New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_10 | 1 = | 0 (0.000) | 391 (0.490) +ACATCGAAGAATCTTCCGTTGGAAGGTTCTTTTTTTGTGTCTAAAA |
70/168 | 0.0 | 100% | noncoding (117/117 nt) | rasttk_feature_creation_tool=RNA_reps_5S_rRNA | 5S rRNA # 5S ribosomal RNA ‑ 3 prime truncation |
? | Annotation_U21_Trimmed_contig_3 | = 367983 | 0 (0.000) | intergenic (‑70/–) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE/– | tRNA‑Thr‑GGT/– |
Only 100 of 524 total aligned reads displayed.
CTTGAACCGACGACCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_3/367854‑367983 | tGAACCGACGACCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttaga < 1:1085741‑M2/135‑8 (MQ=255) gAACCGACGACCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttaga < 1:2482438‑M2/134‑8 (MQ=255) cgacgaCCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaa < 2:1842980‑M2/135‑13 (MQ=255) cgacgaCCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaa < 2:1010321‑M2/135‑13 (MQ=255) cgacgaCCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaa < 2:2510563‑M2/135‑13 (MQ=255) acCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaa < 1:544396‑M2/135‑18 (MQ=255) acCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaa > 1:191158‑M2/1‑118 (MQ=255) ccgtccctACCACTGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATAATTATTTACGCTGTAAAACCCAAATATGCCATCTAGCTTAAATttttagacacacaaaaagaa > 1:809314‑M2/1‑115 (MQ=255) cttACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttc < 1:1291974‑M2/135‑26 (MQ=255) cccTGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTCTTTACGCTGTAAAACCACAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaac > 2:652477‑M2/1‑106 (MQ=255) ccATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaac > 2:544396‑M2/1‑106 (MQ=255) agggaaGTGCACCACCTCGCTGAGCTAAAGCGGCATTACTCAACTCCGCTAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAACCCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacgg > 2:1295218‑M2/3‑104 (MQ=255) aTGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaataaccttccaacgg < 2:2712703‑M2/135‑32 (MQ=255) aTGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacgg < 2:675534‑M2/135‑32 (MQ=255) aTGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacgg < 2:1316164‑M2/135‑32 (MQ=255) gAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaag > 1:1258028‑M2/1‑101 (MQ=255) aaGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagac > 1:871780‑M2/1‑100 (MQ=255) aaGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAAACAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaaga < 1:1520584‑M2/135‑36 (MQ=255) aaGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAAATAAGATAGAATATCATATTTATTTACGCTGAAAAACCAAAATATGAAATTTAGCTTAAATttttatacacaaaaaaataaccttccaaaggaaga < 1:737543‑M2/135‑36 (MQ=255) ctctACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattct > 1:1117736‑M2/1‑95 (MQ=255) ctctACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattct > 2:327456‑M2/1‑95 (MQ=255) tACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcga < 1:2068711‑M2/135‑44 (MQ=255) tACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcga < 1:2246456‑M2/135‑44 (MQ=255) tACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcga < 2:1464130‑M2/135‑44 (MQ=255) tACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcga < 2:874172‑M2/135‑44 (MQ=255) aCCTCGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATCTCAAATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaacaaagacccgtccaacggaagattcttcgat > 1:2449449‑M2/1‑91 (MQ=255) cTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatg < 2:1168961‑M2/134‑46 (MQ=255) aGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgc < 1:1575312‑M2/135‑49 (MQ=255) aGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgc < 1:1313777‑M2/135‑49 (MQ=255) tGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcat < 2:2039572‑M2/134‑51 (MQ=255) tGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcat < 2:1783362‑M2/134‑51 (MQ=255) tGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcat < 2:222954‑M2/134‑51 (MQ=255) tGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATatttagacacaaaaaaagaaccttcaaacggaagattcttcgatgtgcat < 1:891137‑M2/134‑51 (MQ=255) gAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatg > 1:487677‑M2/1‑83 (MQ=255) gAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcat > 1:2012641‑M2/1‑83 (MQ=255) gAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcat > 2:459102‑M2/1‑83 (MQ=255) aGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggc < 1:2395529‑M2/135‑54 (MQ=255) aGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggc < 1:507960‑M2/135‑54 (MQ=255) tataGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAATACCAAAATATGCCATGTAGCTTAATTttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaac < 2:1628028‑M2/135‑57 (MQ=255) tataGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttaga > 2:1251390‑M2/1‑79 (MQ=255) taGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacg < 2:1377920‑M2/134‑58 (MQ=255) taGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacg < 1:180984‑M2/134‑58 (MQ=255) taGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacg < 2:724228‑M2/134‑58 (MQ=255) taGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacg < 2:432301‑M2/134‑58 (MQ=255) taGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatg < 2:384999‑M2/128‑52 (MQ=255) taGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGATGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacaaaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttctaagtgcatggcaacg < 2:1513702‑M2/134‑58 (MQ=255) tGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcc < 2:2445879‑M2/134‑61 (MQ=255) gCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcct > 2:201340‑M2/1‑72 (MQ=255) gCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcct > 2:1739354‑M2/1‑72 (MQ=255) gCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcct > 1:2509315‑M2/1‑72 (MQ=255) gCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcct > 2:665575‑M2/1‑72 (MQ=255) tttATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccct < 2:293106‑M2/135‑67 (MQ=255) tttATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccct < 2:1892662‑M2/135‑67 (MQ=255) tttATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccct < 2:1429249‑M2/135‑67 (MQ=255) tttATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaac > 1:449838‑M2/1‑69 (MQ=255) ttATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctc > 1:1010321‑M2/1‑68 (MQ=255) aTCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgc < 1:1186830‑M2/135‑70 (MQ=255) aTCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgc < 2:25691‑M2/135‑70 (MQ=255) cAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcag < 1:318622‑M2/135‑72 (MQ=255) aaGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggc > 1:1862318‑M2/1‑59 (MQ=255) aGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcg < 1:2433439‑M2/135‑78 (MQ=255) aGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcg < 2:236958‑M2/135‑78 (MQ=255) gATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcga > 1:2545350‑M2/1‑57 (MQ=255) gATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcga > 2:2254934‑M2/1‑57 (MQ=255) gATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcga > 1:389842‑M2/1‑57 (MQ=255) atCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCGATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatccccc < 1:1366700‑M2/133‑85 (MQ=255) atCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatccccc < 2:795337‑M2/133‑85 (MQ=255) atCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatccccc < 1:1210435‑M2/133‑85 (MQ=255) atCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatccccc < 1:622816‑M2/133‑85 (MQ=255) cATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaac < 2:2411315‑M2/134‑88 (MQ=255) tatttattTACGCAGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagaaacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactac > 1:938822‑M2/1‑45 (MQ=255) tatttattTACGCAGTAAAACCAAAAGATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaacaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagtgggcgatcccccaactac > 2:1694485‑M2/1‑45 (MQ=255) atttatttTCGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattct > 1:1415416‑M2/1‑44 (MQ=255) atttatttACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttcctacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtccaaccctcgcagggggcgatcccccaacta < 1:692987‑M2/133‑90 (MQ=255) ttatttaCGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactct < 1:1692395‑M2/135‑94 (MQ=255) tatttaCGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctc < 2:605327‑M2/135‑95 (MQ=255) tttaCGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcgg < 2:818713‑M2/135‑97 (MQ=255) tttaCGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcga < 2:1938179‑M2/117‑79 (MQ=255) tttaCGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgat < 2:2625814‑M2/83‑45 (MQ=255) tttaCGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgat > 1:2625814‑M2/1‑39 (MQ=255) tGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaag < 1:603078‑M2/135‑104 (MQ=255) gTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaaga < 2:2192977‑M2/135‑105 (MQ=255) gTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaaga > 1:2348794‑M2/1‑31 (MQ=255) aaCCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagct < 2:491895‑M2/135‑109 (MQ=255) tatGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgac < 2:942138‑M2/131‑113 (MQ=255) aTGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttc < 1:2717265‑M2/135‑123 (MQ=255) gTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcga > 2:749033‑M2/1‑11 (MQ=255) gCTTAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacat > 1:257597‑M2/1‑8 (MQ=255) ttAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatgg > 2:1096333‑M2/1‑6 (MQ=255) tAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatgg > 1:2137782‑M2/1‑5 (MQ=255) tAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatgg > 1:189279‑M2/1‑5 (MQ=255) tAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatgg > 1:1628028‑M2/1‑5 (MQ=255) tAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatgg > 1:2192977‑M2/1‑5 (MQ=255) tAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatgg > 2:2146437‑M2/1‑5 (MQ=255) tAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatgg > 1:2741900‑M2/1‑5 (MQ=255) tAAATttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaacgactctcggcgtgaagaagcttgacttctgtgttcgacatgg > 2:1583990‑M2/1‑5 (MQ=255) tAAATttttagacacaaaaaaagaaacttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatgg > 1:1464120‑M2/1‑5 (MQ=255) aaaTttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatggg < 2:572938‑M2/134‑131 (MQ=255) aaaTttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatggg < 1:670730‑M2/134‑131 (MQ=255) tttttagacacaaaaaaagaaccttccaacggaagattcttcgatgtgcatggcaacgtcctaccctcgcagggggcgatcccccaactactctcggcgttaagaagcttgacttctgtgttcgacatgggaaca > 1:1783362‑M2/1‑1 (MQ=255) | CTTGAACCGACGACCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_3/367854‑367983 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |