| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_11 | = 1711 | 0 (0.000) | 450 (0.410) +CTACTCTCAGAGCACGCGTATC |
70/212 | 0.1 | 73.9% | intergenic (+53/–) | rasttk_feature_creation_tool=RNA_reps_SSU_rRNA/– | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/– |
| ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_13 | 191 = | 383 (0.980) | noncoding (1/75 nt) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE | tRNA‑Ile‑GAT | |||||
Only 100 of 1713 total aligned reads displayed.
GTCTAAGGTGGGACAGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_11/1577‑1711 | gTCTAAGGTGGGACAGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGt < 1:2740925/135‑1 (MQ=255) aaGGTGGGACAGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGTttac > 1:1724593‑M2/1‑131 (MQ=255) aaGGTGGGACAGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGTctac < 1:1551730‑M1/135‑5 (MQ=255) aGGTGGGACAGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAATAAACGGAAACCCACACTATGTCAAAGTTTTGTTTAGTTTTGAGAGGTtta < 2:1629789‑M2/133‑4 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |