| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 806 total aligned reads displayed.
GTTACCGATTATGTTATGATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66504‑66738 | ttagtatacgttgttgaggcgcacaaagcggttagccgcttgcttccaacgaaaattaattataaaaagttgttgacaagatgttgataacttgatatgatgattaagttgcgttgaggtaatcaacgaacgattt > 2:940306‑M2/135‑136 (MQ=255)attattatgaatattcaaattgatgtgagcatttacattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgattt < 1:2198187‑M1/2‑1 (MQ=255)attattatgaatattcaaattgatgtgagcatttacattgaatagttattcaaaataatttataaaaagatgttgacagcttgttctgatgatgataaactttaatagttgcgttgaggtaatcaacgaacgattt < 1:653624‑M1/2‑1 (MQ=255) ggtaagatagtttctgttgtcgcaacggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTa < 1:1453914‑M1/31‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |