| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | 16208 = | 89 (0.470) | 62 (0.400) | 31/214 | 2.8 | 44.3% | intergenic (‑66/‑80) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | 16359 = | 83 (0.540) | coding (72/117 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AATTGATTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_20/16364‑16208‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTA > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16359‑16489 AATTGATTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACTACATCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATA > 2:442494/1‑136AATTGATTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATA > 1:2062934/1‑136AATTGATTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATA > 1:2304645/1‑136AATTGATTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATA > 1:1701544/1‑136 ATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGAC > 1:649163/1‑136 TCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAG < 1:2450575/136‑1 AAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCTAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATT > 2:1949325/1‑136 AAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATT > 1:2626679/1‑136 CAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTT > 1:1880974/1‑136 GATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTT < 1:313787/136‑1 GATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTT < 2:181938/136‑1 GATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTT < 2:752386/136‑1 ATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGTCGAATAGTTATATTTGTTAACAAAATTTA > 2:1549134/1‑136 ATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTA > 2:1212932/1‑136 TACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTAT < 1:60104/136‑1 ACGCTTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCGTGTCGACATCAATTATGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATT < 2:1932268/136‑1 GATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCTACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTTAAAATCCTGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAA < 2:677514/136‑1 ATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAAC > 1:2635196/1‑136 TCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATT > 1:1611509/1‑131 TCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATT < 2:1611509/131‑1 CGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATT > 2:1326011/1‑136 CGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATT > 2:912356/1‑136 CTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATT < 2:2843168/119‑1 CTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATT > 1:2843168/1‑119 GATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGC < 2:2228459/69‑1 GATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGC > 1:2228459/1‑69 CCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATG < 1:1883146/57‑1 CCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATG > 2:1883146/1‑57 TTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTAGTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTT > 2:2420933/1‑135 GACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTATTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTATATTAACAATATTATTAATGCATAAATACAAAATTTAC > 2:2642298/1‑135 aGACATCATTTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACAC < 1:871738/134‑1 CGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACAC < 1:1942626/135‑1 CGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACAC < 1:475657/135‑1 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATTAGACTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTAATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATATACACAA > 1:1711319/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 2:2526433/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 2:2285702/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 1:1648309/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 1:381969/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 1:1203570/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 1:296732/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 2:2046676/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTAAACAA > 2:916367/1‑136 ACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAA > 1:1454916/1‑136 ACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAA > 1:2210860/1‑136 CAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATA > 2:1085159/1‑134 AATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACT > 1:1901153/1‑136 cTTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTT < 1:240600/135‑1 ATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTGTTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTT < 1:240640/136‑1 ATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTT < 1:2288522/136‑1 TTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTT > 1:1294650/1‑136 AAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGA < 1:1212932/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:2676945/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC > 2:679755/1‑136 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 2:1579822/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:1846687/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:2168101/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:2168198/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 2:381969/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:2526433/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:489305/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAG < 1:1843845/51‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAG > 2:1843845/1‑51 AACGTTTCACTCGAAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 2:1302475/136‑1 TTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTC > 2:915543/1‑136 CGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTT < 2:649163/136‑1 AATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGC < 1:907885/136‑1 ATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTA > 2:2686925/1‑133 TATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTG < 2:1110239/136‑1 TATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTG > 2:189243/1‑136 TTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGT < 1:44837/136‑1 TTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGG > 1:728725/1‑135 TAAAAATCATGCTAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:1549134/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:1085159/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 2:2210860/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 2:592212/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 2:383055/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:590381/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:1428289/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:1839237/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:2353117/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:438884/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:1356780/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:1209202/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:1010492/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 2:1485708/136‑1 AAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAAT < 2:2616260/136‑1 AAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATA > 2:1927314/1‑136 AAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATA > 1:524703/1‑135 AAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATA > 2:388225/1‑135 AAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATA > 2:388294/1‑135 AATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC < 2:1294650/136‑1 AATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC < 1:187374/136‑1 AATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC < 2:2229234/136‑1 AATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC < 1:1836818/136‑1 AATAATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC < 2:926009/136‑1 ATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCC < 1:963952/136‑1 ATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCC < 2:1000424/136‑1 TCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCG < 1:1101117/136‑1 GCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTA < 2:11296/136‑1 GCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTA < 2:1901153/136‑1 AATTGATTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_20/16364‑16208‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTA > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16359‑16489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |