| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_27 | 1 = | 0 (0.000) | 233 (0.640) | 78/260 | 0.2 | 100% | intergenic (–/‑57) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_34 | = 1203 | 0 (0.000) | intergenic (+58/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Mobile element protein/– | |||||
Only 100 of 457 total aligned reads displayed.
CAAGATACCTTAAACAACCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_34/1068‑1203 | cAAGATACCTTAAACAACCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAgg > 2:2545202/1‑136 (MQ=255)cAAGATACCTTAAACAACCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAgg > 2:801468/1‑136 (MQ=255)cAAGATACCTTAAACAACCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAgg < 2:2244320/136‑1 (MQ=255) aaGATACCTTAAACAACCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGa < 1:2205170‑M2/136‑2 (MQ=255) aaaCAACCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaa < 2:1439025‑M2/136‑12 (MQ=255) aaaCAACCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaa < 2:650329‑M2/136‑12 (MQ=255) aaaCAACCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaa < 1:1295342‑M2/136‑12 (MQ=255) caacCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaatta < 1:393373‑M2/136‑15 (MQ=255) ggCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaacta > 1:1188614‑M2/1‑117 (MQ=255) gCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgc < 2:931363‑M2/135‑20 (MQ=255) gCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgc < 2:852870‑M2/135‑20 (MQ=255) gCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaa < 1:181104‑M2/136‑21 (MQ=255) cTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaa < 2:360963‑M2/136‑22 (MQ=255) tACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctc > 1:2238247‑M2/1‑114 (MQ=255) cggcggTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaattt > 2:2023901‑M2/1‑112 (MQ=255) tCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttc > 1:2739489‑M2/1‑106 (MQ=255) tCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttc > 2:2743792‑M2/1‑106 (MQ=255) tCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttc > 2:1172380‑M2/1‑106 (MQ=255) cATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttca > 1:468217‑M2/1‑105 (MQ=255) aTTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaa < 1:1574607‑M2/136‑33 (MQ=255) ttGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaat > 2:1379483‑M2/1‑103 (MQ=255) tGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaata > 1:19476‑M2/1‑102 (MQ=255) tGAACGATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaata > 1:812235‑M2/1‑102 (MQ=255) aTCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaa > 2:2603114‑M2/1‑96 (MQ=255) cGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcat < 1:2125624‑M2/135‑42 (MQ=255) cTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcac < 1:568625‑M2/136‑45 (MQ=255) cTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaa > 1:2564168‑M2/1‑92 (MQ=255) cccAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcat < 1:2338942‑M2/130‑42 (MQ=255) ccAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagg > 1:2424115‑M2/1‑88 (MQ=255) cAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAgg > 2:1574829/1‑87 (MQ=255) cAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgactt < 1:937263‑M2/136‑50 (MQ=255) cAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgactt < 2:566661‑M2/136‑50 (MQ=255) cAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggg < 2:613248‑M2/136‑50 (MQ=255) aGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaaggggg < 1:1600587‑M2/136‑51 (MQ=255) gATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaat < 2:125596‑M2/136‑55 (MQ=255) aTCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGTTTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattat < 2:1204938‑M2/136‑56 (MQ=255) aTCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatt < 1:927175‑M2/136‑56 (MQ=255) aTCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTATTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattat < 1:639293‑M2/136‑56 (MQ=255) tGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgt < 1:1710168‑M2/136‑66 (MQ=255) gAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacag < 1:688551‑M2/136‑67 (MQ=255) aCTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtt > 1:2361652‑M2/1‑68 (MQ=255) aCTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtt < 2:517715‑M2/136‑69 (MQ=255) aCTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagt > 2:2205170‑M2/1‑68 (MQ=255) cTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaa < 1:1365794‑M2/136‑70 (MQ=255) cTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagttt < 2:2355916‑M2/136‑70 (MQ=255) cTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagttt < 2:2490293‑M2/136‑70 (MQ=255) cTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGAATCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgatctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaa < 1:1163507‑M2/136‑70 (MQ=255) cTAGCTAAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGAGTAGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattattaatgatacagttt < 1:1443733‑M2/136‑70 (MQ=255) tAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttg < 1:1874661‑M2/136‑71 (MQ=255) ttATCAACTAGAACACCTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc > 2:1468701‑M2/1‑62 (MQ=255) ttAGCTACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc > 1:986259‑M2/1‑62 (MQ=255) ttAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgactttttatttaacgcgtgttcaattatc > 1:2477031‑M2/1‑62 (MQ=255) ttAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc > 2:2811981‑M2/1‑62 (MQ=255) ttAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc > 1:85565‑M2/1‑62 (MQ=255) ttAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc > 2:1617718‑M2/1‑62 (MQ=255) ttAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc > 2:2328714‑M2/1‑62 (MQ=255) ttAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc > 1:2831880‑M2/1‑62 (MQ=255) ttAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGAATTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc > 1:2009750‑M2/1‑62 (MQ=255) aGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagactttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcgg < 1:193034‑M2/136‑77 (MQ=255) aGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaat > 1:872327‑M2/1‑60 (MQ=255) aaCTAGACCACTTCTAAGAATATATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaatt > 2:1317656‑M2/1‑57 (MQ=255) aaCTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaatt > 2:2831332‑M2/1‑57 (MQ=255) aCTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggacc < 2:2099563‑M2/135‑80 (MQ=255) aCCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc < 2:105111‑M2/125‑75 (MQ=255) aCCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatat < 2:311939‑M2/135‑85 (MQ=255) aCCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatat < 1:2308726‑M2/135‑85 (MQ=255) ccACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacataga > 1:1025044‑M2/1‑50 (MQ=255) cTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggtt < 1:1537054‑M2/136‑93 (MQ=255) tAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtc < 2:1862842‑M2/136‑94 (MQ=255) tAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtc < 2:2522797‑M2/136‑94 (MQ=255) aaagAATAGAATCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgttctctcagaatttaatactgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtc < 2:2665196‑M2/135‑94 (MQ=255) aGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgcc < 2:229209‑M2/136‑96 (MQ=255) aTAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACACTTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtg > 1:2272220‑M2/1‑38 (MQ=255) ttCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgactgttaatttaacgcgtgttcaattatc < 1:1079939‑M2/107‑75 (MQ=255) ttCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaa < 2:2336719‑M2/136‑104 (MQ=255) ttCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaa < 1:2682127‑M2/136‑104 (MQ=255) ttCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaa < 1:797893‑M2/136‑104 (MQ=255) ttCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaa < 2:758964‑M2/136‑104 (MQ=255) tCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgttgtcgtgaatcaggt > 2:86986‑M2/1‑32 (MQ=255) tCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtgaatcaggt > 1:125596‑M2/1‑32 (MQ=255) tCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtgaatcaggt > 2:2707334‑M2/1‑32 (MQ=255) tCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaaa > 1:1902369‑M2/1‑32 (MQ=255) cTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaaa < 2:1679289‑M2/135‑105 (MQ=255) gtTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtgaatcaggtcgaatgg > 2:1492229‑M2/1‑25 (MQ=255) gtTGCACTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtgaatcaggtcgaatgg < 1:738056‑M2/136‑112 (MQ=255) gtTGCACTTGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaaagcttgcc > 2:181104‑M2/1‑25 (MQ=255) cACTTGACTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtgaatcaggtcgaatggtcgg < 2:2619777‑M2/136‑116 (MQ=255) aCTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtgaatcaggtcgaatggtcgga > 1:2545202‑M2/1‑20 (MQ=255) aCTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtgaatcaggtcgaatggtcgga < 1:1785247‑M2/136‑117 (MQ=255) cTTGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatatacgtggtcgtgaatcaggtcgaatggtcggaa < 1:2786002‑M2/136‑118 (MQ=255) ttGATTTGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtgaatcaggtcgaatggtcggaaa < 1:2159879‑M2/136‑119 (MQ=255) ttGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaaagcttgccaaaatat > 2:1950221‑M2/1‑18 (MQ=255) tGATTTGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaaagcttgccaaaatatc > 1:1669731‑M2/1‑17 (MQ=255) ttGACAATTGAGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatcggaccacatagacgtggtcgtgaatcaggtcgaatggtcggaaatgagc < 2:1737366‑M2/136‑124 (MQ=255) ttGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaaagcttgccaaaatatctggt < 1:343330‑M2/136‑124 (MQ=255) ttGACAATTGAGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaag > 1:2612485‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGACAATTGAGGaaaaaaaaaaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattattaatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgacgcaaaaaaagcttgccaaaatatctggt < 2:427426‑M2/136‑124 (MQ=255) aGGgaaaaattaaaagtcgtgctctcagaatttaatcctgaaagcacgacttttaatttaacgcgtgttcaattatc > 1:536312‑M2/1‑3 (MQ=255) aGGaaaaaaataaattaaactaaatttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaaagcttgccaaaatatctggtggttttaatc < 1:2061351‑M2/136‑134 (MQ=255) tgaaaaaaattaattaaactaactttgtttcaaataacatcatacaagggggattatttatgctacagtttgagaaattacaatattccaggttgccgcaaaaaaagcttgccaaaatatctggtggttttaatc > 1:1774740‑M2/2‑2 (MQ=255) | CAAGATACCTTAAACAACCGGCTACGGCGGTCATTGAACTATCGCTGCCCAGCCGATCTAATGCCTGAACTAGCTTAGCAACTAGACCACTTCTAAGAATAGATTCTTAGTGTTGCACTTGATTTGACAATTGAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_34/1068‑1203 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |