New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_15 | = 90630 | 0 (0.000) | 156 (0.990) +AGTTGCGTTGAGGTAATCAACGAACGAT |
48/204 | 0.3 | 80.7% | intergenic (+107/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
? | TrimmedAssembly_T66_contig_17 | 66638 = | 95 (0.560) | intergenic (+352/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
GGCTTGCAATTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_15/90495‑90630 | tGCAATTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagtt < 2:524115‑M1/136‑5 (MQ=255) tGCAATTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagtt < 1:1699817‑M1/136‑5 (MQ=255) tGCAATTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagtt < 1:2212433‑M1/136‑5 (MQ=255) tGCAATTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagtt < 2:1599199‑M1/136‑5 (MQ=255) aTTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgt > 1:1804800‑M1/1‑128 (MQ=255) aTTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgt > 1:555671‑M1/1‑128 (MQ=255) aTTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgt > 1:2226903‑M1/1‑128 (MQ=255) aTTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgt > 1:1643570‑M1/1‑128 (MQ=255) cAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggt > 1:1272038‑M1/1‑122 (MQ=255) aaTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatca > 1:354084‑M1/1‑116 (MQ=255) aaTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatca > 2:408216‑M1/1‑116 (MQ=255) aTTTGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTTATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 2:1547750‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTTGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTCGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 2:2422179‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTATATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 1:846443‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 1:446704‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 1:2008362‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 1:318773‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 2:1325034‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 1:2481444‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 1:1762449‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 1:1602580‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 2:438617‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 1:1409586‑M1/136‑22 (MQ=255) aTTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaac < 1:1364467‑M1/136‑22 (MQ=255) ttAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgattt < 2:1001949‑M1/136‑31 (MQ=255) ttAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgattt < 2:457038‑M1/136‑31 (MQ=255) ttAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgattt > 1:2386906‑M1/1‑106 (MQ=255) ttgAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaa > 1:2183686‑M1/1‑93 (MQ=255) gAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAACTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaa > 2:797292‑M1/1‑91 (MQ=255) aGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAAGTTGATATGATGATTAagtggcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactg > 1:1868097‑M1/1‑90 (MQ=255) aGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaacactg > 2:911576‑M1/1‑90 (MQ=255) aGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactg > 2:1406225‑M1/1‑90 (MQ=255) aGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactg > 1:1018617‑M1/1‑90 (MQ=255) ggCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAAGTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactga > 2:1128640‑M1/1‑89 (MQ=255) cgcACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaac > 1:2247889‑M1/1‑87 (MQ=255) cgcACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactga < 2:1231744‑M1/134‑48 (MQ=255) cacaAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCCACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACCAGGTGTGGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgtaaactgaacaa > 2:863391‑M1/1‑85 (MQ=255) cacaAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaa > 1:625577‑M1/1‑85 (MQ=255) cacaAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaa > 1:926019‑M1/1‑85 (MQ=255) cacaAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaa > 1:1126018‑M1/1‑85 (MQ=255) cacaAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgattt < 2:66582‑M1/115‑31 (MQ=255) aaaGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaactatttagacctttgaaaactgaacatagt > 2:821255‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagt > 2:716099‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagt > 1:1926478‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagt > 2:269503‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagt > 1:152726‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagt > 1:339704‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagt > 2:2049757‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagt > 2:173713‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGAGGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagt > 1:1615237‑M1/1‑82 (MQ=255) aGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagttt < 1:1472426‑M1/136‑57 (MQ=255) aGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagttt < 2:1622937‑M1/136‑57 (MQ=255) aGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtt > 2:1475356‑M1/1‑80 (MQ=255) aGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtt > 1:295428‑M1/1‑80 (MQ=255) aGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtt > 1:1694529‑M1/1‑80 (MQ=255) aGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtt > 2:1786217‑M1/1‑80 (MQ=255) aGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtt > 1:680065‑M1/1‑80 (MQ=255) aGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaa < 1:2405669‑M1/100‑21 (MQ=255) ggTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcg > 2:43139‑M1/1‑77 (MQ=255) ggTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcg > 1:834870‑M1/1‑77 (MQ=255) ggTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcg > 1:106315‑M1/1‑77 (MQ=255) ttAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacg > 2:126459‑M1/1‑75 (MQ=255) gCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaa > 2:1863617‑M1/1‑72 (MQ=255) gCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaa > 2:1246588‑M1/1‑72 (MQ=255) gCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaa > 2:1175640‑M1/1‑72 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 2:2226903‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 2:2386902‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 2:1968632‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 2:30840‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 1:1011049‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 1:395110‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 1:43139‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 1:2255491‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 1:469238‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 2:1522889‑M1/134‑65 (MQ=255) cGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaat < 1:2066060‑M1/134‑65 (MQ=255) tgcttCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTTACAAGATGATGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatg < 1:2146679‑M1/136‑71 (MQ=255) gcttCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacagagtttcgacgaatcaaatgt > 1:1917891‑M1/1‑65 (MQ=255) cGAAAATTAATCATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtc < 2:688159‑M1/136‑80 (MQ=255) aaaaTTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtc > 2:428152‑M1/1‑55 (MQ=255) taattaTAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgat > 2:1690907‑M1/1‑50 (MQ=255) taattaTAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATAGGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgat > 1:875553‑M1/1‑50 (MQ=255) ataAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttga < 1:2300594‑M1/136‑92 (MQ=255) ataAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttga < 1:795270‑M1/136‑92 (MQ=255) aTGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacattt > 2:656043‑M1/1‑26 (MQ=255) tGTTGATACCTTGTTATTATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttatacctttgaaaactgaacaaattttcgtctaatcaaatgtgttgggtctcttgattttgaatctagagcaaaaaatttg < 2:1881554‑M1/135‑111 (MQ=255) tGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacatttg < 1:582239‑M1/135‑111 (MQ=255) tGTTGATAACTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacattt < 2:1608626‑M1/134‑110 (MQ=255) aCTTGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacatgtgcgaagtcaa > 2:892029‑M1/1‑17 (MQ=255) tGATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacatttgcgaagtcaattc > 2:1846748‑M1/1‑14 (MQ=255) gATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacatttgcgaagtcaattc > 2:639450‑M1/1‑13 (MQ=255) gATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacatttgcgaagtcaattc > 2:1399385‑M1/1‑13 (MQ=255) gATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacatttgcgaagtcaattc > 2:209075‑M1/1‑13 (MQ=255) gATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacat < 1:2006608‑M1/120‑108 (MQ=255) gATATGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacat > 2:2006608‑M1/1‑13 (MQ=255) atatGATGATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacatttgcgaagtcaattc > 2:2314358‑M1/1‑12 (MQ=255) atgatgATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagttt > 2:2368848‑M1/1‑10 (MQ=255) atgatgATTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagttt < 1:2368848‑M1/66‑57 (MQ=255) tgatTAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacatttgcgaagtcaattcgctagcaa < 1:1177068‑M1/136‑131 (MQ=255) tAagttgcgttgaggtaatcaacgaacgatttagacctttgaaaactgaacaaagtttcgacgaatcaaatgtgtagggtctcttgattttgaatcaagagcaaaacatttgcgaagtcaattcgctagcaaataa > 2:470275‑M1/1‑2 (MQ=255) | GGCTTGCAATTTATCAGGATAATTGGTAAATTAGTATACGTTGTTGAGGCGCACAAAGCGGTTAGCCGCTTGCTTCCAACGAAAATTAATTATAAAAAGTTGTTGACAAGATGTTGATAACTTGATATGATGATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_15/90495‑90630 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |