| Predicted mutation | ||||||
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| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| ? | AE015451_phaM1 | 5923418 = | 1 (0.000) | coding (3/1083 nt) | gcvT‑II CDS (aminomethyltransferase) | ||||||
Only 100 of 1020 total aligned reads displayed.
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AACACCAACCTCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTG < 1:6354758/137‑1 AACACCAACCTCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTG < 2:12917183/137‑1 AACACCAACCTCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTG > 1:707712/1‑137 CACCAACCTCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGAC < 1:15390587/137‑1 CCAACCTCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACAT < 2:10935351/137‑1 AACCTCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCC < 2:5572307/137‑1 CCTCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCCTC > 1:4903936/1‑137 TCACATGGGTTTCTCCTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCCT > 2:15691151/1‑137 TCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCCTCAG > 1:11006403/1‑137 TCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCCTCAG > 2:12096601/1‑137 TCACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCCTCAG > 1:4311856/1‑137 CACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCCTCAGT > 1:14262462/1‑137 CACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCCTCAGT < 1:13149002/137‑1 ACATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCCTCAGTG < 1:16979086/137‑1 AGGGATGCAGGCTTCCGACATGGAGTTGGCCAATGCCATCCTGGCCAAGAATGCGGTAGCCGAGTAACTGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCACCCGCGAAGCATCCAACACCAACCTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451_phaM1/5918701‑5918835‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATGGGTTT‑‑‑CTCCTTCCGGGCGTGGCGAAGCGGCGGCGGTCGATGACGTTGGGTCGTCAGCTTTTCTTGTTACTCACACCCGCCGCGCGAATGCCGCGCATTGTAGCCGCAAGGTCGCAAACTGACATCCTCAGTG > AE015451_phaM1/5923418‑5923553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |