| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_31 | 1 = | 0 (0.000) | 184 (0.620) | 59/262 | 0.1 | 100% | intergenic (–/+71) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_34 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑119) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGTGAAATTCCCCCG > TrimmedAssembly_T66_contig_31/1‑135 | tcttaattcgggtcatgaagatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggc > 1:740068‑M1/136‑136 (MQ=255) cttaattcgggtcatgaagatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCt < 1:1260629‑M1/2‑1 (MQ=255) aattcgggtcatgaagatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatctaggCtttt < 2:783796‑M1/5‑1 (MQ=255) aattcgggtcatgaagatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCtttt < 1:2521678‑M1/5‑1 (MQ=255) aattcgggtcatgaagatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCtttt > 1:895423‑M1/132‑136 (MQ=255) aattcgggtcatgaagatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctgtttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCtttt < 2:705443‑M1/5‑1 (MQ=255) tcgggtcatgaagatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAAt < 1:264747‑M1/8‑1 (MQ=255) catgaagatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTcc < 2:1406786‑M1/14‑1 (MQ=255) catgaagatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTcc > 2:1260629‑M1/123‑136 (MQ=255) agatacctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCAt < 1:1073310‑M1/19‑1 (MQ=255) cctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTg > 1:1149715‑M1/113‑136 (MQ=255) ctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGa > 2:2236322‑M1/112‑136 (MQ=255) ctctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGa < 1:436923‑M1/25‑1 (MQ=255) tctttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGaa < 2:285235‑M1/26‑1 (MQ=255) tttcttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGaa < 1:2231899‑M1/26‑1 (MQ=255) cttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATctct < 1:805250‑M1/31‑1 (MQ=255) cttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATctct < 2:2477605‑M1/31‑1 (MQ=255) cttgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATctct < 1:2430910‑M1/31‑1 (MQ=255) tgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCttt < 1:690209‑M1/33‑1 (MQ=255) tgtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCttt < 1:2019127‑M1/33‑1 (MQ=255) gtttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCtttt < 1:312450‑M1/34‑1 (MQ=255) ttgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCtttttt > 2:121223‑M1/101‑136 (MQ=255) tgtggtgaattaagaataggtcttcatggcctatttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCtttttt < 2:336213‑M1/36‑1 (MQ=255) gtggtgaattaagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaatattaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGc < 2:1135170‑M1/38‑1 (MQ=255) taagaataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAattcat < 2:1633035‑M1/47‑1 (MQ=255) ataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGt > 2:1487810‑M1/85‑135 (MQ=255) ataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGt > 2:1024866‑M1/85‑135 (MQ=255) ataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGt > 2:400669‑M1/85‑135 (MQ=255) ataggtcttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGt > 1:396917‑M1/85‑135 (MQ=255) ttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCt < 1:1178813‑M1/59‑1 (MQ=255) ttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCt < 2:1479797‑M1/59‑1 (MQ=255) ttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCt < 2:1903292‑M1/59‑1 (MQ=255) ttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCt < 2:2203048‑M1/59‑1 (MQ=255) ttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCt < 1:1913562‑M1/59‑1 (MQ=255) ttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCt < 2:485140‑M1/59‑1 (MQ=255) ttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCt < 2:571597‑M1/59‑1 (MQ=255) ttcatggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatagaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTATTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCt < 1:587297‑M1/59‑1 (MQ=255) catggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTa > 2:167454‑M1/76‑136 (MQ=255) atggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTaa > 1:861104‑M1/75‑136 (MQ=255) ggcctttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTaaa < 2:2024489‑M1/63‑1 (MQ=255) ggcctttttgactagtctgaataaagaacaggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCTTGATTTGCTTaaa < 2:1365401‑M1/63‑1 (MQ=255) ttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTa < 1:1003712‑M1/68‑1 (MQ=255) ttttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTa < 1:1521928‑M1/68‑1 (MQ=255) ttgactagtctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCa > 1:2130263‑M1/66‑136 (MQ=255) tctgaataaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACAttt < 1:393320‑M1/79‑1 (MQ=255) aaagaactggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCAcattttcatttt < 1:178413‑M1/86‑1 (MQ=255) actggtctagtagtgcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATACGTTATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATGTTCAATGTTTGCa < 2:24328‑M1/91‑1 (MQ=255) actggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGt < 2:2111023‑M1/51‑1 (MQ=255) actggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTg > 2:1546744‑M1/46‑134 (MQ=255) actggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTg > 1:22522‑M1/46‑134 (MQ=255) actggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTg > 2:215370‑M1/46‑134 (MQ=255) actggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTg > 1:148474‑M1/46‑134 (MQ=255) actggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTg > 1:1558624‑M1/46‑134 (MQ=255) actggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCa < 1:648253‑M1/91‑1 (MQ=255) actggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCa < 2:1355881‑M1/91‑1 (MQ=255) actggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTATAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCa < 2:269865‑M1/91‑1 (MQ=255) actggtcgagaagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTg > 2:1049783‑M1/46‑134 (MQ=255) ggtctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAgtt > 1:1639266‑M1/43‑136 (MQ=255) tctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAgttgt < 1:1827597‑M1/96‑1 (MQ=255) tctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAgttgt < 1:1432517‑M1/96‑1 (MQ=255) tctagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGATTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAgttgt < 1:2301701‑M1/96‑1 (MQ=255) tagtagagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAgttgtt < 2:1820787‑M1/97‑1 (MQ=255) gagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAAt < 2:1612664‑M1/102‑1 (MQ=255) gagcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAAt < 2:1771558‑M1/102‑1 (MQ=255) gagcaggtgatgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGACAAATTCATTCTTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAAATATTGAAGTTGTTCCAAt < 2:1369337‑M1/102‑1 (MQ=255) gcaggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATcc > 2:1788732‑M1/32‑135 (MQ=255) ggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTATTTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTT‑CAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 1:1659271‑M1/107‑1 (MQ=255) ggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 1:2109932‑M1/108‑1 (MQ=255) ggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 1:222336‑M1/108‑1 (MQ=255) ggtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 2:59344‑M1/108‑1 (MQ=255) gtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 2:2310867‑M1/108‑1 (MQ=255) gtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 1:1234369‑M1/108‑1 (MQ=255) gtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 1:1628297‑M1/108‑1 (MQ=255) gtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 2:1771086‑M1/108‑1 (MQ=255) gtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 1:948771‑M1/108‑1 (MQ=255) gtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGcc < 1:948781‑M1/108‑1 (MQ=255) gtgttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCAAATCCCGcc < 2:50764‑M1/108‑1 (MQ=255) gttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTg > 1:512956‑M1/26‑114 (MQ=255) gttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTg < 2:512956‑M1/89‑1 (MQ=255) ttgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGccacca < 2:1411419‑M1/112‑1 (MQ=255) tgcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGccacca < 2:1692407‑M1/112‑1 (MQ=255) gcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAAc < 1:1743539‑M1/114‑1 (MQ=255) gcacttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAAc < 1:751698‑M1/114‑1 (MQ=255) cttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGAt < 2:661573‑M1/117‑1 (MQ=255) cttcaattttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGAt < 1:1436119‑M1/117‑1 (MQ=255) attttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCg < 1:1932988‑M1/122‑1 (MQ=255) attttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCg < 1:1348832‑M1/122‑1 (MQ=255) ttttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGt < 2:124036‑M1/123‑1 (MQ=255) ttttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGt < 2:1160775‑M1/123‑1 (MQ=255) ttttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGt < 2:1382374‑M1/123‑1 (MQ=255) ttttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGt < 2:2392566‑M1/123‑1 (MQ=255) ttttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGt < 2:2380957‑M1/123‑1 (MQ=255) ttttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGt < 1:485236‑M1/123‑1 (MQ=255) ttttaaatcgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTGTTTGCCCAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTACAATCCCGCCACCAACGATGTTCGt < 2:40953‑M1/123‑1 (MQ=255) cgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGTGAAATTcc > 2:1444511‑M1/6‑136 (MQ=255) cgaggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGTGAAATTc < 2:868095‑M1/130‑1 (MQ=255) cgaggCTTTTAAATTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTAAATCGAGATTTGATTAAATCTTAGCATCACATTAACAATTTTTGCAGTTGATCCAATACAGCCACCACCGATGTTAGTCAAatta < 1:2282083‑M1/130‑2 (MQ=255) ggCTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGTGAAATTcccc > 2:1932988‑M1/3‑135 (MQ=255) cTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGt < 2:2087745/51‑1 (MQ=255) cTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGTGAAATTCCCCCg > 1:62891/1‑135 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTTAATTTTTCCGTCATAGCTGAATCTCTTTTTTGCCAAATTCATTCGTGATTTGCTTAAATCTTAGCATCACATTTTCAATTTTTGCAGTTGTTCCAATCCCGCCACCAACGATGTTCGTGAAATTCCCCCG > TrimmedAssembly_T66_contig_31/1‑135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |