaatatttgt > 2:469493‑M1/1‑126 (MQ=255) gtgtTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaatttta < 2:854257‑M1/136‑13 (MQ=255) gtTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCgaataaattttag < 2:75528‑M1/135‑14 (MQ=255) gtTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttag < 1:229967‑M1/135‑14 (MQ=255) gtTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttag < 1:2233078‑M1/135‑14 (MQ=255) tAAGCGATTAACGCATGGACTTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtac > 1:1992103‑M1/1‑120 (MQ=255) tAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtac > 2:1943658‑M1/1‑120 (MQ=255) aaGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtaca > 2:2229366‑M1/1‑119 (MQ=255) aGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaa > 1:585132‑M1/1‑118 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat < 1:1163565‑M1/133‑27 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 1:1962323‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 2:1978380‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 1:1902257‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 1:1560656‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 1:81513‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat < 1:2083276‑M1/133‑27 (MQ=255) aCGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaatattaaat > 1:407644‑M1/1‑110 (MQ=255) aCGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaatattaaat < 2:830555‑M1/136‑27 (MQ=255) acgatttagaccTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCacataaattttagtacaacattaaatgagct > 2:1863696‑M1/6‑105 (MQ=255) aaTTAGCTCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCgaacaaattttagtacaacattaaatgagcttt < 1:1332549‑M1/135‑34 (MQ=255) aaTTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCgaataaattttagtacaacattaaatgagcttt < 2:615929‑M1/135‑34 (MQ=255) aaTTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaatattaaatgagctttt > 1:1373842‑M1/1‑102 (MQ=255) aaTTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaatattaaatgagctttt > 2:1198427‑M1/1‑102 (MQ=255) ttAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaagaaattttagtacaacattaaatgagcttttta < 1:709600‑M1/136‑37 (MQ=255) | GTTACCGATTATGTTATGATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66504‑66738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |