| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_26 | = 3462 | 0 (0.000) | 109 (1.000) | 41/260 | 0.6 | 100% | coding (1/702 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_29 | 1 = | NA (NA) | coding (228/228 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CCATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_26/3332‑3462‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACGG > TrimmedAssembly_T66_contig_29/1‑132 CCATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAAT < 1:2383552/134‑1CCATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAAT < 2:1008545/134‑1CCATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAAT < 2:1569566/134‑1 CATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGT > 2:69133/1‑136 CATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGT > 1:1716733/1‑136 TCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCT > 1:2191076/1‑136 TCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCT > 2:2397008/1‑136 TCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCT > 1:399278/1‑136 TCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCT > 2:2201831/1‑136 TCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCT > 2:1869574/1‑136 GTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTATTTT > 2:2344410/1‑136 GTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTT > 1:1019465/1‑136 GTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTT > 1:506143/1‑136 GTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTT > 2:2282343/1‑136 ACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCA > 1:717604/1‑136 ACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCA > 1:596191/1‑136 ACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATGTGGCA > 2:1119238/1‑136 CTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCAT > 1:460050/1‑136 CTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCAT > 1:1098765/1‑136 GAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCA < 1:1441712/133‑1 GAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTA > 2:227236/1‑136 GAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTA > 1:108965/1‑136 TTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTT < 1:2090026/136‑1 AATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTT > 1:704550/1‑135 AATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTT > 2:965139/1‑135 AATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCGGGTGACCATCTTAGAAGTAAATGGTTTAGAATGGATTGCTTTAAATTGGCATTCAGATTATTTTT > 1:2063705/1‑135 AATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGATTAAGCTAATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTATACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTT > 1:2468064/1‑135 ATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTC < 2:662369/136‑1 CCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACA < 1:596667/136‑1 CCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACA > 1:1657387/1‑136 TGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAAT < 1:1712765/136‑1 TGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAAT < 1:1319959/136‑1 TATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGC < 1:100170/135‑1 TATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGC < 1:379927/135‑1 TATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGC < 1:282852/135‑1 TATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGC < 1:282790/135‑1 TATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGC < 2:1738000/135‑1 TATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGC < 2:1872758/135‑1 TATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGC < 2:2333781/135‑1 CAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCG < 2:1716733/134‑1 aTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTGAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 2:1469199/135‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCACTCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 1:2549745/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 1:724325/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 2:260868/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 1:1695154/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 2:1218453/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 1:1794017/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGATAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 1:1283079/136‑1 TTATAAAGAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 2:459001/136‑1 TAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGTCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATct > 2:2144172/1‑133 TAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATAT > 2:622752/1‑135 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTTAATGGTTTAGAATGGTTTGATTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTGATATTCAGCGTTG < 1:1119238/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 2:1400998/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 2:2422128/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 2:717604/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:277134/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:67800/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:1729070/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTT < 1:982525/135‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGAGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTT < 2:2151948/135‑1 TAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCTTTGG > 2:678940/1‑135 TAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGG > 1:1752777/1‑135 TAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGG > 2:1901547/1‑135 AGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTA < 1:1877393/136‑1 TTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAAT < 1:926748/101‑1 TTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAAT > 2:926748/1‑101 TTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATT < 1:1034553/136‑1 TTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATT < 1:2153240/136‑1 TTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATT < 1:622752/136‑1 TCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTT < 2:1409878/136‑1 TCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTT < 2:635786/136‑1 TCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTT < 1:2397008/136‑1 TCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCAACTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTT < 1:898490/136‑1 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAA > 2:2226472/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTTATTTGGCATTCTGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG < 1:1524145/136‑1 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTTTATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTGGATAAG > 1:1088964/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 1:2496355/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 2:653431/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 1:1678004/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGATGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 1:525346/1‑136 ACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGAC > 2:1585082/1‑136 ACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATG > 1:2027302/1‑39 ATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTC > 1:1258958/1‑136 ATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTC > 1:506576/1‑136 ATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTC > 2:2402573/1‑136 ATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTC > 1:660476/1‑136 CTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGTCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCAT > 1:254665/1‑136 CTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTAAT > 1:2297711/1‑136 CTTAGACGTAAAGGGTTTAGAAAGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCAT < 2:1066099/136‑1 TAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAA > 2:838286/1‑136 ACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAA > 1:135969/1‑136 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 2:590262/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 2:1619475/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 2:1467566/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 1:1627317/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 1:288390/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 1:2070335/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGA > 2:1658388/1‑107 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGA < 1:1658388/107‑1 TTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACGG < 1:227236/136‑1 CCATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_26/3332‑3462‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACGG > TrimmedAssembly_T66_contig_29/1‑132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |