| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_10 | = 3297 | 0 (0.000) | 1085 (0.550) +TTGAGAGTAA |
113/238 | 1.8 | 100% | intergenic (‑160/–) | rasttk_feature_creation_tool=RNA_reps_LSU_rRNA/– | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/– |
| ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_11 | = 1711 | 0 (0.000) | intergenic (+53/–) | rasttk_feature_creation_tool=RNA_reps_SSU_rRNA/– | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/– | |||||
Only 100 of 1209 total aligned reads displayed.
TGAGTTTAGCGATTAATCTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_10/3164‑3297‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCTGTCCCACCTTAGA < Annotation_U21_Trimmed_contig_11/1711‑1578 |||||||||| TTAGCGATTAATCTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGA > 1:1599714/1‑135 AGCGATTAATCTTTGAACTACTCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGT < 2:1475194/135‑1 AGCGATTAATCTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGT < 2:1906336/135‑1 AGCGATTAATCTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGT < 1:705362/135‑1 ATCTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCT > 2:533789/1‑135 ATCTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCT > 1:1381625/1‑135 ATCTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGT < 1:2277706/127‑1 CTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCA < 2:2585077/135‑1 CTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCA > 1:1174594/1‑135 CTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCA < 2:1099059/135‑1 ACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAGTTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCA > 2:671840/1‑129 ACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTA > 2:1708408/1‑135 ACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTA > 1:884090/1‑135 ACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTA > 1:2682289/1‑135 TAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAA < 1:2858193/135‑1 TAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAA < 2:1146314/135‑1 TAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAA < 2:74797/135‑1 TAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAA < 1:2469176/135‑1 ATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACA < 1:1727841/135‑1 CTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGATTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAA < 2:1345581/135‑1 TTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAA > 2:2365259/1‑133 TTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAA > 1:347981/1‑133 TTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAAACTCTCAAAACTAAACAA > 1:1273540/1‑133 TTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAA > 1:395667/1‑133 TTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAA > 1:1915717/1‑133 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 2:2785017/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 2:1506832/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 1:2223309/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 1:526548/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 1:464466/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 2:1186779/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 1:2633369/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 2:700117/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTT > 2:1756515/1‑134 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTT > 1:2387163/1‑134 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 1:2537406/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 2:886774/135‑1 TTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTT < 1:2165486/134‑1 ACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATA > 2:2033903/1‑135 TAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGG > 1:1009757/1‑135 TAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGG > 1:2304218/1‑135 TAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGG > 2:2881966/1‑135 TAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGG > 1:1645611/1‑135 TAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGT > 2:1848432/1‑96 TAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGG > 1:1543119/1‑135 AAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGG > 2:334883/1‑135 ATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAATAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAAAAAAACATTGACATAGTGTGGGT > 2:129001/1‑134 CGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTT > 2:252266/1‑135 GTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTA > 1:187594/1‑135 GTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTT < 1:2587329/134‑1 TTCTCTCGGCTGAATTAAGATTAACATTTAAAATTAGAAAAATATCTATAGTATTCAGTGATCAAAGAACACAATTGAGAGTAAACCTATCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATT < 2:1004740/134‑1 TCTCTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTG < 2:792569/109‑1 CTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTA < 1:2036280/135‑1 CTCGGCTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAACATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTA < 2:2310032/135‑1 TAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGA > 1:925806/1‑135 TAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGA > 2:619577/1‑135 TAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGA > 2:2429077/1‑135 TAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCATTAGAAAGGA > 2:2711890/1‑135 TAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACC < 1:143492/76‑1 TATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTAGTCCTTATAAAGGAGGTG > 2:283676/1‑135 AATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGC < 1:1317113/135‑1 AATTAAAATTAGAAAATTATAGACATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGC < 1:1826563/135‑1 TTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAG < 1:1985135/135‑1 AATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTC < 1:2344720/135‑1 AATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTC < 2:1970887/135‑1 AAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTAC > 2:1426503/1‑134 TTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCT < 2:485037/135‑1 ATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACG < 1:2749929/135‑1 ATTCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTAC > 2:568171/1‑134 TCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGAC > 2:1784710/1‑135 TCAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGAC > 2:2153189/1‑135 CAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACT < 2:1621429/135‑1 CAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACT < 2:395667/135‑1 CAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGAC > 2:928384/1‑134 CAGTTTTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGAC > 1:82260/1‑134 TTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACC < 1:1062222/135‑1 TTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACC < 2:2104219/135‑1 TTCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACC < 1:2115695/135‑1 TCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCC > 1:615538/1‑135 TCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCC > 1:1778809/1‑135 TCAAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCC > 2:1050987/1‑135 AAAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTA < 2:1657539/135‑1 AAGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTA > 2:2253584/1‑134 AGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAAT < 2:1389046/135‑1 AGAACAAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAAT < 2:1224550/135‑1 AAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCT < 1:2813405/135‑1 AAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCT < 2:847810/135‑1 AAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCT < 1:1685140/135‑1 AAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCT < 1:298174/135‑1 AAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCT < 2:2218255/135‑1 AAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCT < 1:67165/135‑1 AAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCT < 1:767550/135‑1 AAAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCT < 2:2465141/135‑1 AAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATTGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCTG < 1:1216913/135‑1 AAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCTG < 1:568171/135‑1 AAATTGAGAGTAAACCTCTCAAAACAAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATC > 1:1121570/1‑130 AGAGTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCTGTCCC > 1:1493074/1‑133 GTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCTGTCCCACCat > 1:2418681/1‑133 GTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCTGTCCCACCTT > 2:1545026/1‑135 GTAAACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGGTTATTCCTGAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTCCCTTGTTACGACTTCACCCTCATCATCTGTCCCACCTT > 2:2661132/1‑135 |||||||||| TGAGTTTAGCGATTAATCTTTGAACTAATCTTGTTTTATAACTCTTTAAATTACGCGGTTTTCTCTCGGTTTAATTATGATTAACAATTAAAATTAGAAAATTATAGATATTATTCAGTTTTCAAAGAACAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_10/3164‑3297‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCTCTCAAAACTAAACAAAACTTTGACATAGTGTGGGTTTCCGTTTATTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCAGGTTCTCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAATCATCTGTCCCACCTTAGA < Annotation_U21_Trimmed_contig_11/1711‑1578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |