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ctTGGTGCTACGATAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTAAATATGTTGTAGCAGCACTTCTTGGTGCTGTTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACttgt < 1:1650493‑M2/133‑1 (MQ=255) tTGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACttgtt < 2:1198045‑M2/134‑1 (MQ=255) tTGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACttgtt < 1:2234350‑M2/134‑1 (MQ=255) tTGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACttgtt > 1:1989596‑M2/2‑135 (MQ=255) tGGTGCTACGCTAGTTgcagcttgtgatgttactgcactacttgatggtgcaactgagcttgcagctgatgatacagctgaacttggtgctacgctagttacagcttgtgatgttactgcactgcttgcaggtgc > 1:2123583‑M2/1‑16 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACTTGTTG > Annotation_U21_Trimmed_contig_8/1‑135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |