| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_13 | 191 = | 358 (0.960) | noncoding (1/75 nt) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE | tRNA‑Ile‑GAT | |||||
Only 100 of 1797 total aligned reads displayed.
GTCTAAGGTGGGACAGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_11/1577‑1711 | gACAGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGTttactctcaat < 2:1996348‑M2/135‑12 (MQ=255) aGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGTttactctcaatttt < 1:738273‑M2/135‑15 (MQ=255) aGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGTttactctcaatttt < 2:354480‑M2/135‑15 (MQ=255) aGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGTttactctcaatttt < 2:2575388‑M2/135‑15 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |