New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_1 | = 88613 | 132 (0.880) | 168 (0.950) | 64/262 | 0.0 | 71.8% | coding (224/300 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
? | TrimmedAssembly_T66_contig_40 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+211) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_1/88482‑88613 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAATTAAATTTAAGT > TrimmedAssembly_T66_contig_40/1‑135 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCATAAATCTTGTATGCATTTACACAATATATTTTACGCTCTCTATT > 2:2056248/1‑136 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 1:1050337/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 1:2453855/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 1:322334/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 1:431771/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 1:518707/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 1:1543316/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 1:1024998/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 2:1369792/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 2:173934/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 2:527263/136‑1 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATT < 2:544395/136‑1 TAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTAC > 1:1600654/1‑136 AGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACAC > 1:610828/1‑136 TCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACA < 1:2321650/136‑1 TCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACA > 1:1868972/1‑136 TCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACACTCTCTATTACACACA > 2:448741/1‑136 CATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACAT < 1:1691/136‑1 TTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGA < 1:789912/136‑1 CATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGG > 2:2482901/1‑136 CATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGG > 2:1893200/1‑136 AATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAAT > 1:2261581/1‑136 AATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAAT > 1:2151012/1‑136 ATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCGGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAAT < 1:778899/135‑1 ATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAAT < 2:1595141/135‑1 ATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAAT < 2:1579519/135‑1 CTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTAAACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGTTGTTAATAATAT > 2:1034663/1‑136 CCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATAT > 1:2115288/1‑136 CCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATAATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATAT > 2:2378441/1‑136 GTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTA > 1:1269848/1‑136 TGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAA > 2:142011/1‑136 GTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTCTACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATT < 2:1232865/136‑1 TTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGATCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATAATTAATATTTG > 1:1575962/1‑136 TTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTGATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTG < 2:2282157/136‑1 TTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGT > 2:1800349/1‑136 TCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTT > 1:1468991/1‑136 TGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTAT > 2:2143366/1‑136 TGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTAT > 2:2135085/1‑136 GGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTAT < 2:610828/136‑1 ACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATT > 2:2511453/1‑136 TAAATCTCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAA < 1:1612337/136‑1 AAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAAT > 2:500811/1‑136 AAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATT > 2:116492/1‑136 GCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTT > 1:2479814/1‑135 GCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTT > 1:266368/1‑135 CATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTT < 1:378321/134‑1 CATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATATTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTATCTATTAAACACATGAGGTGTTAATAATATATTTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTT < 1:431687/134‑1 CATTCCCTATTTATATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTT < 2:2400225/134‑1 ATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATTTTTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGATATTTTATTTTgat > 2:2209748/1‑133 ATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCT > 1:1676289/1‑136 ATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCT < 1:1721247/136‑1 ATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTC < 2:1868972/135‑1 ATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAA < 1:933281/116‑1 CTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAG > 1:844487/1‑135 TATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGAC > 2:42414/1‑136 ATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACG > 1:1816618/1‑136 TTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGG < 2:101102/136‑1 TTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGG < 1:492838/136‑1 TTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGG < 1:2128098/136‑1 TCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTA < 1:870626/136‑1 CTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAAGTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTAC > 1:936242/1‑136 TATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACT < 2:1751184/136‑1 ACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTC > 1:550115/1‑136 ACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTC < 1:2482901/136‑1 AATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCAT > 2:455542/1‑136 AATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCAT > 1:1132798/1‑136 AATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCAT > 2:963474/1‑136 AATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCAT > 2:983297/1‑136 AATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCAT > 1:7092/1‑136 AATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCAT > 1:723742/1‑136 AATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCAT > 1:2244652/1‑136 AATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCAT > 1:1401778/1‑136 AATTCAGAAAACTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTCTAGACGGTACTGTCAT > 2:1759342/1‑136 cAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAA > 1:2041917/2‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 1:1917370/1‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 2:822354/1‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 1:1357970/1‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 1:667738/1‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 1:1161389/1‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 1:1952998/1‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 2:2384339/1‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 1:355758/1‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 2:348075/1‑136 AGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT > 1:1730521/1‑136 AATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT < 1:116492/133‑1 AATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT < 2:2320989/133‑1 AATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAAT < 2:1730521/133‑1 TGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAA < 2:290146/136‑1 TGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAA < 2:1269029/136‑1 ACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAG > 1:2036566/1‑136 ACACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAG < 1:1758106/136‑1 CACAAGATATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTATATTTTTCTATATACGGTACTGTCATAAAATAGTCAGTGTTAATCGGAAGA > 2:833626/1‑136 ATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAA > 1:1910669/1‑136 ATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAA > 1:410186/1‑136 ATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAA > 2:2138336/1‑136 ATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAA > 2:1093176/1‑136 ATTTTACGCTCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAA > 2:1473337/1‑136 TCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAATTAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGTATTAAATTTA < 1:2518905/136‑1 TCTCTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAATTAAATTTA < 2:355758/136‑1 CTATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAATTAAATTTAAGT > 2:1407717/1‑136 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_1/88482‑88613 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTACACACATGAGGTGTTAATAATATATGTAATATTTGTTATTATTATTAATTATGCTATTTTATTTTTCTATAGACGGTACTGTCATAAAATAGTGAGTGTTAATCGGAAGATAAAGGAATTAAATTTAAGT > TrimmedAssembly_T66_contig_40/1‑135 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |