| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_11 | 1 = | 0 (0.000) | 1934 (1.530) +C |
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| ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_3 | 2 = | 1 (0.000) | intergenic (–/+370) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Integral membrane protein LafC, accessory function in glycolipid and LTA synthesis | |||||
Only 100 of 1959 total aligned reads displayed.
TGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAAGATCAAACTCTCATATTAAATGATGAGTC‑TTTTTCAAGCTCATTAATTGTTTGTTTTGCGAATTGACTTCGCATAATGTTTTCTTACATAATCTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Annotation_U21_Trimmed_contig_11/133‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATTTGTAAGACCCTACACTATTGATTGTCAAAATTTTGTTCAGTTTTCAAAGGTCTACTATCGTTGTCATATCAACGTTGTTAGCGCTTTTGACAACTATTTAACTATATCATCGAGAGCAATTATTGTCA > Annotation_U21_Trimmed_contig_3/2‑133 | TGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAAGATCAAACTCTCATATTAAATGATGAGTC‑TTTTTCAAGCTCATTAATTGTTTGTTTTGCGAATTGACTTCGCATAATGTTTTCTTACATAATCTTGC < 2:2456745/134‑1TGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAAGATCAAACTCTCATATTAAATGATGAGTC‑TTTTTCAAGCTCATTAATTGTTTGTTTTGCGAATTGACTTCGCATAATGTTTTCTTACATAATCTTGC < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |