| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_13 | 1 = | 0 (0.000) | 95 (0.480) | 44/256 | 0.9 | 69.8% | intergenic (–/‑320) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_17 | 66634 = | 82 (0.520) | intergenic (+348/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCATAGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAAT > TrimmedAssembly_T66_contig_13/1‑132 | tgctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAatcat > 2:1659417‑M1/106‑136 (MQ=255)tgctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAatcat > 2:1732612‑M1/106‑136 (MQ=255)tgctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAatcat > 2:1732634‑M1/106‑136 (MQ=255)tgctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAatcat > 2:1732636‑M1/106‑136 (MQ=255) 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gaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAAc > 1:516817‑M1/99‑135 (MQ=255) gaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACa < 1:1624461‑M1/38‑1 (MQ=255) gaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACa > 1:2378487‑M1/99‑136 (MQ=255) gaattgacttcgaaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAAc > 1:516869‑M1/99‑135 (MQ=255) attgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttctgttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACAt > 2:307021‑M1/97‑135 (MQ=255) attgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACAt > 2:307238‑M1/97‑135 (MQ=255) 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ttccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCATAGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAAt > 2:297112‑M1/5‑136 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCATAGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAAT > TrimmedAssembly_T66_contig_13/1‑132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |