| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_1 | = 88613 | 153 (0.900) | 151 (0.830) | 60/260 | 0.3 | 49.7% | coding (224/300 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_39 | 1 = | NA (NA) | intergenic (–/+397) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Aggregation promoting factor | |||||
Only 100 of 1683 total aligned reads displayed.
CTGTGGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCGGGTATCATCCGCAACGATAGTGGCGTAGTCTTGTAGATAAATCCAAGCGACTAAATCATACTTATCATGAAAATGATAGTAGAAAGCTTGTGGGGTTGCTCCTGCAGCTTTAGCTAAATGGG > TrimmedAssembly_T66_contig_1/88478‑88748 | gtgGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTGCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCta < 1:339703‑M1/136‑3 (MQ=255) ggTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgat > 1:2721377‑M1/1‑132 (MQ=255) ggTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtatt < 2:1083107‑M1/136‑5 (MQ=255) ggTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaact < 2:1368924‑M1/136‑5 (MQ=255) aGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttca < 2:877928‑M1/136‑9 (MQ=255) tcattcatGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCacttaattgc < 1:479608‑M1/135‑11 (MQ=255) catGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttg < 1:2464865‑M1/136‑17 (MQ=255) catGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttg < 1:979066‑M1/136‑17 (MQ=255) catGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttg < 2:1681920‑M1/136‑17 (MQ=255) catGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttg < 1:1819302‑M1/136‑17 (MQ=255) catGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaat > 2:1845437‑M1/1‑120 (MQ=255) atGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatg < 2:645582‑M1/136‑18 (MQ=255) aaTGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCTGGTATCATcc > 2:559894/1‑136 (MQ=255) aaTGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCGGGTATCATcc > 1:201949/1‑136 (MQ=255) gCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCttcgttgtggactagtcgtcaa > 1:2805159‑M1/1‑110 (MQ=255) gCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaata < 1:1919817‑M1/136‑27 (MQ=255) ctcctGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCGGGTATCATCCGCAAc > 2:2360335/1‑136 (MQ=255) ctcctGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCttcgttgtggactagtcgtcaaactgt < 1:435439‑M1/135‑28 (MQ=255) ctcctGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatt > 2:2004202‑M1/1‑109 (MQ=255) cctGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAACTATCATAAGGGAATGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttt < 2:50906‑M1/136‑30 (MQ=255) cctGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCGGGTatcatc < 1:1731834/128‑1 (MQ=255) gtgATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaa > 1:240776‑M1/1‑103 (MQ=255) tGTTTTCTTTTGTTACTAAATATCATAAGGGAATGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcatttttta < 2:1168861‑M1/136‑38 (MQ=255) tGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCttcgttgtggactagtcgtcaaactgtcgggggttcg < 1:379587‑M1/136‑38 (MQ=255) gTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaa < 1:693405‑M1/136‑39 (MQ=255) cTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttg < 1:914184‑M1/136‑43 (MQ=255) cTGTGGTTACTAAAGATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaa < 2:430167‑M1/136‑44 (MQ=255) tACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaatctttaatttc < 2:833065‑M1/135‑50 (MQ=255) tACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaat < 2:2553257‑M1/136‑51 (MQ=255) tACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATGTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCacttaagtgcgcactgcctctaataggcgttagtccaatcggttatgtca > 2:2410262‑M1/1‑86 (MQ=255) aCTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaata < 2:2150047‑M1/136‑52 (MQ=255) cTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgt < 1:1000601‑M1/136‑53 (MQ=255) tAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaa < 1:1280850‑M1/136‑54 (MQ=255) aaaTATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaat > 1:1482959‑M1/1‑82 (MQ=255) cATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCGGGTATCATCCGCAACGATAGTGGCGTAGTCTTGTAGATAAATCCAAg < 1:186924/136‑1 (MQ=255) aTAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCttcgttgtggactagtcgtcaaactgtcgggggt < 1:1347609‑M1/109‑35 (MQ=255) aTTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttg < 2:947807‑M1/79‑17 (MQ=255) aTTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccag > 1:1668389‑M1/1‑63 (MQ=255) aTTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccag > 2:1402716‑M1/1‑63 (MQ=255) aTTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaatactcaaacgtaaccgttaattaa < 1:1102322‑M1/136‑74 (MQ=255) aTTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaatactcaaacgtaaccgttaattaa < 1:1160797‑M1/136‑74 (MQ=255) aTTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaatactcaaacgtaaccgttaatta < 1:2763457‑M1/135‑73 (MQ=255) aTTCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgat > 2:1533390‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagccc < 2:1597675‑M1/136‑74 (MQ=255) tCCCTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctat < 2:1224121‑M1/136‑76 (MQ=255) cccTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagccc < 2:2601790‑M1/134‑74 (MQ=255) cTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatag > 1:1037837‑M1/1‑58 (MQ=255) cTATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCacttaattgc < 2:296917‑M1/68‑11 (MQ=255) tATTTCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttga > 2:776640‑M1/1‑57 (MQ=255) tttCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatagacgg < 1:517687‑M1/136‑82 (MQ=255) tttCTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatagacgg < 2:47417‑M1/136‑82 (MQ=255) cTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaatctttaatttcaacttcgcttaaattaacggctaatttcttattaa > 1:2665959‑M1/1‑52 (MQ=255) cTATACAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaatactcaaacgtaaccgttaattaatggaggtgtat > 1:2230773‑M1/1‑52 (MQ=255) ataCAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCGGGTATCATCCGCAACGATAGTGGCGTAGTCTTGTAGATAAATCCAAGCGACTAAATCATACTTATCATGaaaa < 2:2755423/136‑1 (MQ=255) cAATTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatagacggtactgtca < 1:197967‑M1/136‑90 (MQ=255) aaTTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCGGGTATCATCCGCAACGATAGTGGCGTAGTCTTGTAGATAAATcc < 1:2178926/103‑1 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaatctttaatttcaacttcgcttaaattaacggctaatttcttattaatacgtt > 1:1947204‑M1/1‑46 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatagacggtactgtcat > 1:2294043‑M1/1‑46 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacaca < 1:1586066‑M1/55‑10 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgccttttta > 2:1130844‑M1/1‑46 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgccttttt < 1:2357220‑M1/135‑90 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaacc < 2:1629111‑M1/117‑72 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaatactcaaacgtaaccgttaattaatggaggtgtatgcgaca > 1:802717‑M1/1‑46 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaatactcaaacgtaaccgttaattaatggaggtgtatgcgaca > 1:2077710‑M1/1‑46 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagcccaattaacgctgcactc > 1:1765588‑M1/1‑47 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagcccaatta > 1:757948‑M1/1‑47 (MQ=255) aaTTCAGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGAAATATTACGCTCTCtacgttgtggactagtcgtcaaactgtcgggggttcgggactgtacttagtcaggaaattagatggattatctccgttaaggttggtgaa > 2:2077576‑M1/1‑46 (MQ=255) aGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatagacggtactgtcataaaat > 2:1283728‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatagacggtactgtcataaaat > 1:302693‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatagacggtactgtcataaaat > 2:190241‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacaggaggtgttaatattatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatagacggtagtgtcataaaat > 2:609123‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagcccaattaacgctgcactcaact > 2:2784181‑M1/1‑42 (MQ=255) aGAAATCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagcccaattaacgctgcactcaact > 1:1070699‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaatctttaatttcaacttcgcttaaattaacggctaatttcttattaatacgttgaaagac < 1:2504670‑M1/136‑98 (MQ=255) aaTCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtattacacacatgaggtgttaataatatatgtaatatttgttattattattaattatgctattttatttttctatagacggtactgtcataaaat < 1:1633194‑M1/133‑96 (MQ=255) aaTCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagcccaattaacgctgcactcaactacg < 2:2502464‑M1/135‑97 (MQ=255) tCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgcctttttaaccacgctta < 1:1402716‑M1/136‑101 (MQ=255) tCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgcctttttaaccacgctta < 2:180247‑M1/136‑101 (MQ=255) tCTTTTATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagcccaattaacgctgcactcaactacggat < 2:2686544‑M1/136‑100 (MQ=255) tttATGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagcccaattaacgctgcactcaactacggatacg < 1:2616892‑M1/136‑103 (MQ=255) ttatgcatTTACACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaatctttaatttcaacttcgcttaaattaacggctaatttcttattaatacgttgaaagacccgtggt < 1:58097‑M1/133‑105 (MQ=255) tatgcaTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCttcgttgtggactagtcgtcaaactgtcgggggttcgggactgtacttagtcaggaaattagttggattttctccgttaaggttggtgaattgttaaataaaaac > 2:1459037‑M1/3‑31 (MQ=255) gtgCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCGGGTATCATCCGCAACGATAGTGGCGTAGTCTTGTAGATAAATCCAAGCGACTAAATCATACTTATCATGAAAATGATAGTAGAAAGCTTGTgg < 2:35457/136‑1 (MQ=255) atgcATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCttcgttgtggactagtcgtcaaactgtcgggggttcgggactgtacttagtcaggaaattagttggattttctccgttaaggttggtgaattgttaaataaaaaca < 1:858418‑M1/135‑107 (MQ=255) tgCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCttcgttgtggactagtcgtcaaactgtcgggggttcgggactgtacttagtcaggaaattagttggattttctccgttaaggttggtgaattgttaaataaaaacat > 2:1952783‑M1/1‑29 (MQ=255) atttaCACAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaatctttaatttcaacttcgcttaaattaacggctaatttcttattaatacgttgaaagacccgtggtgtata > 2:1324024‑M1/2‑26 (MQ=255) ttACACAAGATATTTTACGCTCTCCgggaggcagttgtggctaataaatatttttcattgttatttggtgcccagttctaccgtcgagattttagcccaattaacgctgcactcaactacggatacgccgtgctgt > 2:1027082‑M1/1‑25 (MQ=255) acacAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgtttgactaaatctttaatttcaacttcgcttaaattaacggctaatttcttattaatacgttgaaagacccgtggtgtatagcata < 1:1536990‑M1/136‑115 (MQ=255) acacAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaatctttaatttcaacttcgcttaaattaacggctaatttcttattaatacgttgaaagacccgtggtgtatagcaaa < 1:2556509‑M1/136‑115 (MQ=255) acacAAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaatctttaatttcaacttcgcttaaattaacggctaatttcttattaatacgttgaaagacccgtggtgtatagcaaa < 2:2257346‑M1/136‑115 (MQ=255) cacaAGATATTTTACGCTCTCtgatttcatctggttgtatcagaatatgattgactaaatctttaatttcaacttcgcttaaattaacggctaatttcttattaatacgttgaaagacccgtggtgtatagcaaat > 1:2135833‑M1/1‑21 (MQ=255) tatTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgcctttttaaccacgcttaatcaactgatacactgcccc < 2:2655135‑M1/134‑121 (MQ=255) tatTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgcctttttaaccacgcttaatcaactgatacactgcccc < 2:2455990‑M1/134‑121 (MQ=255) tatTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgcctttttaaccacgcttaatcaactgatacactgcccc < 2:2307640‑M1/134‑121 (MQ=255) tatTTTACGCTCTCtaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgcctttttaaccacgcttaatcaactgatacactgcccc < 1:630497‑M1/134‑121 (MQ=255) tatTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaatactcaaacgtaaccgttaattaatggaggtgtatgcgacatgaaaaataaggataaacagtatgaaaaagt < 2:2195301‑M1/135‑122 (MQ=255) atTTTACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaatactcaaacgtaaccgttaattaatggaggtgtatgcgacatgaaaaataaggataaacagtatgaaaaagtg > 1:1212451‑M1/1‑13 (MQ=255) ttACGCTCTCaacttttctatctaatgatatatgttaaaagaatcgttaataaaataaatactcaaacgtaaccgttaattaatggaggtgtatgcgacatgaaaaataaggataaacagtatgaaaaagtggcga < 2:1744842‑M1/136‑127 (MQ=255) ctctctaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgcctttttaaccacgcttaatcaactgatacactgcccc > 2:2826256‑M1/1‑5 (MQ=255) ctaaaaaacatctagcattcaagctttttcattttttaaattaaaatacgtgtcaccctattttaataaaccagtttgatccgcctttttaaccacgcttaatcaactgatacactgccccaatcatcccagcatc > 2:723131‑M1/1‑1 (MQ=255) | CTGTGGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCCACTAAAGGATCGGGTATCATCCGCAACGATAGTGGCGTAGTCTTGTAGATAAATCCAAGCGACTAAATCATACTTATCATGAAAATGATAGTAGAAAGCTTGTGGGGTTGCTCCTGCAGCTTTAGCTAAATGGG > TrimmedAssembly_T66_contig_1/88478‑88748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |