| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_36 | = 864 | 0 (0.000) | 107 (0.230) +AGTTAGATACATATTATATGTACGAAGGCATTTCATTTACACAAGATTCTTGACGCTACC |
38/140 | 0.1 | 100% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Transposase/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_7 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+104) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/SAM‑dependent methyltransferase | |||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAGCGATAA > TrimmedAssembly_T66_contig_7/1‑136 | taacgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctacca > 2:628356‑M2/136‑136 (MQ=255) acgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAAt > 1:1395114‑M2/134‑136 (MQ=255) acgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAAt > 2:2479866‑M2/134‑136 (MQ=255) acgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAAt > 2:1177555‑M2/134‑136 (MQ=255) acgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAAt > 2:2630309‑M2/134‑136 (MQ=255) gaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTaa < 1:1112640‑M2/6‑1 (MQ=255) agtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 1:436910‑M2/7‑1 (MQ=255) agtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 2:2012562‑M2/7‑1 (MQ=255) agtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 1:628356‑M2/7‑1 (MQ=255) agtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 1:2347902‑M2/7‑1 (MQ=255) agtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 1:1599423‑M2/7‑1 (MQ=255) agtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 2:2645961‑M2/7‑1 (MQ=255) ctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACa < 1:2160101‑M2/11‑1 (MQ=255) gaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGctc < 1:1583987‑M2/16‑1 (MQ=255) agcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGctct < 2:1951935‑M2/17‑1 (MQ=255) agcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTg > 2:888136‑M2/119‑136 (MQ=255) agcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTg > 2:749897‑M2/119‑136 (MQ=255) caccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCa > 1:1120269‑M2/111‑136 (MQ=255) caccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCa > 2:1709280‑M2/111‑136 (MQ=255) caccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCa > 2:21719‑M2/111‑136 (MQ=255) ccgagggttcaaatgactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCaaa < 1:2259837‑M2/28‑1 (MQ=255) ccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCaaa < 1:344134‑M2/28‑1 (MQ=255) gagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAAt > 2:1576231‑M2/107‑135 (MQ=255) tcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGt > 1:2176289‑M2/101‑136 (MQ=255) aaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTa > 1:1434442‑M2/98‑136 (MQ=255) ggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTaa > 2:556734‑M2/96‑135 (MQ=255) gactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTaa > 1:2643373‑M2/95‑134 (MQ=255) actccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATTCTCAAATCCAACGTTTAAg < 2:154169‑M2/41‑1 (MQ=255) actccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAg < 1:1258182‑M2/41‑1 (MQ=255) actccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAg < 2:1907618‑M2/41‑1 (MQ=255) actccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAg < 1:1198054‑M2/41‑1 (MQ=255) actccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAg < 2:2669096‑M2/41‑1 (MQ=255) actccaggacaccttggaagaatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAg < 2:1404911‑M2/41‑1 (MQ=255) caggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACaa > 2:694543‑M2/90‑136 (MQ=255) caggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACaa > 1:630963‑M2/90‑136 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 2:1356519‑M2/89‑136 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 1:2218568‑M2/89‑136 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 1:1811750‑M2/89‑136 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 1:1676435‑M2/89‑136 (MQ=255) acaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAtt < 2:1893274‑M2/49‑1 (MQ=255) caccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCa < 2:2094688‑M2/51‑1 (MQ=255) cttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgaagctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATaa > 2:471186‑M2/82‑135 (MQ=255) ttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAAcc < 2:1556773‑M2/56‑1 (MQ=255) ttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAAcc < 2:386489‑M2/56‑1 (MQ=255) ttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAAcc < 2:1395114‑M2/56‑1 (MQ=255) atggaagcatcatttatttcacttacatacatattatatgttcgaaggcctttcttttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAAcc < 2:2371662‑M2/56‑1 (MQ=255) ggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGa > 2:1874521‑M2/79‑136 (MQ=255) ggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGa > 1:1829910‑M2/79‑136 (MQ=255) aagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGAtt > 2:1729503‑M2/77‑136 (MQ=255) aagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGAtt > 2:938722‑M2/77‑136 (MQ=255) aagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGAtt > 1:2602781‑M2/77‑136 (MQ=255) aagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGAt < 1:1051120‑M2/59‑1 (MQ=255) catttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGttt > 1:471098‑M2/71‑136 (MQ=255) catttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGttt < 2:1829910‑M2/66‑1 (MQ=255) catttatttaagttagatacatattatatgtaagaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATTCTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGttt < 2:1668415‑M2/66‑1 (MQ=255) catttatttaagatagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGttt < 1:1431712‑M2/66‑1 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg > 2:81490‑M2/69‑75 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 2:2501035‑M2/69‑136 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 1:2538675‑M2/69‑136 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 1:2762584‑M2/69‑136 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 2:1496378‑M2/69‑136 (MQ=255) tgtatttaagttagatacatattatatgtactaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCACTGAATACTCAAATCCAACTTTTAAGCAACAATTCAAAACCGATTAAGTATGt > 2:768055‑M2/69‑136 (MQ=255) ttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGt > 1:1212662‑M2/64‑99 (MQ=255) ttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGt < 2:1212662‑M2/36‑1 (MQ=255) agatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATc < 1:556734‑M2/80‑1 (MQ=255) tacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAGCGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATcc < 2:1118505‑M2/81‑1 (MQ=255) catattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGttt < 2:30009‑M2/66‑1 (MQ=255) ttatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAata < 1:776081‑M2/89‑1 (MQ=255) tatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAatat < 1:694543‑M2/90‑1 (MQ=255) tatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAatat < 1:938722‑M2/90‑1 (MQ=255) atatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAatat > 2:431238‑M2/46‑135 (MQ=255) atatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATg < 2:219815‑M2/91‑1 (MQ=255) tgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGcc > 1:1716730‑M2/43‑135 (MQ=255) gtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGccc > 1:1069031‑M2/42‑135 (MQ=255) acgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGccccc < 2:627280‑M2/96‑1 (MQ=255) acgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGccccc < 1:776767‑M2/96‑1 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAata < 1:1880215‑M2/89‑1 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAata < 1:1880207‑M2/89‑1 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAata > 2:1880215‑M2/38‑126 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTc > 2:733677‑M2/38‑135 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTc > 2:3688‑M2/38‑135 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTc > 2:457552‑M2/38‑135 (MQ=255) aggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGttt < 2:2451882‑M2/66‑1 (MQ=255) tttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTc < 1:352936‑M2/106‑1 (MQ=255) catttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCaa > 1:2105182‑M2/28‑135 (MQ=255) atttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATc > 1:1916638‑M2/27‑136 (MQ=255) atttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATc > 2:327721‑M2/27‑136 (MQ=255) acaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTc > 2:685903‑M2/21‑126 (MQ=255) acaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCacgacg < 2:1179651‑M2/116‑1 (MQ=255) acaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCacgacg < 1:1709280‑M2/116‑1 (MQ=255) acaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCacgacg < 1:173089‑M2/116‑1 (MQ=255) acaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCacgacg < 2:1676415‑M2/116‑1 (MQ=255) acaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGATTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCacgacg < 2:511224‑M2/116‑1 (MQ=255) tcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGt > 2:2848782‑M2/14‑136 (MQ=255) acgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACg > 1:476791‑M2/9‑136 (MQ=255) gctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAg < 1:1337895‑M2/130‑1 (MQ=255) ctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATACAACGTGAAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTAGATAAGTGCCAATCCGTTTAATCTGCCCCCTCGCAACCTCAAGCACGACGAGCCCGTTTACGAGc > 2:2252126‑M2/6‑136 (MQ=255) accAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAGCGa > 1:2455389‑M2/4‑136 (MQ=255) ccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAGCGAt > 2:1000246‑M2/3‑136 (MQ=255) cAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAGCGATa > 2:281956‑M2/2‑136 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAGCGATAA > TrimmedAssembly_T66_contig_7/1‑136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |