| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_2 | = 375970 | 0 (0.000) | 243 (0.480) | 58/258 | 2.9 | 100% | coding (5343/5343 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Predicted cell‑wall‑anchored protein SasA (LPXTG motif) |
| ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_7 | = 60419 | 0 (0.000) | coding (1/753 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Predicted cell‑wall‑anchored protein SasA (LPXTG motif) | |||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
GAGCGACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_7/60286‑60419 | gAGCGACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGag < 2:2774142/135‑2 (MQ=255)gAGCGACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGag < 1:2639109/135‑2 (MQ=255) cGACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGagtg < 2:955772/134‑4 (MQ=255) cGACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGagtg < 2:1596767/134‑4 (MQ=255) cGACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGagtg < 1:1004565/134‑4 (MQ=255) gACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGagtga > 2:2642748/1‑130 (MQ=255) gACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGagtga > 1:1340325/1‑130 (MQ=255) gACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGagtga > 1:1604066/1‑130 (MQ=255) aCTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGagtgact > 1:1622374/1‑129 (MQ=255) gAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGagtg < 1:355632/113‑4 (MQ=255) tGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGagtg > 2:1033269/1‑105 (MQ=255) ttCAGATGTACTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatc > 2:526887‑M2/1‑72 (MQ=255) ccgatGTCCTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccg > 1:955965‑M2/3‑70 (MQ=255) ccgatGTACTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccg > 1:1388544‑M2/3‑70 (MQ=255) ccgatGTACTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccg > 2:1362625‑M2/3‑70 (MQ=255) ccgatGTACTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccg > 2:2176725‑M2/3‑70 (MQ=255) cgaTGTACTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccga < 2:292724‑M2/134‑67 (MQ=255) gATGTACTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgac > 1:1687914‑M2/1‑68 (MQ=255) gATGTACTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgac < 2:2584329‑M2/135‑68 (MQ=255) gATGTACTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgac < 2:2656486‑M2/135‑68 (MQ=255) tgtACTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagatgaacggctatcagaca < 1:1694014‑M2/133‑69 (MQ=255) aCTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatcggatagagatgtcgaagctgaacggctat < 2:2285643‑M2/125‑63 (MQ=255) aCTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacata < 2:783893‑M2/133‑71 (MQ=255) aCTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgac > 1:30256‑M2/1‑63 (MQ=255) cTTACTGAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactc > 1:2780571‑M2/1‑62 (MQ=255) ttactgaatcaCTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactc < 1:2169035‑M2/129‑74 (MQ=255) ttactgaatcaCTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactc < 2:2675563‑M2/129‑74 (MQ=255) ttactgaatcaCTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactc < 1:457433‑M2/129‑74 (MQ=255) ttactgaatcaCTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggc < 2:2631153‑M2/115‑60 (MQ=255) ttactgaatcaCTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggc > 1:2631153‑M2/6‑61 (MQ=255) ttacggaatcaCTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactc < 1:1840152‑M2/129‑74 (MQ=255) ctgaaTCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcg > 1:2319653‑M2/3‑58 (MQ=255) ctgaaTCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcg > 2:1513277‑M2/3‑58 (MQ=255) gAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcga < 2:1440540‑M2/134‑79 (MQ=255) gAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcga < 2:2122363‑M2/134‑79 (MQ=255) gAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcga < 1:53906‑M2/134‑79 (MQ=255) gAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcga < 2:2414417‑M2/134‑79 (MQ=255) gAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcga < 2:1063689‑M2/134‑79 (MQ=255) gAATCACTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttg < 1:763669‑M2/64‑9 (MQ=255) aCTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctga > 2:472100‑M2/1‑51 (MQ=255) aCTCTTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggc < 1:2772124‑M2/110‑60 (MQ=255) ctctTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgag > 1:2649339‑M2/1‑50 (MQ=255) ctctTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgag > 1:1727184‑M2/1‑50 (MQ=255) ctctTTGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgag > 1:1095107‑M2/1‑50 (MQ=255) ctTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGag < 1:1070299/49‑2 (MQ=11) ctTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGag > 2:1070299/1‑48 (MQ=11) gAACTTGACTCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgag > 2:370572‑M2/1‑44 (MQ=255) gAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAgtgactcgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgag > 2:854372‑M2/1‑44 (MQ=255) gAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgag > 2:236213‑M2/1‑44 (MQ=255) gAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgag > 1:2384677‑M2/1‑44 (MQ=255) aCTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagtt < 2:134321‑M2/135‑94 (MQ=255) cTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagtt > 2:2442774‑M2/1‑41 (MQ=255) tGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcga > 2:2590401‑M2/1‑39 (MQ=255) aTCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgt < 1:1475751‑M2/135‑100 (MQ=255) aTCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccg < 2:1473852‑M2/101‑66 (MQ=255) tCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgt > 2:1903582‑M2/1‑35 (MQ=255) cTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcg > 2:2380415‑M2/1‑34 (MQ=255) cTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcg < 2:1210590‑M2/135‑102 (MQ=255) cTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcg < 1:1786285‑M2/135‑102 (MQ=255) cTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgat < 1:2235791‑M2/47‑14 (MQ=255) tGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcga > 1:1271000‑M2/1‑33 (MQ=255) gAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgat > 2:2384241‑M2/1‑32 (MQ=255) gAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgat > 2:1776850‑M2/1‑32 (MQ=255) tCGATGTTTATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagatgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactg > 2:1632362‑M2/1‑28 (MQ=255) tCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgatgttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactg > 1:831324‑M2/1‑28 (MQ=255) tCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactg > 2:2294495‑M2/1‑28 (MQ=255) tCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactg > 1:2576508‑M2/1‑28 (MQ=255) tCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactg > 2:786908‑M2/1‑28 (MQ=255) cGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactga < 1:555720‑M2/135‑109 (MQ=255) aTGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaat > 2:1747597‑M2/1‑25 (MQ=255) aTGTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaat > 1:1210590‑M2/1‑25 (MQ=255) gTTGATACTGAATCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatc > 1:702463‑M2/1‑23 (MQ=255) tACTGAATCAGATGTTGAatgactggtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagaggtcgaagttgaacggctatcagacatactcttcgaatctgagtatgagttcgatgtcgatactgaatcagatgt < 2:482270‑M2/135‑118 (MQ=255) tCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtg > 2:1982133‑M2/1‑11 (MQ=255) tCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtg > 2:2154961‑M2/1‑11 (MQ=255) tCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagt < 1:2706816‑M2/133‑123 (MQ=255) tCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagt < 2:2847470‑M2/133‑123 (MQ=255) tCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagt < 2:302691‑M2/133‑123 (MQ=255) tCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagt < 2:2054921‑M2/133‑123 (MQ=255) tCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagt < 2:620227‑M2/133‑123 (MQ=255) tCAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagt < 1:1149507‑M2/133‑123 (MQ=255) cAGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgac < 1:2204128‑M2/135‑126 (MQ=255) aGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatacttaatcagatgttgagtgact < 1:1028277‑M2/135‑127 (MQ=255) aGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgact > 1:1957367‑M2/1‑9 (MQ=255) aGATGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatcagatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactctacgaatctgagactgatttcgatgtcgagactgaatcagatgttgagagact < 2:2516928‑M2/135‑127 (MQ=255) tGTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgc < 2:347810‑M2/135‑130 (MQ=255) gTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgcc > 1:2726162‑M2/1‑5 (MQ=255) gTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttg > 1:848796‑M2/1‑5 (MQ=255) gTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttg > 1:2541100‑M2/1‑5 (MQ=255) gTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttg > 2:112321‑M2/1‑5 (MQ=255) gTTGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttg > 1:2171986‑M2/1‑5 (MQ=255) ttGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgccg < 1:2010847‑M2/135‑132 (MQ=255) ttGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgccg > 1:2104949‑M2/1‑4 (MQ=255) ttGAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgccg < 1:1743159‑M2/135‑132 (MQ=255) gAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgccgat > 1:2860965‑M2/1‑2 (MQ=255) gAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgccgat > 1:289560‑M2/1‑2 (MQ=255) gAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgccgat > 1:1905739‑M2/1‑2 (MQ=255) gAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgccgat > 1:1411607‑M2/1‑2 (MQ=255) gAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgccgat > 2:1506911‑M2/1‑2 (MQ=255) gAatgacttgtcgatgtactatccgaagttgaatccgatatagatgtcgaagttgaacggctatccgacatactcttcgaatctgagtctgagttcgatgtcgatactgaatcagatgttgagtgacttgccgat > 1:1468199‑M2/1‑2 (MQ=255) | GAGCGACTGTCCGATGTACTATCTGAAGTTGAATCGGAGACAGAGGTCGATGCCGAACGACTTTCTGACGTACTTATCGAATCACTCTTCGAACTTGAATCTGAATTCGATGTTGATACTGAATCAGATGTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_7/60286‑60419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |