| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | Annotation_U21_Trimmed_contig_1 | 47 | +CGCAGTGACATCACAAGCTGCAACTAGCGTAGCACCAAGTTCAGCTGTATCATCAGCTGCAAGCTCAGTTGCACCATCAAGTAG | coding (47/567 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_1 | = 47 | 114 (0.340) | coding (47/567 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
GTGTAGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Annotation_U21_Trimmed_contig_1/118‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACT‑‑‑‑‑‑ < Annotation_U21_Trimmed_contig_1/47‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGTAGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACTCTAGTTGC > 1:2849044/1‑135 TAGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCA < 1:2282321/134‑1 AGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTGGTGCTACGCTAGTTGCAGC > 2:733813/1‑135 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GTGTAGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Annotation_U21_Trimmed_contig_1/118‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACT‑‑‑‑‑‑ < Annotation_U21_Trimmed_contig_1/47‑1 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |