New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_2 | = 291973 | 0 (0.000) | 182 (0.370) +GGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACT |
37/142 | 0.5 | 100% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
? | TrimmedAssembly_T66_contig_36 | = 864 | 0 (0.000) | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Transposase/– |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
AACGCTATGGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_2/291839‑291973 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTC < TrimmedAssembly_T66_contig_36/864‑796 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| atCGCTATGGACTAAAAATGTTTGTATTAAGTTTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCTGTGTCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATATGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCG < 2:2047893/134‑1 CGCTATGGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGT < 2:1219893/136‑1 ATGGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCG < 1:761542/136‑1 GGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTC > 1:398507/1‑136 ACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAA > 2:139637/1‑136 ACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAA > 2:1156576/1‑136 ACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAA > 2:2262275/1‑136 ACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAA > 2:668696/1‑136 GAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGA < 1:2460589/136‑1 ATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTT > 2:251211/1‑136 ATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTT > 1:450483/1‑136 ATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTT > 2:653785/1‑136 ATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTT > 2:800172/1‑136 GTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGT < 2:1618214/136‑1 GTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAA > 2:2470330/1‑136 GTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAA > 1:2188851/1‑136 AGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAAT < 1:2411854/136‑1 TTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGC < 1:1712083/136‑1 TTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCT < 1:653797/136‑1 TTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCT < 1:1022198/136‑1 GAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTC < 1:1450504/136‑1 CAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTAC < 2:166089/136‑1 CAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTAC < 1:1139112/136‑1 TTCTAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACGTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTAC < 2:2085502/132‑1 TTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGTGTTGGATAAGGTAGAACTGAATGATGTGCCTAATCGGGAGGCGGTAGCGGCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACttct > 2:1404298/1‑132 TTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATAT < 2:2318822/136‑1 aCAAGTCATTGACTTTGTAGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGTGAGGCGGTAGCGTAAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATA > 2:1370996/2‑136 TCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATA < 1:881291/136‑1 ACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTA > 2:322793/1‑136 ACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTA > 2:1878480/1‑136 ACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTA > 2:73552/1‑136 TGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTT < 1:2306157/136‑1 CGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAA > 1:2528905/1‑136 CGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAA < 1:1811268/135‑1 CGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTC > 2:2133545/1‑109 GGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAAT > 1:1152207/1‑136 GGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAA < 2:219530/136‑1 GGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAA < 2:277162/136‑1 GGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAA < 1:1757241/136‑1 GGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAA < 1:344159/136‑1 GGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAA < 1:1899787/136‑1 GGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAA < 2:2413326/136‑1 GGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACCGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAA < 1:975470/136‑1 aCAGACACTTTTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTT < 2:1182169/135‑1 CCAGACACTTTTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGTTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTT < 2:2279989/136‑1 CCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTT < 1:1943571/136‑1 CACTTGTTGTTGAGTTTGATAAGTTAGAACTTAATGATGTGACTAATAGGGAGTCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTAAATATAATATGTATCTAACTTAATTAAATGATGCTTCC < 2:608748/133‑1 CACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGATCTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTAGTACATATAATATGTATCTATCTTAAATAAATGATGCTTCC < 1:1072540/133‑1 CACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAATTGATGCTTCC < 1:800172/133‑1 CACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCC < 2:1306024/133‑1 CACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCC < 2:1342676/133‑1 CACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCC < 2:1086074/133‑1 CACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCC < 2:1136964/133‑1 ACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGG > 2:1024382/1‑136 ACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGG > 1:52957/1‑136 CTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCC > 1:853265/1‑131 CTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCC < 2:853265/131‑1 TGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCT < 2:1591885/136‑1 TGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCT < 1:2345286/136‑1 TGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGCGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCT < 2:523035/136‑1 GATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGACTCTTGTGTAAATGTCATGCCTTCGTACATTTATTATGTATCTATCTTAAATAACTGCTGCTTCCAAGGTGTCCTG < 1:1117264/136‑1 GATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTG < 2:1931528/136‑1 GATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTG > 2:725231/1‑136 GATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTG > 1:1037371/1‑136 GATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTG > 1:1284296/1‑136 GATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAA < 1:2249631/127‑1 GGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTT > 1:705784/1‑136 GGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTT > 1:142323/1‑136 TAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGA < 1:577124/136‑1 TAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGA < 2:1050990/136‑1 AGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTC < 2:828567/136‑1 CTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTG < 2:1286455/136‑1 TGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGG > 2:1645713/1‑136 TGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGG < 1:1631294/136‑1 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 1:1238839/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 2:901539/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 1:14615/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 1:1561360/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 2:940078/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 2:431844/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 2:396581/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 2:1701728/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 1:2132495/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 2:2014724/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 1:2390530/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 2:23667/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 1:32262/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 1:372397/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 1:92316/1‑135 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTG < 1:1595630/130‑1 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTC > 2:1478085/1‑57 GATGTGACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAAGGCCTTCGTACATCTAATATGTATCGAACTTAAATAAATGATGCTTCCATGGAGTCCTGGAGTCCTTGGAACGGTCGGTGGATCC > 2:2433182/1‑135 GATGTGACTAAGCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAACTGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCC > 2:1846124/1‑135 GACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCC < 2:2072222/93‑1 GACTAATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCC > 1:2072222/1‑93 ATCGGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGAC < 2:372675/136‑1 GGGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACT > 1:1331150/1‑134 GGAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTC > 1:2149894/1‑135 GAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAA < 1:836109/73‑1 GAGGCGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTTAAATAAA > 2:836189/1‑73 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AACGCTATGGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_2/291839‑291973 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTC < TrimmedAssembly_T66_contig_36/864‑796 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |