| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
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GTTAATCGCTTAACACAACTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAG > 1:383737/1‑136 GTTAATCGCTTAACACAACTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTG > 1:426524/1‑133 GTTAATCGCTTAACACAACTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTAATGAAG > 2:683923/1‑136 TAATCGCTTAACACAACTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAGAA < 2:1685253/136‑1 ATCGCTTAACACAACTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAGAAGT > 1:2246610/1‑136 TCGCTTAACACAACTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAGAAGTT < 2:268781/136‑1 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‑CGCTAGCGAATTGACTTCGCAAATGTTTTGCTCTTGATTCAAAATCAAGAGACCCTACACATTTGATTCGTCGAAACTTTGTTCAGTTTTCAAAGATCTAATTCCGTGCGTTAATCGCTTAACACAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_17/66738‑66610‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgcgttaatcgcttaacacaactTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCGTGGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTACTGAAGAAGTTGTCAACA > TrimmedAssembly_T66_contig_5/25‑152 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |