| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_5 | 25 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+415) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGCGTTAATCGCTTAACACAACTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAGAAGTTGTCAACAACTAATTT > TrimmedAssembly_T66_contig_5/1‑160 | tgctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccatgcgttaatcgcttaacacaactTAatcat < 1:974700‑M2/7‑1 (MQ=255)tgctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccatgcgttaatcgcttaacacaactTAatcat < 1:174933‑M2/7‑1 (MQ=255) gctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccatgcgttaatcgcttaacacaactTAatcatc < 1:751430‑M2/8‑1 (MQ=255) gctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccatgcgttaatcgcttaacacaactTAatcatc < 2:1930950‑M2/8‑1 (MQ=255) 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1:2061774‑M2/21‑136 (MQ=255) ttaatcgcttaacacaactTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTgaaga > 1:2328309‑M2/20‑136 (MQ=255) taatcgcttaacacaactTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTgaaga < 1:854257‑M2/117‑1 (MQ=255) atcgcttaacacaactTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAGAAGt > 1:1748105‑M2/17‑136 (MQ=255) tcgcttaacacacctTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAGAAGtt < 2:2132696‑M2/121‑1 (MQ=255) tcgcttaacacaactTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAGAAGtt < 1:489157‑M2/121‑1 (MQ=255) tcgcttaacacaactTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAGAAGtt 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |