| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
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GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGC < 1:1609221/119‑1 ATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCa > 1:2358346/1‑135 TTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaata < 1:1892818/136‑6 TTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaata < 1:759974/136‑6 ACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGA < 2:1165141/80‑1 ACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGA > 1:13186/1‑80 ACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGA > 1:1165141/1‑80 ACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGA > 1:218690/1‑73 CAGTAATTGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_13/137‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC‑‑‑‑G > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66634‑66738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |