| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_26 | = 3462 | 0 (0.000) | 123 (1.070) | 45/260 | 0.5 | 100% | coding (1/702 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_29 | 1 = | NA (NA) | coding (228/228 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CCCATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_26/3331‑3462 | ccATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaat < 2:1469888‑M1/134‑4 (MQ=255) ccATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaat < 2:1831068‑M1/134‑4 (MQ=255) cATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggt > 1:914991‑M1/1‑130 (MQ=255) cATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggt > 2:2689316‑M1/1‑130 (MQ=255) cATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggt > 2:2234861‑M1/1‑130 (MQ=255) cATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggt > 2:1909851‑M1/1‑130 (MQ=255) cATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggt > 1:2028996‑M1/1‑130 (MQ=255) cATGTTCAGGTAGTTCACACAGGGAGAAATCAATTTTCCCCTGATAAAGCCAATTATAAAGATATTTAGTGGGGAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGGAAATGGTTTAGaatggt > 1:677023‑M1/1‑130 (MQ=255) tCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgct > 1:127682‑M1/1‑125 (MQ=255) aGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTTGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatt > 2:1122350‑M1/1‑119 (MQ=255) aGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatt > 1:2273638‑M1/1‑119 (MQ=255) gTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaattt > 2:1596759‑M1/1‑118 (MQ=255) gTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaattt > 1:2250564‑M1/1‑118 (MQ=255) cACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACGTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggc < 2:2053901‑M1/136‑22 (MQ=255) aCTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggca > 2:1864423‑M1/1‑114 (MQ=255) aCTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggca > 1:2604696‑M1/1‑114 (MQ=255) aCTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggca > 1:1015792‑M1/1‑114 (MQ=255) aCTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggca > 2:403370‑M1/1‑114 (MQ=255) gaATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagttta > 2:1638140‑M1/1‑105 (MQ=255) gaATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagttta > 2:1674001‑M1/1‑105 (MQ=255) gaATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcagtcagttta > 2:1670904‑M1/1‑105 (MQ=255) ttCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtt < 1:946753‑M1/136‑35 (MQ=255) ttCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtt < 2:2346339‑M1/136‑35 (MQ=255) ttCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtt < 2:2090300‑M1/136‑35 (MQ=255) aaTTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttt > 1:2469379‑M1/1‑99 (MQ=255) ttCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcgg > 2:2249111‑M1/1‑95 (MQ=255) tGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaat < 1:2362407‑M1/136‑48 (MQ=255) tGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaat < 2:2469379‑M1/136‑48 (MQ=255) tGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaat < 1:1909851‑M1/136‑48 (MQ=255) tataGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgc < 2:1858546‑M1/135‑50 (MQ=255) tataGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgc > 2:44780‑M1/1‑86 (MQ=255) tataGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgc < 1:2204701‑M1/135‑50 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGTCTAGTTTAAGCTCATGCGAAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 1:765816‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 1:1844223‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 1:1844365‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 2:825476‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACGTATGGTGACCATCTTAGACTTAAATGGTTTAGaatggtttgcttttatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 1:2380364‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTGAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttattttttcggccacaatgcgcccgtttat < 2:110637‑M1/136‑60 (MQ=255) atataaATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 2:2476558‑M1/135‑60 (MQ=255) ataAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatat > 1:221223‑M1/1‑75 (MQ=255) taAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatat > 2:1001436‑M1/1‑74 (MQ=255) taAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatat > 1:1560950‑M1/1‑74 (MQ=255) taAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat > 1:1427713‑M1/1‑74 (MQ=255) taAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 2:1427713‑M1/133‑60 (MQ=255) taAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACAATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttaggccacaatgcgcccgtttatatt > 1:734073‑M1/1‑74 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 2:1826782‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:2678235‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 2:1617169‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:151140‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:1001436‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 2:208526‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgtt < 2:1314562‑M1/135‑70 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgtt < 2:1314833‑M1/135‑70 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgtt < 1:91382‑M1/135‑70 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagattgtcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:496055‑M1/136‑71 (MQ=255) tAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttgg > 1:702541‑M1/1‑64 (MQ=255) aGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgcta < 1:34223‑M1/136‑81 (MQ=255) aGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgcta < 1:34224‑M1/136‑81 (MQ=255) tCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagctt < 2:2793942‑M1/136‑90 (MQ=255) tCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagct < 2:755354‑M1/135‑89 (MQ=255) cATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttg > 2:2379812‑M1/1‑46 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 2:2585564‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 2:2242235‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 2:2240019‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 2:1049099‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTCGTGACCATCAAAGACGTAAATGGTTAAGaagggtttgctataatttggcatgcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgtaggcctgtgataattcagcttgataa > 2:1082192‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACGTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 2:1093804‑M1/1‑42 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCCTCTTAGACGTAACTGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag < 2:677023‑M1/136‑96 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattctgcttgataag > 1:2791943‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag > 2:181364‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag > 1:1252141‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag > 1:498682‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtt > 1:2751864‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtt < 2:2751864‑M1/75‑35 (MQ=255) cACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttga < 1:2249111‑M1/136‑101 (MQ=255) cACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttga < 1:812767‑M1/136‑101 (MQ=255) cACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttga < 2:1015792‑M1/136‑101 (MQ=255) cACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttga < 1:1122350‑M1/136‑101 (MQ=255) cACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttga < 1:29548‑M1/136‑101 (MQ=255) cATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataatt < 2:843872‑M1/136‑114 (MQ=255) aTCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattc > 2:302125‑M1/1‑22 (MQ=255) aTCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcc > 1:2009583‑M1/1‑22 (MQ=255) aTCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcc < 2:2009583‑M1/74‑53 (MQ=255) cTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcat < 1:1538283‑M1/136‑117 (MQ=255) cTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcat > 1:2062525‑M1/1‑20 (MQ=255) cTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcat > 1:1711664‑M1/1‑20 (MQ=255) cTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagttcagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcat > 1:1956058‑M1/1‑20 (MQ=255) tAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataa < 1:2367327‑M1/136‑119 (MQ=255) aaTGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgt < 2:2250564‑M1/136‑127 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 2:1211574‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 2:723383‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 2:595778‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 2:645879‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttga > 2:1921066‑M1/1‑7 (MQ=255) ttAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattctgcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 2:2791943‑M1/135‑132 (MQ=255) ttAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 1:1504561‑M1/135‑132 (MQ=255) ttAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 2:2614248‑M1/135‑132 (MQ=255) ttAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 2:1557300‑M1/135‑132 (MQ=255) ttAGaatggtgtgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 2:914991‑M1/135‑132 (MQ=255) aGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacggag > 1:2303099‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCCATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_26/3331‑3462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |