| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | Annotation_U21_Trimmed_contig_1 | 47 | +CGCAGTGACATCACAAGCTGCAACTAGCGTAGCACCAAGTTCAGCTGTATCATCAGCTGCAAGCTCAGTTGCACCATCAAGTAG | coding (47/567 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_1 | 1 = | 0 (0.000) | 223 (1.010) +TGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTGATGTCACTGCG |
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| ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_1 | = 47 | 103 (0.330) | coding (47/567 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 350 total aligned reads displayed.
GTGTAGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Annotation_U21_Trimmed_contig_1/118‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACT‑‑‑‑‑‑ < Annotation_U21_Trimmed_contig_1/47‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGC > 1:2667482/1‑135 AGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGC > 2:1778467/1‑135 AGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGC > 1:291189/1‑135 AGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGC > 1:40042/1‑135 AGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGC > 1:865605/1‑135 AGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGC > 1:654751/1‑135 ATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGTAATTGGTGCAACTCTATTTGCAGCTTGgg > 1:44912/1‑133 ATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTG > 1:783376/1‑135 ATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTG > 1:1862973/1‑135 ATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTG > 1:15/1‑135 ATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTG > 2:1348614/1‑135 ATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTG > 2:1935319/1‑135 ATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCA > 2:2662223/1‑128 ATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACAGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATAAAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTG > 1:1913228/1‑135 AAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTGATG < 1:968302/135‑1 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TTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTGATGTCACTGCGCTACTTGATG > 1:1360189/1‑135 GATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTGATGTCACTGCGCTACTTGATGG > 1:2301319/1‑134 GCTACGCTAGTTGCCGCTTGTGATGTTACTGCACTACTTGAGGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTGATGTCACTGCGCTCCGGGATGGTGCAACT > 1:1740144/1‑135 GCTACGCTAGTTGCAGCTTGTGATGTTACTGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTGATGTCACTGCGCTACT < 1:1413865/122‑1 TACGCTAGTTGCAGCTTGTGATGTTACTGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTGATGTCACTGCGCTACTTGATGGTGCAACTG > 1:2167157/1‑134 TACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGCTTGTGATGTTACTGCACTACTTGATGGTGCAACTG > 1:546610/1‑134 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |