| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 477 total aligned reads displayed.
CTTGAACCGACGACCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_3/367854‑367983 | cgacgaCCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaa < 1:771251‑M2/135‑13 (MQ=255) cgacgaCCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaa < 2:341433‑M2/135‑13 (MQ=255) gacCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaa > 1:1615484‑M2/1‑119 (MQ=255) acCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAATttttagacacaaaaaaa < 1:1753043‑M2/135‑18 (MQ=255) 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CTTGAACCGACGACCCCTTCCTTACCATGGAAGTGCTCTACCTAGCTGAGCTATAGTGGCATTTATCAACTAAGATAGTATATCATATTTATTTACGCTGTAAAACCAAAATATGCCATGTAGCTTAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_3/367854‑367983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |