| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | = 16230 | 90 (0.480) | 73 (0.470) | 35/214 | 2.1 | 48.2% | intergenic (‑88/‑58) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | = 16335 | 83 (0.540) | coding (48/117 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TAAGTCGTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16079‑16230‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcatgatttttaaaaaaataGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAAGGG < TrimmedAssembly_T66_contig_20/16335‑16205 TAAGTCGTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCAT > 2:1942626/1‑136TAAGTCGTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCAT > 1:924381/1‑136 AAGTCGTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATG > 2:1203937/1‑136 AAGTCGTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATG > 1:2031017/1‑136 AAGTCGTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATG < 2:1396725/136‑1 TCGTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATCTTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATT > 2:2176831/1‑136 GTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTT > 2:1356780/1‑136 GTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTT > 2:1689926/1‑136 GTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTT > 1:1382337/1‑136 GTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTT < 1:1638676/136‑1 GTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTT < 1:1638852/136‑1 TTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTT < 1:2624299/135‑1 CCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAAT < 1:2068612/136‑1 CCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAAT < 2:1011067/136‑1 aCGTTCAAGGTGCATGATTTTCATAATATAATTTATTGGTTTTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAAACGTTCAAAACAAGACATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAATAATA < 2:2661399/135‑1 CCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATA < 1:1991427/136‑1 CCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATA < 2:2608703/136‑1 GCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTACCAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAACCAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTG < 2:2644739/135‑1 GATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCC < 1:622232/136‑1 GATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATT > 1:89322/1‑134 GATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATT > 1:2052034/1‑134 GATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATT > 2:1186857/1‑134 TATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTG < 2:883319/136‑1 TATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATT > 2:724345/1‑132 TTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTT > 1:181938/1‑136 TCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTA < 2:307405/136‑1 TAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAA > 2:2353117/1‑135 ATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATT > 2:475657/1‑136 TAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTT < 1:214760/136‑1 TAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATAAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTT < 2:239063/136‑1 AATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTT < 2:2002912/136‑1 ATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTG > 2:1044573/1‑136 GGTTGTTTCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATA < 2:694915/136‑1 GGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATA < 1:263276/136‑1 GGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATA < 1:1689926/136‑1 GGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATA < 2:4249/136‑1 GGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGAT > 2:2168198/1‑135 GGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGAGTCCTGTTAATTCAATATTTTTGAT > 2:2676945/1‑135 GGTTGATGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAATCCATTGTCCCTACGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGAGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGAT > 2:2168101/1‑135 TTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTG > 1:2673189/1‑128 ACTAACAGCATCCTTCCTGACATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCGTCGCATGATTTTTACAAAAATAGTTCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTAGATACGATTCGTCct < 2:1857188/136‑3 ACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCAT < 2:1378359/136‑1 TAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTG < 1:265448/136‑1 TAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTG < 2:903710/136‑1 TAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTG < 2:1031939/136‑1 TAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTG < 1:1790022/136‑1 TAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTG < 1:1790094/136‑1 TAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTG < 1:2186363/136‑1 AACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTG > 2:2788824/1‑135 GCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGC > 2:240600/1‑135 GCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGC > 2:240640/1‑135 CATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTC < 2:2116433/136‑1 ATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATTGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT < 1:1897104/134‑1 ATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTC < 2:2116471/135‑1 ATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT < 1:724345/134‑1 ATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT < 2:1445257/134‑1 ATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT < 1:454102/134‑1 ATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT < 1:2401014/134‑1 ATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT < 2:924381/134‑1 TTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT < 1:494993/130‑1 TTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT > 2:494993/1‑130 CCTGAATTTTGTACTTTTTTCATTAACAGTTCAATTCTAGCCATTGTAACTTCGCATGATTTTTAAATAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACC < 2:2052034/136‑1 CCTGAAATTAGTACGAATAACAATAACAGTTCAAAACACGCCATTGTCCCTACGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGACATTGCCGCTCGATAACC < 2:1415623/136‑1 TTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCT < 1:1666174/136‑1 ACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACG > 1:752386/1‑136 ACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGAC < 2:1347966/135‑1 ACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGAC < 1:1064279/135‑1 ACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGAC < 1:1186857/135‑1 ACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGAC < 1:443979/135‑1 TTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCA < 2:89322/136‑1 TCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT > 2:1815336/1‑109 TCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCT < 1:1815336/109‑1 TTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTA < 1:1201509/136‑1 TAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAA < 1:1044573/136‑1 ATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAA > 2:714786/1‑136 ATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAA > 1:1693399/1‑136 ATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAA > 1:2099502/1‑136 ATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGAC > 1:981028/1‑105 CCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTT > 2:2288522/1‑136 CCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTT > 2:60104/1‑136 CATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA > 2:1836818/1‑136 CATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA > 1:1579822/1‑136 CATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA > 2:1846687/1‑136 CATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA > 2:2765780/1‑136 ATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAA > 1:2207891/1‑136 ATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA < 2:442952/135‑1 ttATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAA < 1:1779492/134‑1 TGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAA > 1:1293910/1‑136 TTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATG < 1:296464/136‑1 TTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATG < 2:854839/136‑1 TTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATG < 2:854904/136‑1 TTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCAT > 2:907885/1‑135 AAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAA > 2:489305/1‑136 AAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAA > 2:708320/1‑136 AAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAAGGG < 1:2412657/136‑1 AAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAAGGG < 1:383055/136‑1 AAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAAGGG < 2:800693/136‑1 AAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAAGGG < 1:592212/136‑1 AAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAAGGG < 2:1455934/136‑1 AAATAGTGCGAATTGATTCCTGTAACATCAATATTTTCGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTAGCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAAGGG < 2:1153457/136‑1 TAAGTCGTTTTAAGTCCCGTTCAAGGTGCATGATATTCATAATATAATTAATTGGTTGTTGCATACTAACAGCATCCTTCCTGAAATTTGTACTTTTTTCATTAACCGTTCAAAACAAGCCATTGTCCCTTCGCATGATTTTTAAAAAAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16079‑16230‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcatgatttttaaaaaaataGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAAGGG < TrimmedAssembly_T66_contig_20/16335‑16205 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |