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Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
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gaactTGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAAc < 1:2026153‑M2/129‑1 (MQ=255) aactTGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACtt > 1:764552‑M2/5‑135 (MQ=255) ctTGGTGCTACGCTAGTTTCAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACttgt < 2:976616‑M2/133‑1 (MQ=255) ctTGGTGCTACGCTAGTTTCAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACttgt < 1:2218538‑M2/133‑1 (MQ=255) ctTGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACttgt < 1:207968‑M2/133‑1 (MQ=255) ctTGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACttgt < 1:2566694‑M2/133‑1 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACTTGTTG > Annotation_U21_Trimmed_contig_8/1‑135 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |