| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_1 | 1 = | 0 (0.000) | 197 (0.590) | 61/256 | 2.0 | 100% | coding (1/567 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_8 | 1 = | 0 (0.000) | coding (588/588 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
CAGCTGAACTAGTATGTGTAGCATATGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Annotation_U21_Trimmed_contig_1/133‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGCTACGCTAGTTACAGCTTGTGATGTTACTGCACTGCTTGCAGGTGCTACATATGTTGTAGCAGCACTACTTGGTGCTGGTGTTACTACAGTTTGAGCAGCTGCACTACTTGCTTGAACTGTAACTTGTT > Annotation_U21_Trimmed_contig_8/1‑134 CAGCTGAACTAGTTTGTGTAGCATTTGAAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGTTGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACAGCACTACTTGATGGTGCTACTGTGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTG < 2:2632617/135‑1CAGCTGAACTAGTATGTGTAGCATATGGAGGAGTTGTAGCAGCGCTTGATGGTGCTACACTAGTTACAGCTTGTGATGTTACCGCACTACTTGATGGTGCAACTGAGCTTGCAGCTGATGATACAGCTGAACTTG > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |