New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
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aTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGAT < 2:1540385/135‑1 aTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGAT < 2:364295/135‑1 aTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGAT < 2:724110/135‑1 TACACAAGATATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATACA < 2:559149/136‑1 ACACAAGATATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATACAC < 2:161784/136‑1 ACACAAGATATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATAC > 2:1988877/1‑134 CACAAGATATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATAC > 1:1383398/1‑133 CAAGATATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATACACTGC < 1:850473/136‑1 AAGATATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATACACTGCC < 1:960312/136‑1 TATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATACACTGCCCC < 2:884650/134‑1 TATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATACACTGCCCC < 1:624219/134‑1 ATTTTACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTA > 2:1829192/1‑113 ACGCTCTCTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATACACTGCCCCAATCATC > 1:547641/1‑135 CTAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATATTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATACACTGCCCCAATCATCCCAGCATC > 2:621874/1‑136 GTGGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_1/88480‑88613 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAAAAACATCTAGCATTCAAGCTTTTTCATTTTTTAAATTAAAATACGTGTCACCCTATTTTAATAAACCAGTTTGATCCGCCTTTTTAACCACGCTTAATCAACTGATACACTGCCCCAATCATCCCAGCATC < TrimmedAssembly_T66_contig_24/19315‑19181 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |