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TTTATTTTTTTCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 2:958043/136‑1 TTTATTTTTTTCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 2:1426092/136‑1 TTTATTTTTTTCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 2:246031/136‑1 TTTATTTATTTCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 2:1186525/136‑1 TATTTTTTTCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAA > 1:370066/1‑136 CCGATTAAAACCACCAGATATTTTGGCAAGCTTTTTTTGCGGCAACCTGGAATATTGTAATTTCTCAAACTGTAGCATAAATAATCCCCCTTGTATGATGTTATTTGAAACAAATTTAGTTTAATTTATTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_27/135‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAA < TrimmedAssembly_T66_contig_34/1203‑1077 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |