| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_24 | = 19315 | 0 (0.000) | intergenic (+87/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
TGATGCTGGGATGATTGGGGCAGTGTATCAGTTGATTAAGCGTGGTTAAAAAGGCGGATCAAACTGGTTTATTAAAATAGGGTGACACGTATTTTAATTTAAAAAATGAAAAAGCTTGAATGCTAGATGTTTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_24/19180‑19315 | gATGCTGGGATGATTGGGGCAGTGTATCAGTTGATTAAGCGTGGTTAAAAAGGCGGATCAAACTGGTTTATTAAAATAGGGTGACACGTATTTTAATTTAAAAAATGAAAAAGCTTGAATGCTAGATGTTTTTTAg > 2:195330‑M2/1‑135 (MQ=255) gATGCTGGGATGATTGGGGCAGTGTATCAGTTGATTAAGCGTGGTTAAAAAGGCGGATCAAACTGGTTTATTAAAATAGGGTGACACGTATTTTAATTTAAAAAATGAAAAAGCTTGAATGCTAGATGTTTTTTAg > 2:723131‑M2/1‑135 (MQ=255) tGCTGGGATGATTGGGGCAGTGTATCAGTTGATTAAGCGTGGTTAAAAAGGCGGATCAAACTGGTTTATTAAAATAGGGTGACACGTATTTTAATTTAAAAAATGAAAAAGCTTGAATGCTAGATGTTTTTTAgag > 2:1317352‑M2/1‑133 (MQ=255) tgatTGGGGCAGTGTATCAGTTGATTAAGCGTGGTTAAAAAGGCGGATCAAACTGGTTTATTAAAATAGGGTGACACGTATTTTAATTTAAAAAATGAAAAAGCTTGAATGCTAGATGTTTTTTAgagagcgtaaa < 1:472730‑M2/136‑12 (MQ=255) 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TGATGCTGGGATGATTGGGGCAGTGTATCAGTTGATTAAGCGTGGTTAAAAAGGCGGATCAAACTGGTTTATTAAAATAGGGTGACACGTATTTTAATTTAAAAAATGAAAAAGCTTGAATGCTAGATGTTTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_24/19180‑19315 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |