| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_2 | = 83 | 177 (0.580) | 127 (0.480) | 43/256 | 2.8 | 59.3% | coding (82/180 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_5 | = 187151 | 0 (0.000) | intergenic (+38/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑ACGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_2/1‑83‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAAATTCCG < TrimmedAssembly_T66_contig_5/187151‑187019 caaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCC < 1:770481/130‑1 aaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGC < 2:1008528/132‑1 agggcTAAGCACATGTGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTAGACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGATCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCA < 2:1198359/131‑1 aggCGTAAGCAACTGGGACGAGAAACCACAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCTAGCAATTCAATCTGCCGCA < 2:1667187/133‑1 aggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCA < 2:765740/133‑1 aggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCA < 1:2623947/133‑1 aggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCA < 2:1311217/133‑1 aggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCA < 2:138917/133‑1 aggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCA < 2:1721842/133‑1 aggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCA < 2:2130935/133‑1 aggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCA < 2:2642102/133‑1 AAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATG < 1:2804381/135‑1 AAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATG < 2:1323586/135‑1 AAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATG < 2:2535630/135‑1 GCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGGACCCTGTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAG > 2:304605/1‑135 AATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTG < 2:183212/136‑1 AATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTG < 1:1925823/136‑1 AATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTG < 2:2391474/136‑1 TGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTC < 2:2021382/136‑1 GGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCT > 1:236633/1‑136 GGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGAT < 2:482043/91‑1 GGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCAGGTGCTGATACCGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCGTCGTGTGCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGCATGAGCCTGTCCT > 2:1649297/1‑136 GACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTT > 1:2380817/1‑136 GACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCA < 1:1236700/120‑1 ACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTT < 2:2154762/135‑1 CGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGT < 2:831903/136‑1 GAGAAACCAACAGTCGGAGTCTCGCCCCATCAGCTAAGACACAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCCTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAACAAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTC < 1:2683044/136‑1 GAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTC < 1:782049/136‑1 GAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCC > 1:2275672/1‑135 GAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCC > 1:1339884/1‑135 AAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCAC > 1:2834763/1‑136 AACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCA < 1:1387688/134‑1 ACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAA < 1:2110739/136‑1 caaccTTCGGTTTCTCGTCCCAATTGCTTATACAGAGGCTAGGTATGTCACAGCCTCTACGTGTTCAGTTGAGTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGACTGTCCTTGTCCACAAGC < 1:1208185/131‑1 CAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGC < 1:428156/136‑1 CAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGC < 2:2747238/136‑1 CAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAG > 1:183414/1‑135 CAAAAGTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGC < 1:1333711/136‑1 AATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGGTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCA > 2:2492395/1‑135 TTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCA < 1:1545676/136‑1 TTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCA < 2:1931922/136‑1 TTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCA < 2:2589753/136‑1 TTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCA < 2:2074265/136‑1 GGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTT < 2:1694642/136‑1 TCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGC < 2:132516/136‑1 TCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTACGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTT < 2:320538/136‑1 CCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGT < 1:208876/135‑1 CCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGT < 1:473084/135‑1 TTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCAT < 1:2739320/136‑1 GCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCA > 1:791121/1‑136 GCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCA < 2:218145/136‑1 TATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG < 2:2380817/136‑1 TATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG < 1:462431/136‑1 TATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG < 2:1797071/136‑1 TATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG < 1:10725/136‑1 ACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGAT > 2:293718/1‑135 GAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGA > 1:1307856/1‑136 GGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCG < 2:1660627/133‑1 CTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGA > 1:1970311/1‑136 CTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGA > 2:782798/1‑136 CTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGA > 1:148308/1‑136 CTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGA > 1:397340/1‑136 CTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGA > 1:98905/1‑136 CTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGATCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGA > 1:77916/1‑136 CTAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTC > 1:1049372/1‑85 TAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAG > 1:1098609/1‑136 TAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAG > 1:1129512/1‑136 TAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG < 2:511877/125‑1 TAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG < 2:511849/125‑1 TAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG > 1:511849/1‑125 TAGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG > 1:511877/1‑125 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT > 1:1365669/1‑136 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT > 2:308018/1‑136 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT > 1:1200421/1‑136 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT < 2:1098609/136‑1 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT < 1:138589/136‑1 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT > 2:1450667/1‑136 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT > 1:1686957/1‑136 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT > 2:1186511/1‑136 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT > 2:2023685/1‑136 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTT < 1:2316165/48‑1 AGTTATGTCACAGCCTCTTCGTGGTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGGTGCAAGCACTTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGT > 2:1327286/1‑136 TATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCT > 2:2647215/1‑136 TATGTCACAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCT > 1:1874652/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 2:2572376/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 2:1134541/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 1:210793/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 2:1767660/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 2:467024/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 2:1860474/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 2:2422108/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 1:638026/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 1:132896/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA > 1:637979/1‑136 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG < 1:2556374/114‑1 CAGCCTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTG > 2:2556374/1‑114 CTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTTGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAAA < 2:101279/133‑1 CTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAAA < 1:1186511/133‑1 CTCTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAA < 1:1875836/132‑1 CTTCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAAATTCCG > 1:2811273/1‑136 ‑‑‑‑‑ACGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_2/1‑83‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttCGTGTTCAGTTGATTTTTGATTGGCGGTTGCAAGCAATTCAATCTGCCGCAGAATGAGCCTGTCCTTGTCCACAAGCCATCAGTTCAGCTTGGTAGGCATCATTGATGCGATTGAGTGCTTGGTGAAATTCCG < TrimmedAssembly_T66_contig_5/187151‑187019 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |