| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | 16208 = | 60 (0.350) | 81 (0.570) | 41/214 | 1.0 | 53.2% | intergenic (‑66/‑80) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | 16359 = | 93 (0.660) | coding (72/117 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TATTGCGAGTGAAACGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16229‑16483 | tatTGCGAGTCAACCGTTGACATACCGGAGCTCGTCAACGATACGGTTATCGAGCGGCCATGACGAATCGTAACAAAAATATTGATTTAACACGAATCAATTCGCACGATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAatt < 2:968737/136‑1 (MQ=255)tagtgcgaattgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAatt < 1:383246‑M2/6‑1 (MQ=255)tagtgcgaattgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAatt < 1:128751‑M2/6‑1 (MQ=255) gaattgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAg < 1:105043‑M2/12‑1 (MQ=255) gaattgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAg < 2:55025‑M2/12‑1 (MQ=255) gaattgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAg < 1:646661‑M2/12‑1 (MQ=255) gaattgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAg < 1:354124‑M2/12‑1 (MQ=255) gaattgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAg < 1:1007727‑M2/12‑1 (MQ=255) gAGTGAAACGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAg < 1:562406/136‑1 (MQ=255) attgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGa < 1:1927725‑M2/13‑1 (MQ=255) attgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGAc < 1:1954649‑M2/14‑1 (MQ=255) attgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGAc < 1:1193135‑M2/14‑1 (MQ=255) ttgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACg < 1:20101‑M2/15‑1 (MQ=255) gAAACGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGACTCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCTATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCTTGCGAATCAATTATTAAGAc < 1:15081/134‑1 (MQ=255) gAAACGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGAc < 2:267436/134‑1 (MQ=255) gAAACGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGAc < 1:308609/134‑1 (MQ=255) cGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAg < 1:804428/136‑1 (MQ=255) aaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATAtt > 2:1366934‑M2/110‑136 (MQ=255) caatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGtt > 1:1104548‑M2/106‑136 (MQ=255) gAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTa > 1:1815622/1‑135 (MQ=255) ggTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAAc < 2:623226/135‑1 (MQ=255) gtcAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACt > 1:716234/1‑136 (MQ=255) gtcAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACt > 2:454402/1‑136 (MQ=255) gtcAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACt > 1:856465/1‑136 (MQ=255) gatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACttt > 2:194102‑M2/96‑136 (MQ=255) tacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttat < 1:1316311‑M2/43‑1 (MQ=255) tacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaatgaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttat < 1:2561286‑M2/43‑1 (MQ=255) aGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttat < 1:222542/136‑1 (MQ=255) aGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttat < 2:2021609/136‑1 (MQ=255) aTACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttatt < 2:1165635/134‑1 (MQ=255) aTACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttatt < 2:2466285/134‑1 (MQ=255) tACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAAc < 1:1355678/136‑1 (MQ=255) tcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACaa < 1:1270883‑M2/49‑1 (MQ=255) cGGTTATCGAGCGGCAATGACGACTCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTGACaa > 1:901628/1‑136 (MQ=255) cGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACaa > 1:2120277/1‑136 (MQ=255) ggTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAat > 2:667480/1‑136 (MQ=255) gccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAAtattatta < 1:241537‑M2/57‑1 (MQ=255) aGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAAtattattat > 1:2537028/1‑136 (MQ=255) aGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAAtattattat > 2:2352133/1‑136 (MQ=255) aGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAAtattattat > 2:837206/1‑136 (MQ=255) cgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATattattatt > 2:2064387‑M2/78‑136 (MQ=255) ggCTATGACGAATCGTATCAAAAATATTTATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATATTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATattattatt < 1:138056/134‑1 (MQ=255) ggCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATattattatt < 1:193726/134‑1 (MQ=255) ctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGc > 2:504190‑M2/76‑136 (MQ=255) cAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCAt > 1:950890/1‑136 (MQ=255) cAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCAt > 1:1973269/1‑136 (MQ=255) cAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAAACAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTTTTAAGACGAATAGTTATATTTGTGAACAATCTTTAGTAACACTATTATTATTGCAt > 1:545748/1‑136 (MQ=255) gataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATa > 2:82674‑M2/73‑136 (MQ=255) gataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTAAATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATa > 1:1478987‑M2/73‑136 (MQ=255) tCGTATCAAACATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACaaaa < 1:2276694/136‑1 (MQ=255) tccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAAt < 1:2000949‑M2/74‑1 (MQ=255) tccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAAt < 1:1656522‑M2/74‑1 (MQ=255) ccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAAtt > 2:2270566‑M2/62‑136 (MQ=255) tATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAatt > 1:1862599/1‑66 (MQ=255) tATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAatt < 2:1862599/66‑1 (MQ=255) gacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTaca < 1:1235505‑M2/79‑1 (MQ=255) cAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTac > 2:1503042/1‑135 (MQ=255) aaaaaTATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTacac < 1:454402/136‑1 (MQ=255) aaaaTATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTAcaca > 2:1635751/1‑136 (MQ=255) aaaaTATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTAcaca > 2:1483227/1‑136 (MQ=255) gacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATATACACaa > 1:2533400‑M2/55‑136 (MQ=255) acctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACaaa > 2:1108535‑M2/54‑136 (MQ=255) acctcaaataagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACaaa > 2:1441738‑M2/54‑136 (MQ=255) ttaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACttt > 1:527871‑M2/47‑136 (MQ=255) ttAACAGTAATCAATTAGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATAATTTCTTAAGTCTAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAAAAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATATCTTTGa < 2:407937/136‑1 (MQ=255) ttAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTCTTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTg > 2:1233028/1‑135 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:1454451‑M2/97‑1 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc > 2:1751356‑M2/40‑136 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc > 2:301224‑M2/40‑136 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:1104548‑M2/97‑1 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:2318026‑M2/97‑1 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:862109‑M2/97‑1 (MQ=255) acgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCg > 2:1906325‑M2/39‑136 (MQ=255) cgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCgg < 1:691655‑M2/99‑1 (MQ=255) taTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:696867/132‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:1973269/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:243997/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:382663/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:856465/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:2230825/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:1483227/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:1573828/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:1341433/133‑1 (MQ=255) tttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTc > 1:1765990‑M2/36‑136 (MQ=255) aaTTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:1683890/129‑1 (MQ=255) ctcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGt > 1:2513487‑M2/31‑136 (MQ=255) tCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGtt < 1:615827/136‑1 (MQ=255) cgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATattattatt < 1:66851‑M2/59‑1 (MQ=255) cgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGttt < 2:1358145‑M2/108‑1 (MQ=255) cGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGttt < 2:2225942/136‑1 (MQ=255) atatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACaaaa > 2:1466866‑M2/25‑97 (MQ=255) atatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACaaaa < 1:1466866‑M2/73‑1 (MQ=255) atttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTgg > 2:261609‑M2/23‑136 (MQ=255) taaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCaaaaa < 2:1712255‑M2/121‑1 (MQ=255) taaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCaaaaa < 1:2352133‑M2/121‑1 (MQ=255) taaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCaaaaa < 2:1815622‑M2/121‑1 (MQ=255) taaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCaaaaa < 1:48514‑M2/121‑1 (MQ=255) taaaaatcaagcgtaTCAAATATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCaaaaa < 2:2549123‑M2/121‑1 (MQ=255) aaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATa > 2:1047505‑M2/13‑135 (MQ=255) aatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGc < 2:2559995‑M2/125‑1 (MQ=255) | TATTGCGAGTGAAACGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16229‑16483 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |