Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | TrimmedAssembly_T66_contig_39 | 1 | 87–2 | 2–87 | NA [0] | [176] 183 | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Aggregation promoting factor |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CTAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATAAGCATATCGCATATCTAAATAACGGG > TrimmedAssembly_T66_contig_39/12‑223 | cTAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAGGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGga > 2:1906895/1‑136 (MQ=11) cTAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGga > 1:1972289/1‑136 (MQ=11) cTAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGga > 1:156124/1‑136 (MQ=11) cTAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGga > 1:1107026/1‑136 (MQ=11) cTAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGga > 2:2423993/1‑136 (MQ=11) cTAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAAAATTTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGga > 2:183734/1‑136 (MQ=11) cTAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCAGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGga > 2:371480/1‑136 (MQ=11) tAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGgag < 1:2148111/136‑1 (MQ=31) aGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGgag > 1:1819589/1‑135 (MQ=31) aGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGgag > 1:607339/1‑135 (MQ=31) tcgtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGgag < 2:1414912/133‑1 (MQ=31) tcgtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGgag > 1:1414912/1‑133 (MQ=31) tcgtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACa > 2:165513/1‑136 (MQ=33) gtcTAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:375980/136‑1 (MQ=25) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATTAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:378190/136‑1 (MQ=25) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACCTGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:1185661/136‑1 (MQ=25) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:1569737/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:2278391/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:2265983/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:1434448/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:260172/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:94618/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:865987/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:703625/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:532913/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:2247860/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:1831348/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:1586112/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:1517649/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:46322/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:613805/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:1364048/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:750854/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:1239129/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:1211309/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:1184952/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:782512/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:1049686/136‑1 (MQ=35) gtcAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 2:980586/136‑1 (MQ=35) cAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACt < 2:1974917/135‑1 (MQ=37) aaaCTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTa > 1:94083/1‑135 (MQ=37) aaaCTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTa > 1:435890/1‑135 (MQ=37) atcTGTCGGGGGTTCGGTACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGTATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGc < 2:850643/134‑1 (MQ=255) aCTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGgag > 2:384028/1‑126 (MQ=31) aCTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCa > 2:1063019/1‑136 (MQ=37) aCTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCa < 1:1438409/136‑1 (MQ=37) cGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAgg > 1:2397439/1‑133 (MQ=37) ggggTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAACAACATGTGGGATTTTGGGTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTgg > 2:1010224/1‑136 (MQ=255) ggggTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTgg > 2:1010214/1‑136 (MQ=37) tCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCg < 2:1236632/135‑1 (MQ=37) tCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCg < 2:1328025/135‑1 (MQ=37) tCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCg < 2:1051382/135‑1 (MQ=37) tCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCg < 1:376277/135‑1 (MQ=37) tCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCg < 1:1400906/135‑1 (MQ=37) tCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCg < 2:2148006/135‑1 (MQ=37) aCTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCa > 1:554625/1‑119 (MQ=38) aCTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCg > 2:2517305/1‑136 (MQ=37) ttAGTCAGGACATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTaaa > 2:514302/1‑136 (MQ=255) ttAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTaaa > 2:1305437/1‑136 (MQ=39) ttAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTaaa > 2:514397/1‑136 (MQ=39) ttAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTaaa > 1:897453/1‑136 (MQ=39) ttAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTaaa > 2:34158/1‑136 (MQ=39) ttAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTaaa > 2:899773/1‑136 (MQ=39) ttAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTaaa > 1:1663864/1‑136 (MQ=39) ttAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTaaa > 1:535961/1‑136 (MQ=39) ttAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTaaa > 1:1795338/1‑136 (MQ=39) ttAGTCAGGAAATAAGTTGGATTTTCTCCGATAAGGTTGGTGAAGTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGAAGTCGATAGGCGGAGACAACAAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTaaaa > 2:266417/1‑136 (MQ=14) tCAGGAACTGAGTTGGAATTTCTCCGTTAAGGTTGGGGAATTGTTAAATAACAACAGGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCgg < 2:1133305/136‑1 (MQ=14) cAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:2459832/102‑1 (MQ=38) cAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc > 2:2459832/1‑102 (MQ=38) cAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCgg < 1:854084/135‑1 (MQ=39) cAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGt > 1:1009738/1‑136 (MQ=39) cAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGt > 2:468205/1‑136 (MQ=39) cAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGt > 1:1174898/1‑136 (MQ=39) cAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGt > 1:449568/1‑136 (MQ=39) cAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGt > 2:1801324/1‑136 (MQ=39) cAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGt > 2:117889/1‑136 (MQ=39) ggAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGtt > 1:1984710/1‑135 (MQ=39) aaTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTTGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCTATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTa > 2:2020918/1‑136 (MQ=255) aaTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc > 2:2373136/1‑97 (MQ=38) aaTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAAc < 1:2373136/97‑1 (MQ=38) aaTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTa > 2:2403074/1‑136 (MQ=40) aaTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTa > 2:792473/1‑136 (MQ=40) aaTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTa > 1:1335082/1‑136 (MQ=40) aaTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTa > 1:1585244/1‑136 (MQ=40) aaTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTa > 2:558518/1‑136 (MQ=40) aaTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTa > 1:1956429/1‑136 (MQ=40) aTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAg < 2:1337765/136‑1 (MQ=255) aTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAg < 2:549369/136‑1 (MQ=255) aTTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAg < 2:1373841/136‑1 (MQ=255) ttAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGa < 1:639291/136‑1 (MQ=255) tGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATaa < 2:8218/135‑1 (MQ=255) ttttCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCa > 1:589897/1‑91 (MQ=39) ttttCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATAAgcata < 1:1000339/136‑1 (MQ=255) ttttCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATAAgcata < 1:2403074/136‑1 (MQ=255) ttttCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATAAgcata > 1:2215689/1‑136 (MQ=255) aaGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATAAGCATATCGCATATCTa > 1:1370032/1‑136 (MQ=255) aaGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATAAGCATATCGCATATCTa > 2:300023/1‑136 (MQ=255) aGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATAAGCATATCGCATATCTaa > 1:2275596/1‑136 (MQ=255) aGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATAAGCATATCGCAGATCTaa > 1:388409/1‑136 (MQ=255) | CTAGTCGTCAAACTGTCGGGGGTTCGGGACTGTACTTAGTCAGGAAATTAGTTGGATTTTCTCCGTTAAGGTTGGTGAATTGTTAAATAAAAACATGTGGTATTTTGGTTGGGAGAGTGGGTCGTCGATTGGGGGAGACAACTAGCAGGTCTGGATCGTGTCCGTCTTAAAGCGGTTGCTAGAATAAGCATATCGCATATCTAAATAACGGG > TrimmedAssembly_T66_contig_39/12‑223 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |