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2:1599906‑M2/5‑136 (MQ=255) ccagTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTAAGATTCCGGCTTCCTTGTTGACCTTGTAGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTAc < 2:2700449‑M2/131‑1 (MQ=255) ccaaTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTAc < 2:1948267‑M2/131‑1 (MQ=255) ccaaTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTAc < 2:1886977‑M2/131‑1 (MQ=255) ccaaTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTAc < 1:259195‑M2/131‑1 (MQ=255) ccaaTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACg > 1:2832195‑M2/5‑136 (MQ=255) ccaaTTTCAGAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTAc < 2:1978799‑M2/131‑1 (MQ=255) cagTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACGt > 2:2758199‑M2/4‑136 (MQ=255) caaTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACGt > 1:358491‑M2/4‑136 (MQ=255) agtttcaTAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGAaatgtaaagaagccttcatcttgccaaaaactgg < 1:1892738‑M1/110‑35 (MQ=255) agTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGTTCAACATCGATCTTACGtt > 1:760767‑M2/3‑136 (MQ=255) aaTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACGtt > 1:185825‑M2/3‑136 (MQ=255) aaTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACGtt > 1:1096555‑M2/3‑136 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACGTTGA > TrimmedAssembly_T66_contig_42/1‑136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |