| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_18 | = 53854 | 0 (0.000) | 152 (0.530) | 55/258 | 0.8 | 100% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_37 | = 853 | 0 (0.000) | intergenic (‑310/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Mobile element protein/– | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
GGATTGCCGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_37/720‑853 | ggATTGCCGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTa > 1:1577738‑M2/1‑134 (MQ=255) gATTGCCGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCttaa > 1:2443987/1‑133 (MQ=255) aTTGCCGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCttaa < 2:1827659/135‑4 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTGCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 2:1911413‑M2/135‑9 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 2:1842050‑M2/135‑9 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 1:505213‑M2/135‑9 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 2:1959607‑M2/135‑9 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 2:129879‑M2/135‑9 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 2:2119705‑M2/135‑9 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 1:151915‑M2/135‑9 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 2:2124025‑M2/135‑9 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 2:2209031‑M2/135‑9 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgt < 1:185736‑M2/135‑9 (MQ=255) aGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccg < 2:1898908‑M2/136‑12 (MQ=255) aGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccg < 2:2356952‑M2/136‑12 (MQ=255) gctgctTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccg > 2:388174‑M2/1‑124 (MQ=255) tgctTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgt > 1:200739‑M2/1‑122 (MQ=255) tgctTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgt > 1:2172365‑M2/1‑122 (MQ=255) tgctTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgt > 2:754617‑M2/1‑122 (MQ=255) ctTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgata < 2:258273‑M2/136‑17 (MQ=255) aaaTCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTTAACCGGTTCTaagaacgtccgtgataacatc > 1:1712533‑M2/1‑115 (MQ=255) aaaTCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatc < 2:1732093‑M2/136‑22 (MQ=255) aaaTCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatc < 1:1586324‑M2/136‑22 (MQ=255) aaaTCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatc < 2:132303‑M2/136‑22 (MQ=255) gggCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgat > 2:1429271‑M2/1‑110 (MQ=255) gggCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgat > 2:437655‑M2/1‑110 (MQ=255) gggCCGAAGAAGTTCACATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGACCGATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagcacgtccgtgataacatcacgat > 1:442104‑M2/1‑110 (MQ=255) ccGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTa < 2:89819‑M2/108‑2 (MQ=255) ccGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTa > 1:89819‑M2/1‑107 (MQ=255) cGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCttaa > 2:1382843/1‑106 (MQ=255) cGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatca < 2:965987‑M2/134‑29 (MQ=255) cttaGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctc > 2:603415‑M2/2‑103 (MQ=255) agtagTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctc > 2:640964‑M2/3‑103 (MQ=255) aTTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTacgaacgtccgtgataacatcacgatcatctc > 1:1344373‑M2/1‑103 (MQ=255) aTTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctc > 1:2356415‑M2/1‑103 (MQ=255) aTTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctc > 1:473000‑M2/1‑103 (MQ=255) aTTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctc > 1:1310174‑M2/1‑103 (MQ=255) tCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaa > 2:1461148‑M2/1‑97 (MQ=255) cAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagac > 1:1959607‑M2/1‑96 (MQ=255) ggTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctac < 2:1147049‑M2/134‑45 (MQ=255) tGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGTTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacact > 1:861643‑M2/1‑88 (MQ=255) gCCGTGCGGGATTGCAGGGGTAGAACATACCCAAACATCCTATTTCAGAACTATCATATCACATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaa > 2:1822065‑M2/1‑87 (MQ=255) gCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaa > 1:2119705‑M2/1‑87 (MQ=255) cGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaa < 2:2282508‑M2/136‑52 (MQ=255) tGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcg > 1:1842050‑M2/1‑72 (MQ=255) tGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTAGAACTAACATATCAAATAGTCCAGAATTTAAACAGTATCTaataaagtccgtgataacatcacgatcatctcataaagacctacactaaaaactatgctattcg < 2:526175‑M2/136‑65 (MQ=255) ggggTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgg < 1:2241609‑M2/136‑66 (MQ=255) cATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattc < 1:1185065‑M2/135‑74 (MQ=255) cATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcg > 2:1594169‑M2/1‑62 (MQ=255) aTAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattc < 1:1930478‑M2/134‑74 (MQ=255) aGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgt > 2:1519634‑M2/1‑58 (MQ=255) gTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgtt < 1:1158773‑M2/136‑80 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctggg > 1:317157‑M2/1‑51 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 1:2163958‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 1:141524‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 1:1778801‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 2:334138‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 2:2058556‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 2:1656193‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 1:443774‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 1:385027‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaaagatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 2:924897‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTCTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacacaaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 1:456268‑M2/135‑85 (MQ=255) atcCTTTTTTTGAACTAACATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgg < 2:1706807‑M2/135‑85 (MQ=255) tttttttGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccac > 1:132303‑M2/1‑47 (MQ=255) ttttttGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccact > 2:505213‑M2/1‑46 (MQ=255) ttttttGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccact > 2:217067‑M2/1‑46 (MQ=255) tttGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgct < 2:2409767‑M2/136‑94 (MQ=255) ttGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgctt < 1:2163258‑M2/136‑95 (MQ=255) ttGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacaacacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgctt < 1:548724‑M2/136‑95 (MQ=255) gAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgt > 1:2282508‑M2/1‑40 (MQ=255) aCTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcg > 2:1857717‑M2/1‑38 (MQ=255) aCTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcg > 1:2356952‑M2/1‑38 (MQ=255) tatcatatcaAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgagtccctgttgctgggccactgcttgtcgta < 2:735745‑M2/136‑101 (MQ=255) tatcatatcaAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgt > 2:2050740‑M2/1‑36 (MQ=255) tatcatatcaAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgt < 1:2050740‑M2/48‑13 (MQ=255) atatcaAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgataatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaaca < 2:687091‑M2/135‑104 (MQ=255) tatcaAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaact < 1:2205878‑M2/134‑104 (MQ=255) aaTTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctc > 2:2367825‑M2/1‑26 (MQ=255) aaTTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctc < 1:2367831‑M2/58‑33 (MQ=255) aaTTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctc > 2:2367831‑M2/1‑26 (MQ=255) tGTCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtc < 1:2005151‑M2/136‑114 (MQ=255) tCCAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaatacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcg < 2:1522007‑M2/135‑115 (MQ=255) ccAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcgg > 1:2209031‑M2/1‑20 (MQ=255) ccAGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcgg > 2:2205878‑M2/1‑20 (MQ=255) aGATTTTAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggca < 1:213279‑M2/135‑118 (MQ=255) ttttAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgg > 2:1282797‑M2/1‑15 (MQ=255) ttttAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgg > 1:1656193‑M2/1‑15 (MQ=255) ttttAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgg > 1:540749‑M2/1‑15 (MQ=255) ttttAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgg > 1:129879‑M2/1‑15 (MQ=255) ttttAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgg > 2:2422201‑M2/1‑15 (MQ=255) ttttAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgg > 1:249687‑M2/1‑15 (MQ=255) ttttAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgg > 2:1492226‑M2/1‑15 (MQ=255) ttttAAACAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatc > 2:450502‑M2/1‑15 (MQ=255) aaCAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgggataa > 2:347067‑M2/1‑10 (MQ=255) cAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgggataacg < 1:2410199‑M2/136‑129 (MQ=255) cAGGTTCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgggataacg < 1:242185‑M2/136‑129 (MQ=255) ttCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgggataacgatt > 1:1522304‑M2/1‑4 (MQ=255) ttCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgggataacgatt > 2:1930478‑M2/1‑4 (MQ=255) tCTaagaacgtccgtgataacatcacgatcatctcatcaagacctacactaaaaacgatgctattcgggtcgattccctgttgctgggccactgcttgtcgtaactcctgtgcgtcggcatcgggataacgatt < 1:347113‑M2/134‑132 (MQ=255) | GGATTGCCGAGCTGCTTCTAAATCGGGCCGAATTAGTTCAAATTGGTGCCGTGAGGGATTGCTGGGGTAGTTCATAAGTTATCATCCTTTTTTTGAACTATCATATCAAATTGTCCAGATTTTAAACAGGTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_37/720‑853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |